1 BBIOSENSORYIOSENSORY Co toCo to jeje biosensor?biosensor? PPřřehled tehled téémat pmat přřednednášáškyky ZlepZlepššeneníí ooččekekáávanvanáá odod biosensorbiosensorůů HistorickHistorickáá východiskavýchodiska Informace oInformace o biosensorechbiosensorech Vlastnosti ideVlastnosti ideáálnlnííchch biosensorbiosensorůů SylabusSylabus 1. Definice1. Definice biosensorubiosensoru. Historický p. Historický přřehled. Charakteristiky ideehled. Charakteristiky ideáálnlnííhoho biosensorubiosensoru. Z. Záákladnkladníí mměřěřííccíí ppřříístupy.stupy. 2. Elektrochemick2. Elektrochemickéé biosensorybiosensory, enzymov, enzymovéé elektrody. Potenciometrickelektrody. Potenciometrickéé systsystéémy amy a ISFETyISFETy.. ReferenReferenččnníí elektrody. 3.elektrody. 3. AmperometrickAmperometrickéé mměřěřeneníí kyslkyslííku, peroxidu vodku, peroxidu vodííku a NADH,ku a NADH, biosensorybiosensory ss oxidoxidáázamizami aa dehydrogendehydrogenáázamizami.. 4.4. PPřřenosenos elektronelektronůů z enzymz enzymůů na elektrodu pomocna elektrodu pomocíí medimediáátortorůů.. KompozitnKompozitníí a organokovova organokovovéé molekuly. 5.Mmolekuly. 5.Měřěřeneníí impedance aimpedance a konduktometrickkonduktometrickéé biosensorybiosensory.. VoltametrickVoltametrickéé techniky.techniky. 6.6. SpektrofotometrickSpektrofotometrickéé,, fluorimetrickfluorimetrickéé aa chemiluminiscenchemiluminiscenččnníí sensorysensory, optick, optickáá vlvláákna. Optickkna. Optickéé biokatalytickbiokatalytickéé sensorysensory.. BioluminiscenceBioluminiscence.. 7.7. BiosensoryBiosensory pro detekci inhibitorpro detekci inhibitorůů. Recykla. Recyklaččnníí enzymovenzymovéé systsystéémy. Mikrobimy. Mikrobiáálnlníí, tk, tkááňňovovéé aa receptorovreceptorovéé sensory.sensory. 8. Afinitn8. Afinitníí biosensorybiosensory s neps nepřříímou detekcmou detekcíí pomocpomocíí znaznačček.ek. ImunosensoryImunosensory. 9. Hybridiza. 9. Hybridizaččnníí biosensorybiosensory pro stanovenpro stanoveníí nukleových kyselin a detekci sekvencnukleových kyselin a detekci sekvencíí oligonukleotidoligonukleotidůů.. 1010. P. Přříímméé optickoptickéé afinitnafinitníí sensorysensory.. VyuVyužžííttíí exponenciexponenciáálnlníí vlny a resonance povrchovýchvlny a resonance povrchových plasmonplasmonůů keke sledovsledováánníí bioafinitnbioafinitnííchch interakcinterakcíí v rev reáálnlnéé ččase. Integrovanase. Integrovanéé optickoptickéé systsystéémy, interferometry amy, interferometry a podobnpodobnéé techniky.techniky. 11. Imobilizace11. Imobilizace biomolekulbiomolekul ppřři konstrukcii konstrukci biosensorbiosensorůů. Membr. Membráánovnovéé techniky.techniky. ElektropolymeraceElektropolymerace.. 12. Aktivace povrchu12. Aktivace povrchu sensorsensorůů. Kovalentn. Kovalentníí vazbavazba biomolekulbiomolekul. 13. Miniaturizace a masov. 13. Miniaturizace a masováá produkceprodukce biosensorbiosensorůů. S. Síítotisk, litografie,totisk, litografie, biosensorybiosensory jako soujako souččáást integrovaných analytickýchst integrovaných analytických systsystéémmůů,, biobioččipy.ipy. 14. Komer14. Komerččnníí biosensorybiosensory. Perspektivy. Perspektivy biosensorbiosensorůů, oblasti uplatn, oblasti uplatněěnníí v medicv medicíínněě, potravin, potravináářřstvstvíí,, ochranochraněě žživotnivotníího prostho prostřřededíí, vojenstv, vojenstvíí.. 