Body

Bílkoviny - aminokyseliny

Pozn




20

a) Napište vzorec dipeptidu: např. (Lys-Glu     - další varianty)

 b) Napište všechny ionizované formy dipeptidu od pH 1 do pH 14 a disociačním rovnováhám přiřaďte
pK

údaje: (Glu: pK[1]=2,1, pK[2]=9,5, pK[3] = 4,1

           Lys: pK[1] = 2, 2; pK[2] = 9,2, pK[3] = 10,8)

 c) vypočítejte pI tohoto dipeptidu






15

Napište vzorce následujících aminokyselin – ca 4 z 20



Popište Edmanovu metodu sekvenace peptidů - rovnice



Co je primární (sekundární, terciární, kvarterní) struktura bílkoviny? Jak je stabilizována, jaké
síly – interakce  se uplatňují při jejím formování?



Popište Merrifieldovu metodu syntézy peptidů na pevné fázi!



Kterou reakcí obecně se dokazují a stanovují aminokyseliny?

Popište ji - nejlépe rovnicemi.



Popište ninhydrinovou reakci – rovnice, význam


10

Popište strukturní úrovně peptidů a bílkovin



Jaké jsou metody stanovení primární struktury bílkoviny



Zakreslete strukturu a-helixu (antiparalelního - paralelního b-skládaného listu) bílkoviny, včetně
vazeb, které strukturu stabilizují.



Jakým způsobem byste určili N-terminální aminokyselinu určitého peptidu?



Popište proces denaturace bílkovin, jaké faktory ji způsobují?



Jak ovlivňuje rozpustnost bílkoviny pH?





5

Co jsou to Ramachandranovy diagramy, k čemu slouží?



Co jsou to dihedrální (torsní) úhly u peptidů a jaký je jejich význam?



Co je to hydropatie u bílkovin, jak je tento parametr vyjadřován a jaký má význam.



Jaká je role hydrofobních interakcí ve struktuře bílkoviny a kde se uplatňují?