BIOCHEMIE I - SEMINÁŘ
Vyučující: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
Tel. 54949 3251, 3252
e-mail: bouchal@chemi.muni.cz
Ústav biochemie PřF MU
Kamenice 5, budova 05, místnost 208, 212

•
•Úvod
•Aminokyseliny
•Peptidy a bílkoviny
•Test 1
•Termodynamika enzymových reakcí
•Úvod do enzymové kinetiky
•Test 2
•Sacharidy
•Lipidy
•Úvod do metabolismu
•Test 3
•
•
•Opravné termíny zápočtu
•
PROGRAM SEMINÁŘE

•Elektronická skripta Úlohy z biochemie, V. Mikeš
•Prezentace
•      (IS MU: Studijní materiály/Učební materiály/Bouchal)
LITERATURA
•Účast ve výuce: povolena 1 neomluvená absence (nemoc – lékařské potvrzení na studijní oddělení =>
omluva)
•Testy (3), min. 50% z celkového počtu bodů => zápočet v řádném termínu
•Souhrnný test z učiva celého předmětu => zápočet v 1. (2.) opravném termínu
PODMÍNKY ZÍSKÁNÍ ZÁPOČTU

Prokaryota
PROKARYOTICKÁ BUŇKA


živoč
EUKARYOTICKÁ BUŇKA - ŽIVOČIŠNÁ


rostl
EUKARYOTICKÁ BUŇKA - ROSTLINNÁ


biol struktury
HIERARCHIE
BIOLOGICKÝCH
STRUKTUR

život



Oparin



složení Ecoli



Gly
Ala
Val
Leu
Ile
Trp
Phe
Tyr
Ser
Thr
Cys
Met
Asp
Glu
Asn
Gln
Lys
Arg
His
Pro
SeCys
C
H
C
H
2
H
3
C
H
3
C
PŘEHLED AMINOKYSELIN

jednopism AA
JEDNO- A TŘÍPÍSMENNÉ ZKRATY AMINOKYSELIN


•I. DISOCIACE KARBOXYLOVÉ SKUPINY A AMINOSKUPINY
•
•     pKa1                            pKa2
•
•         R‑CH‑COOH     Û        R‑CH‑COO‑   Û    R‑CH‑COO‑
•              ½                                   ½                             ½
•         NH3+                              NH3+                       NH2
•
•
•
•
II. DISOCIACE BOČNÍHO ŘETĚZCE
      pKa3
1. -R nedisociuje
2. -RH  Û -R‑ KYSELÉ AK:  protonovaná forma je nenabitá
3. -RH+Û -R BAZICKÉ AK: protonovaná forma je kladně nabitá
Typ disociace bočního řetězce a jeho náboj při daném pH lze rozlišit pouze na základě znalosti jeho
chemické struktury!!!
DISOCIACE AMINOKYSELIN

• AK pKa1      pKa2    pKa3=pKa bočního řetězce
•Ala 2.3         9.9
•Gly      2.4         9.8
•Phe     1.8         9.1
•Ser      2.1         9.2
•Val      2.3         9.6
•Asp     2.0 10.0       3.9 ‑COOH
•Glu      2.2         9.7         4.3 ‑COOH
•His      1.8         9.2         6.0 ‑imidazolium
•Cys     1.8 10.8         8.3 ‑SH
•Tyr      2.2         9.1      10.9 ‑fenol
•Lys      2.2         9.2      10.8 ‑NH3+
•Arg      1.8         9.0      12.5 ‑guanidinium
•Asn 2.0   8.8
•Gln 2.2   9.1
•Trp 2.4   9.4
•Leu 2.4   9.6
•Ile 2.3   9.6
•Met 2.3   9.2
•Thr 2.2   9.1
•Pro 2.0 10.6
DISOCIAČNÍ KONSTANTY AMINOKYSELIN

TITRAČNÍ KŘIVKA GLYCINU
titrgly


PŘEHLED
MONOSACHARIDŮ
sacharidy přehled

disacharidy
VYBRANÉ
DISACHARIDY

aldosy uzav cyklu
UZAVÍRÁNÍ CYKLU: ALDOSY


ketosy uzav cyklu
UZAVÍRÁNÍ CYKLU: KETOSY


VYBRANÉ
CHEMICKÉ VLASTNOSTI
MONOSACHARIDŮ
monosach chem vl

metabolismus souhrn
PŘEHLED AEROBNÍHO
METABOLISMU
3

NAD



FAD