2 BiosensorBiosensor je analytický pje analytický přříístrojstroj převodník elektronická (transducer) jednotka biorekogniční vrstva analyt výstupní signál obsahujobsahujííccíí citlivý prvek biologickcitlivý prvek biologickéého pho půůvodu, který je buvodu, který je buďď sousouččááststíí nebo v tnebo v těěsnsnéém kontaktu s fyzikm kontaktu s fyzikáálnlněě--chemickýmchemickým ppřřevodnevodnííkem. Poskytuje prkem. Poskytuje průůbběžěžný elektronický signný elektronický signáál, kterýl, který je pje přříímomo úúmměěrný koncentraci jednrný koncentraci jednéé nebo nnebo něěkolika (skupiny)kolika (skupiny) chemických lchemických láátek ve vzorku .tek ve vzorku . BiorekogniBiorekogniččnníí slosložžkaka rozpoznrozpoznáávváá stanovovanou lstanovovanou láátku, kterou butku, kterou buďď:: specificky pspecificky přřememěňěňuje =uje = biokatalytickbiokatalytickáá reakcereakce:: enzym, organela, buenzym, organela, buňňka, tkka, tkááňň, org, orgáán, organismusn, organismus nebo specificky vnebo specificky váážže =e = bioafinitnbioafinitníí reakcereakce:: vazba protilvazba protiláátek s antigeny (tek s antigeny (haptenyhapteny)) hybridizace nukleových kyselinhybridizace nukleových kyselin vazbavazba ligandligandůů na receptoryna receptory interakce sacharidinterakce sacharidůů ss lektinylektiny 3 FyzikFyzikáálnlněě--chemický pchemický přřevodnevodnííkk ppřřevevááddíí biorekognbiorekogniiččnníí reakci na signreakci na signáál vhodný prol vhodný pro daldalšíší zpracovzpracováánníí, lze je rozd, lze je rozděělit do nlit do náásledujsledujííccííchch skupin:skupin: elektrochemickelektrochemickéé ((potenciometriepotenciometrie,, amperometrieamperometrie,, konduktometrie,konduktometrie, voltametrievoltametrie)) optickoptickéé (fotometrie,(fotometrie, fluorimetriefluorimetrie,, luminometrieluminometrie,, nelinenelineáárnrníí optikaoptika)) piezoelektrickpiezoelektrickéé a akusticka akustickéé elektromagnetickelektromagnetickéé kalorimetrickkalorimetrickéé nanomechanicknanomechanickéé HistorickHistorickáá východiskavýchodiska popoččáátek 20. stolettek 20. stoletíí: formulace koncepce: formulace koncepce redoxnredoxnííhoho potencipotenciáálu a prvnlu a prvníí mměřěřeneníí pHpH.. 1922:1922: HeyrovskHeyrovskééhoho objev polarografieobjev polarografie -- zlom na poli elektrochemiezlom na poli elektrochemie 1935: pokusy m1935: pokusy měřěřit koncentrace kyslit koncentrace kyslííku v biologických tekutinku v biologických tekutinááchch pomocpomocíí rturtuťťovovéé kapkovkapkovéé elektrody (elektrody (MMüüllerller aa BambergerBamberger)) 1938: m1938: měřěřeneníí spotspotřřeby kysleby kyslííkuku žživými organismyivými organismy -- sinice, kvasinky asinice, kvasinky a krevnkrevníí bubuňňky,ky, PeteringPetering aa DanielsDaniels); tyto pokusy vy); tyto pokusy vyžžadovaly pradovaly prááci seci se rtutrtutíí a poma poměěrnrněě komplikovanou polarografickou aparaturu.komplikovanou polarografickou aparaturu. 40. l40. lééta: vyuta: využžititíí katodickkatodickéé redukce kyslredukce kyslííku na uku na uššlechtilých kovechlechtilých kovech (Au,(Au, PtPt); hol); holéé elektrody velektrody vššak v biologickak v biologickéém materim materiáálu postupnlu postupněě ztrztráácely citlivost.cely citlivost. 4 SpolehlivSpolehlivéé mměřěřeneníí koncentrace Okoncentrace O22 1956: revolu1956: revoluččnníí zmzměěnu provedlnu provedl ClarkClark: p: přřededřřadil elektrodovadil elektrodovéémumu systsystéémumu membrmembráánu propustnou pronu propustnou pro plynyplyny, a tak elektrody (pracovn, a tak elektrody (pracovníí AuAu nebonebo PtPt katoda zatavenkatoda zatavenáá ve skle ave skle a AgAg//AgClAgCl referentnreferentníí) fyzik) fyzikáálnlněě izoloval od mizoloval od měřěřenenééhoho prostprostřřededíí.. Leland C. Clark, Jr. s první enzymovou elektrodou 1962: na symposiu1962: na symposiu NewNew YorkYork AcademyAcademy ofof SciencesSciences ClarkClark popsalpopsal jakjak „„ududěělat elektrochemicklat elektrochemickéé sensorysensory ((pHpH, polarografick, polarografickéé,, potenciometrickpotenciometrickéé nebonebo konduktometrickonduktometricéé) inteligentn) inteligentněějjšíšími pmi přřididáánníímm enzymových penzymových přřevodnevodnííkkůů uzavuzavřřených jako sendviených jako sendvičč v membrv membráánnááchch““ tento koncept ilustroval experimentem s glukosatento koncept ilustroval experimentem s glukosa oxidasouoxidasou zachycenou na povrchu kyslzachycenou na povrchu kyslííkovkovéé elektrody pomocelektrody pomocíí dialyzadialyzaččnníí membrmembráányny -- mměřěřený pokles koncentrace kyslený pokles koncentrace kyslííku bylku byl úúmměěrnýrný koncentraci glukkoncentraci glukóózyzy ClarkClark ss LyonsemLyonsem v publikaci poprvv publikaci poprvéé uvedli termuvedli termíín enzymovn enzymováá elektroda (elektroda (ččasto nesprasto nespráávnvněě ppřřipisovanýipisovaný UpdikoviUpdikovi aa HicksoviHicksovi , kte, kteřříí propracovali experimentpropracovali experimentáálnlníí detaily potdetaily potřřebnebnéé k zk zíískskáánníí funkfunkččnníí enzymovenzymovéé elektrody pro glukosu)elektrody pro glukosu) 5 50.50.--60. l60. lééta: prvnta: prvníí enzymovenzymovéé elektrodyelektrody 1969: potenciometrick1969: potenciometrickáá enzymovenzymováá elektroda (elektroda (GuilbaultGuilbault)) 1974: enzymový termistor (1974: enzymový termistor (MosbachMosbach)) 1975: komer1975: komerččnníí biosensorbiosensor pro glukosu (fa. YSI, Ohio)pro glukosu (fa. YSI, Ohio) 70. l70. lééta: objevuje se pojemta: objevuje se pojem „„biosensorbiosensor““ (byla snaha pou(byla snaha použžíítt ""bioprobebioprobe", tento n", tento náázev vzev vššak byl chrak byl chráánněěn).n). zavzavááddíí se pojemse pojem „„optodaoptoda““ propro sensorysensory na bna báázi optických vlzi optických vláákenken ((LubbersLubbers aa OpitzOpitz)) 1976: na trhu um1976: na trhu uměělý pankreaslý pankreas BiostatorBiostator (fa.(fa. MilesMiles),), biosensorbiosensor propro laktlaktáát (fa. Lat (fa. La RocheRoche)) 1982: pops1982: popsáánn implantovatelnýimplantovatelný glukosovýglukosový biosensorbiosensor –– jehlovjehlováá enzymovenzymováá elektroda (elektroda (SchichiriSchichiri)) výzkumvýzkum imunochemickýchimunochemických biosensorbiosensorůů ((imunosensoryimunosensory)) 1990: na trh uveden BIAcore (fa.1990: na trh uveden BIAcore (fa. PharmaciaPharmacia)) ~2000:~2000: nnáástup DNAstup DNA biobioččipipůů BiosensorBiosensor pro glukosupro glukosu dosud nejdosud nejúúspspěěššnněějjšíší biosensorbiosensor je zaloje založžen naen na ferrocenuferrocenu -- ppřřenaenaššeečči elektroni elektronůů zz oxidoreduktasoxidoreduktas nana elektrodu (fa.elektrodu (fa. MedisenseMedisense).). Levný osobnLevný osobníí biosensorbiosensor pro dompro domááccíí mměřěřeneníí krevnkrevníí glukosy diabetiky.glukosy diabetiky. 6 BiosensorBiosensory vy v BrnBrněě 19501950 -- zalozaložžena Katedra biochemie naena Katedra biochemie na PPřřFF MUMU 19701970 -- Prof.Prof. LumLumíírr MacholMacholáánn -- enzymovenzymovéé elektrody (inhibiceelektrody (inhibice tyrosinasytyrosinasy,, konduktometrickkonduktometrickéé mměřěřeneníí momoččoviny,oviny, diaminoxidasadiaminoxidasa)) 19901990 –– inhibiceinhibice cholinesterasycholinesterasy pro detekcipro detekci organofosforganofosfááttůů -- spoluprspolupráácece s arms armáádou (VTUO Brno)dou (VTUO Brno) 19931993 –– piezoelepiezoelekktrictrickkéé sensorsensoryy (prvn(prvníí experimenty s Prof.experimenty s Prof. MarcoMarco MascinimMascinim)) aa studiestudie afinitafinitnnííchch interainterakckcíí pomocpomocíí biosensorbiosensorůů 19951995 –– poupoužžíívváánníí ssíítotiskovýchtotiskových sensorsensorůů ((KrejKrejččíí EngineeringEngineering, dnes, dnes BVT Technologies)BVT Technologies) 19991999 –– mikrorammikroraméénkanka jako afinitnjako afinitníí sensorysensory (University v(University v MainzuMainzu aa JanovJanověě, Dr., Dr. RobertoRoberto RaiteriRaiteri)) ~~20022002 –– aktivity na poli elektrochemickýchaktivity na poli elektrochemických imunosensorimunosensorůů propro biologickbiologickáá agens (agens (F. tularensisF. tularensis)) BiosensorBiosensoryy vv BrnBrněě 20052005 –– ppřřesun do novesun do novééhoho kampusukampusu vv BrnBrněě -- BohunicBohunicííchch zpozpoččáátku v rtku v ráámci ILBIT (mci ILBIT (integratedintegrated laboratorieslaboratories ofof biomedicalbiomedical technologiestechnologies)) 20062006 –– inicioviniciováán výzkumn výzkum nanobiotechnologinanobiotechnologiíí -- pod Npod Náárodnrodníímm centrem pro výzkumcentrem pro výzkum biomolekulbiomolekul v souv souččasnosti aktivity realizovasnosti aktivity realizováány vny v:: -- A5 /A5 / ÚÚstav biochemiestav biochemie -- ppřřednednášášky a výukaky a výuka zamzaměřěřenenáá nana biosensorybiosensory,, „„traditradiččnní“í“ oblastioblasti výzkumuvýzkumu ((eleelekktrochemictrochemickkéé,, piezoelepiezoelekktrictrickkéé,, opticoptickkéé,, ……)) -- A4 /A4 / NNáárodnrodníí centrum pro výzkumcentrum pro výzkum biomolekulbiomolekul -- nanobiotechnologienanobiotechnologie –– AFMAFM NtegraNtegra Vita aVita a SolarisSolaris,, biointerakcebiointerakce –– BiacoreBiacore 30003000)) 7 BiosensorBiosensoryy v Brnv Brněě ppřříšíšttíí rokrok European Structural FundsEuropean Structural Funds -- regionregionáálnlníí podporapodpora Central European Technological Institute (CEITEC)Central European Technological Institute (CEITEC) -- hlavnhlavníí partnepartneřři MU a VUT ai MU a VUT a řřada dalada dalšíších brnch brněěnskýchnských institucinstitucíí -- nanašše skupina soue skupina souččááststíí programu 4programu 4 StrukturnStrukturníí biologiebiologie -- NanobiotechnologieNanobiotechnologie aa biointerakcebiointerakce VýzkumnVýzkumnáá skupinaskupina odbornodborníí pracovnpracovnííci:ci: JanJan PPřřibyl, Jiibyl, Jiřříí ŽŽeraveravííkk doktoranddoktorandii:: 1010 ZdenkaZdenka FohlerovFohlerováá, Milan J, Milan Jíílek, Zuzana Svozilovlek, Zuzana Svozilováá, Anton, Antoníínn HlavHlavááčček, Karel Lacinaek, Karel Lacina,, KateKateřřinaina FrnkovFrnkováá,, ŠáŠárka Novotnrka Novotnáá, Martin, Martin KKřříížž, David Kov, David Kováářř, Eva Kupsk, Eva Kupskáá magistermagisterššttíí studentstudentii:: 4 (dal4 (dalšíší ppřřijdou vijdou v řřííjnu)jnu) bakalbakaláářřššttíí studentsstudents:: 10 (10 (20102010 konkonččilo)ilo) zahranizahraniččnníí studenti:studenti: 4 (letos)4 (letos) 8 DostupnDostupnéé vybavenvybaveníí …… surface plasmon resonancesurface plasmon resonance -- Biacore 2000 and 3000,Biacore 2000 and 3000, SpreetaSpreeta SPMSPM -- AFMAFM NtegraNtegra Vita, SNOMVita, SNOM NtegraNtegra SolarisSolaris opticaloptical -- DAD spectrophotometer SCINCO, fiber optics spectrophotometerDAD spectrophotometer SCINCO, fiber optics spectrophotometer Ocean Optics,Ocean Optics, fluorimetricfluorimetric detectordetector AvantesAvantes, var. light sources,, var. light sources, multipurpose plate reader Synergy2 (abs /multipurpose plate reader Synergy2 (abs / fluofluo // lumilumi),), MultiscanMultiscan RCRC electrochemistryelectrochemistry –– 22 PalmSensPalmSens, 4, 4 EmStatsEmStats, EIS techniques, many single /, EIS techniques, many single / multimulti--channel amperometric detectorschannel amperometric detectors flowflow--through techniquesthrough techniques –– FIAlabFIAlab 3000, 23000, 2 autoinjectorsautoinjectors , 5 MP3 pumps,, 5 MP3 pumps, >1>155 miniperistalticminiperistaltic pumps, 4 electronic valves,pumps, 4 electronic valves, …… piezosensorspiezosensors -- 55 piezodetectorspiezodetectors, hi, hi--freq. impedance analyzerfreq. impedance analyzer microbial and mammalianmicrobial and mammalian cell culturescell cultures fluorescence microscopyfluorescence microscopy inin--house facilities:house facilities: NMR 600 MHz, MALDI TOF, ES MS, LC/MS, CE, CE/MS,NMR 600 MHz, MALDI TOF, ES MS, LC/MS, CE, CE/MS, CE on chipCE on chip,, HPLCsHPLCs,, FPLCsFPLCs,, crystalizationcrystalization, proteomics,, proteomics, biomolecularbiomolecular modellingmodelling, recombinant proteins,, recombinant proteins, microcalorimetrymicrocalorimetry,, RTRT--PCR,,PCR,, …… VýzkumnVýzkumnéé projektyprojekty electrochemical immunosensors for rapid detection of bioagents (electrochemical immunosensors for rapid detection of bioagents (FrancisellaFrancisella)) biosensor, detector, softwarebiosensor, detector, software –– Min. of Defense / MTIPMin. of Defense / MTIP piezoelectric biosensorspiezoelectric biosensors –– applicationsapplications –– bacteria, pesticides, clinical markers,bacteria, pesticides, clinical markers, glycatedglycated hemoglobin,hemoglobin, boronateboronate complexescomplexes detection of DNAdetection of DNA aductsaducts withwith benzo[benzo[aa]pyrene]pyrene (SPR, AFM,(SPR, AFM, nanoparticlesnanoparticles)) –– NPVIINPVII bioelectronicbioelectronic tongue for wine quality controltongue for wine quality control –– NPVIINPVII biosensors with mammalian cell culturesbiosensors with mammalian cell cultures –– adhesion, apoptosis, effect ofadhesion, apoptosis, effect of immunomodulatorsimmunomodulators (PZ, EIS)(PZ, EIS) combined studies of affinity and function ofcombined studies of affinity and function of biomoleculesbiomolecules –– simultaneoussimultaneous information on binding and enzyme activity ofinformation on binding and enzyme activity of bioconjugatesbioconjugates (PZ(PZ--elchemelchem., PZ., PZ-- optical)optical) –– Research Center (local)Research Center (local) biosensors forbiosensors for mycotoxinsmycotoxins –– feasibility studyfeasibility study –– Min. of IndustryMin. of Industry nanomechanicalnanomechanical biosensorsbiosensors –– microcantileversmicrocantilevers as transducers, effect of porousas transducers, effect of porous SiSi,, model study (model study (E. coliE. coli, albumin), albumin) –– NATONATO SfPPSfPP biosensors for pesticidesbiosensors for pesticides –– EU FP6 SSAEU FP6 SSA BioDetBioDet biomimeticbiomimetic sensorssensors –– EU FP7 IRSES BIOMIMICEU FP7 IRSES BIOMIMIC 9 ČČasopisyasopisy oo biosensorechbiosensorech BiosensorsBiosensors andand BioelectronicsBioelectronics –– vvššechny aspekty oboru, novechny aspekty oboru, novéé trendytrendy SensorsSensors andand ActuatorsActuators BB ChemicalChemical -- zejmzejmééna fyzikna fyzikáálnlněě--chemickchemickéé ppřřevodnevodnííkyky ElectroanalysisElectroanalysis // JournalJournal ofof ElectroanalyticalElectroanalytical ChemistryChemistry // BioelectrochemistryBioelectrochemistry andand BioenergeticsBioenergetics -- elektrochemickelektrochemickéé biosensorybiosensory AnalyticalAnalytical ChemistryChemistry // AnalyticaAnalytica ChimicaChimica Acta /Acta / AnalyticalAnalytical BiochemistryBiochemistry // AnalyticalAnalytical LettersLetters // AnalystAnalyst // TrendsTrends inin AnalyticalAnalytical ChemistryChemistry -- ččististěě analytickanalytickéé, mnoho, mnoho ččlláánknkůů oo biosensorechbiosensorech a jejich aplikaca jejich aplikacííchch EnzymeEnzyme andand MicrobialMicrobial TechnologyTechnology -- mikrobimikrobiáálnlníí sensorysensory JournalJournal ofof BiotechnologyBiotechnology -- aplikace paplikace přři biotechnologických procesechi biotechnologických procesech JournalJournal ofof ImmunologicalImmunological MethodsMethods –– imunochemickimunochemickéé sensorysensory LangmuirLangmuir // ThinThin SolidSolid FilmsFilms -- nněěkterkteréé aspekty imobilizaaspekty imobilizaččnníích postupch postupůů.. Knihy oKnihy o biosensorechbiosensorech MosbachMosbach K.K. ImmobilizedImmobilized EnzymesEnzymes andand CellsCells,, MethodsMethods inin EnzymologyEnzymology, Vol. 137,, Vol. 137, AcademicAcademic PressPress,, SanSan DiegoDiego, 1988., 1988. Turner A. P. F.,Turner A. P. F., KarubeKarube I.,I., WilsonWilson G. S.G. S. BiosensorsBiosensors: Fundamentals: Fundamentals andand ApplicationsApplications,, Oxford UniversityOxford University PressPress, Oxford, 1987., Oxford, 1987. CassCass A. E. G.A. E. G. BiosensorsBiosensors: A: A PracticalPractical ApproachApproach, IRL, IRL PressPress, Oxford, 1990., Oxford, 1990. SchellerScheller F., Schubert F.F., Schubert F. BiosensorsBiosensors,, ElsevierElsevier, Amsterdam, 1992., Amsterdam, 1992. BuerkBuerk D. G.D. G. BiosensorsBiosensors,, TheoryTheory andand ApplicationsApplications,, TechnomicTechnomic,, LancasterLancaster, 1993., 1993. BuckBuck R. P.,R. P., HatfieldHatfield W. E.,W. E., UmanaUmana M.,M., BowdenBowden E. F.E. F. BiosensorBiosensor Technology,Technology, FundamentalsFundamentals andand ApplicatiApplicati--onsons, M., M. DekkerDekker,, NewNew York, 1990.York, 1990. WiseWise D. L.D. L. BioinstrumentationBioinstrumentation:: ResearchResearch,, DevelopmentDevelopment andand ApplicationsApplications,, ButterworthButterworth, Boston, 1990., Boston, 1990. WiseWise D. L.D. L. BioinstrumentationBioinstrumentation andand BiosensorsBiosensors, M., M. DekkerDekker,, NewNew York, 1991.York, 1991. Blum L. J.,Blum L. J., CouletCoulet P. R.P. R. BiosensorsBiosensors:: PrinciplesPrinciples andand ApplicationsApplications, M., M. DekkerDekker,, NewNew York, 1991.York, 1991. Turner A. P. F.Turner A. P. F. AdvancesAdvances inin BiosensorsBiosensors, JAI, JAI PressPress, London, Vol. 1, 1991; Vol. 2, 1992;, London, Vol. 1, 1991; Vol. 2, 1992; Vol. 3, 1994.Vol. 3, 1994. SchellerScheller F.,F., SchmidSchmid R. D.R. D. BiosensorsBiosensors: Fundamentals, Technologies: Fundamentals, Technologies andand ApplicationsApplications,, GBFGBF MonographsMonographs 17, VCH,17, VCH, WeinheimWeinheim, 1992., 1992. WiseWise D. L.,D. L., LemuelLemuel B.B. BiosensorsBiosensors andand FiberopticsFiberoptics,, HumanaHumana,, CliftonClifton, 1991., 1991. AlcockAlcock S. J., Turner A. P. F. InS. J., Turner A. P. F. In VivoVivo ChemicalChemical SensorsSensors,, RecentRecent DevelopmentsDevelopments,, CranfieldCranfield PressPress,, BedfordBedford, 1993., 1993. Wagner G.,Wagner G., GuilbaultGuilbault G.G.G.G. FoodFood BiosensorBiosensor AnalysisAnalysis, M., M. DekkerDekker,, NewNew York, 1993.York, 1993. ScottScott D. A.D. A. BiosensorsBiosensors forfor FoodFood AnalysisAnalysis,, RoyalRoyal SocietySociety ofof ChemistryChemistry, London, 1996., London, 1996. 10 BiosensoryBiosensory nana internetuinternetu HypertextovHypertextový uý uččebnebníí text (HTML Help):text (HTML Help): http://orion.chemi.muni.cz/pskl/vyuka/Biosensory.chmhttp://orion.chemi.muni.cz/pskl/vyuka/Biosensory.chm Elektronický textElektronický text –– AcrobatAcrobat PDF:PDF: http://orion.chemi.muni.cz/pskl/vyuka/Biosensory.pdfhttp://orion.chemi.muni.cz/pskl/vyuka/Biosensory.pdf ZZáákladnkladníí pojmypojmy CitlivostCitlivost je koneje koneččnnáá ustustáálenlenáá zmzměěna výstupnna výstupníího signho signáálulu biosensorubiosensoru (S) v(S) v ddůůsledku zmsledku změěnyny koncentracekoncentrace analytuanalytu (c), tj.(c), tj. ∆∆S/S/∆∆c,c, nebonebo dSdS//dcdc. P. Přři provi prováádděěnníí kinetických mkinetických měřěřeneníí (sleduje se(sleduje se ččasovasováá zmzměěna signna signáálulu dSdS//dtdt) se) se citlivost vypocitlivost vypoččííttáá jakojako ∆∆((dSdS//dtdt)/)/∆∆c.c. KalibraceKalibrace spospoččíívváá ve vystavenve vystaveníí biosensorubiosensoru rrůůzným standardnzným standardníímm roztokroztokůům om o znznáámméé koncentracikoncentraci analytuanalytu. Kalibra. Kalibraččnníí body by mbody by měělyly uzavuzavíírat pracovnrat pracovníí oblastoblast biosensorubiosensoru, aby nebylo t, aby nebylo třřebaeba provprováádděět nespolehlivt nespolehlivéé extrapolace.extrapolace. pozadí přídavek analytu ustálený signál ∆S dS/dt čas Průběh měření s biosensory. S c ∆S/∆c oblast linearity limit detekce Kalibrační závislost 11 Limit detekceLimit detekce (LOD)(LOD) biosensorubiosensoru jeje nejninejnižžšíší stanovitelnstanovitelnáá koncentracekoncentrace analytuanalytu. Ide. Ideáálnlněě je dje dáán rozlin rozliššeneníímm mměřěřííccíího pho přříístroje, obvykle je vstroje, obvykle je vššakak zhorzhorššovováán vedlejn vedlejšíšími procesy. Promi procesy. Pro definici se poudefinici se použžíívváá velikostvelikost ššumu (N,umu (N, noisenoise) sign) signáálu a limit detekce se bere prolu a limit detekce se bere pro pompoměěrr S/NS/N == 33.. S = 3 N N analyt Stanovení limitu detekce • Signál pozadí (background) je signál v nepřítomnosti analytu, obvykle se odečítá od měřeného signálu: S = S(měřený) - S(pozadí). Někdy je výhodnější použít referentní koncentraci analytu a vůči ní vztáhnout měřený signál. Pro semilogaritmický případ dostaneme S/S(ref) = (měření-pozadí)/(reference-pozadí). • Dlouhodobá stabilita (drift) je podmíněna změnami citlivosti biosensoru v čase. Citlivost obvykle klesá, ale může i přechodně vzrůst (změna biovrstvy ztenčení, nabobtnání). Postupný pokles citlivosti může být vyvolán oxidaxí povrchu kovových elektrod, usazováním vrstev proteinů či jiných biomolekul (měření in vivo), otrava biovrstvy těžkými kovy. Skokové změny jsou vyvolány mechanickými vli-vy, mohou často uniknout pozornosti. • Selektivita (vliv interferencí). Odezva biosensoru by měla být vyvolána pouze přítomností stanovované látky. Prakticky je často nutné rušivé látky eliminovat (zře-dění, konverse na nerušící sloučeniny, předřazení selektivní bariéry) nebo jejich příspěvek na měřený signál paralelně určit jiným sensorem (diferenciální uspořádání). Rychlost odezvyRychlost odezvy je urje urččovováána zejmna zejmééna fyzikna fyzikáálnlníími vlastnostmimi vlastnostmi biosensorubiosensoru (velikost). Z(velikost). Záávisvisíí na rychlosti difna rychlosti difúúzeze analytuanalytu zz okolnokolnííhoho prostprostřřededíí kk povrchupovrchu biosensorubiosensoru aa ddáále pak vnitle pak vnitřřnníí difdifúúzzíí uvnituvnitřř systsystéémumu biosensoru.biosensoru. Doba odezvyDoba odezvy se obvykle urse obvykle urččuje jakouje jako ččas potas potřřebný kebný k dosadosažženeníí ururččititéé velikosti signvelikosti signáálu vlu v konekoneččnnéém ustm ustáálenlenéém stavu (tm stavu (t →→ ∞∞), nap), napřř.. ττ9595 propro dosadosažženeníí 95%.95%. TeplotnTeplotníí zzáávislostvislost ppřři mi měřěřeneníích sch s biosensorybiosensory ppůůsobsobíí jednak najednak na difdifúúznzníí jevy, jednak na probjevy, jednak na probííhajhajííccíí chemickchemickéé reakce. Proto sereakce. Proto se obvykle pracuje za isotermických podmobvykle pracuje za isotermických podmíínek, pounek, použžíívváá se vodnse vodníí cirkulujcirkulujííccíí termostat nebo vyhtermostat nebo vyhřříívaný kovovývaný kovový blok.blok. ŽŽivotnostivotnost biosensorubiosensoru jeje obykleobykle limitovlimitováána neslabna neslabšíším prvkem, com prvkem, cožž jeje biorekognibiorekogniččnníí ččáást. Pst. Přřitom je titom je třřeba odlieba odliššitit stabilitu pstabilitu přři skladovi skladováánníí ((shelfshelf lifelife) od) od operaoperaččnníí stabilitystability, kter, kteráá mmůžůže být ze být záávislvisláá na pona poččtu a druhutu a druhu analysovanýchanalysovaných vzorkvzorkůů. Pro dlouhodob. Pro dlouhodobéé ulouložženeníí biosensorubiosensoru jeje obecnobecněě vhodnvhodnáá ninižžšíší teplota (chladniteplota (chladniččka, mraznika, mrazniččka), z praktickka), z praktickééhoho hlediska je pohodlnhlediska je pohodlněějjšíší skladovskladováánníí v suchv suchéém stavu.m stavu. 12 PodmPodmíínky mnky měřěřeneníí ss biosensorybiosensory BiosensorBiosensor se nachse nacháázzíí ppřříímo vemo ve sledovansledovanéém prostm prostřřededíí ((řřeka, tkeka, tkááňň,, krevnkrevníí řřeeččiiššttěě,, fermentorfermentor, ...)., ...). JJehoeho ččinnostinnost byby nemneměěla okolnla okolníí prostprostřřededíí ovlivnitovlivnit -- vyvyččerperpáávváánníí analytuanalytu ddůůsledkem msledkem měřěřeneníí, ovlivn, ovlivněěnníí tokutoku jiných ljiných láátektek, ..., ... BiosensorBiosensor je umje umííststěěn ve vhodnn ve vhodnéé nnáádobce (dobce (ččasto opatasto opatřřenenáá vodnvodníímm plplášášttěěm prom pro temperacitemperaci aa magnemagne--tickýmtickým mmííchadlem). Nejprve se vychadlem). Nejprve se vyččkkáá ustavenustaveníí pozadpozadíí signsignáálu v plu v přříítomnostitomnosti pracovnpracovníího roztoku (ho roztoku (pufrpufr obsahujobsahujííccíí dle potdle potřřeby daleby dalšíší pomocnpomocnéé reagentyreagenty).). PPřřididáá sese vzorek a po ustvzorek a po ustáálenleníí se odese odeččtete signsignáál. Pl. Přříídavky vzorku lzedavky vzorku lze ččastoasto nněěkolikrkolikráát opakovat.t opakovat. Přímý kontakt se vzorkem S čas přídavky vzorků Měření v nádobce PodmPodmíínky mnky měřěřeneníí ss biosensorybiosensory BiosensorBiosensor je umje umííststěěn ve vhodnn ve vhodnéé prprůůtotoččnnéé cele. Jsou mocele. Jsou možžnnéé dva zpdva způůsobysoby ččinnosti. Systinnosti. Systéémem se nechmem se necháá ststřříídavdavěě protprotéékat zkat zóóna zna záákladnkladníího roztoku aho roztoku a zzóónyny vzorkvzorkuu (A). M(A). Měřěřený signený signáál je tedy vyvoll je tedy vyvoláán pn přříímo nemo neřřededěěnýmným vzorkem.vzorkem. PPřřii druhdruhéém zpm způůsobu systsobu systéémem neustmem neustáále protle protéékkáá pracovnpracovníí roztok, doroztok, do kterkteréého se nastho se nastřřikujikujíí vzorky (FIA,vzorky (FIA, flowflow injectioninjection analysisanalysis). P). Přřitom vitom vžždydy dojde k definovandojde k definovanéému namu nařřededěěnníí vzorku a signvzorku a signáál ml máá charakteristický tvarcharakteristický tvar ppííkkůů (B); vyhodnocuje se bu(B); vyhodnocuje se buďď jejich výjejich výšška nebo plocha. Prka nebo plocha. Průůtotoččnnáá uspouspořřááddáánníí umoumožňžňujujíí automatizovat mautomatizovat měřěřeneníí.. IN OUT A B průtočnácela s biosensorem čas S Průtočné měření s biosensory