Plán přednášek C7895 - Hmotnostní spektrometrie biomolekul pro rok 2013
Přednášky se konají v učebně 235A11 v úterý, 17:00 – 18:50; případné změny budou ohlášeny
předem. Plán přednášek je uveden v separátním souboru „Sylabus.docx“ a může být v průběhu
semestru upraven.
1. 24. 9. Úvod do hmotnostní spektrometrie. Stručná historie hmotnostní spektrometrie:
přehled metod a instrumentace. Základní koncepty MS (rozlišení, citlivost). Ionizační
metody a metody zavádění vzorku: Elektronová ionizace (EI).
2. 15. 10. Chemická ionizace (CI). Doutnavý výboj. Indukčně vázané plazma (ICP). Ionizace
rychlými atomy (FAB). Ionizace (SIMS). Fotoionizace (PI). Plazmová Desorpce (PD).
3. 22. 10. Laserová desorpce/ionizace (LDI). Laserová desorpce/ionizace za účasti matrice
(MALDI). Sprejové ionizace: Termosprej (TSI). Ionsprej (ISI). Elektrosprej (ESI). Desorpční
elektrosprej (DESI).
4. 29. 10. Analyzátory. Základy iontové optiky. Weinův Filtr. Energetické analyzátory (E).
Hmotnostní analyzátory. Magnetický sektor (B). Kvadrupólový filtr (Q). Iontová past (IT).
5. 5. 11. Lineární past (LT). Iontový cyklotron (FT-ICR-MS). Orbitrap. Elektrostatická past.
Simion: příklady. Animace.
6. 12. 11. Time-of-flight hmotnostní spektrometr (TOF MS). Metody zvýšení rozlišení TOF MS
(reflektor, zpožděná a ortogonální extrakce).
7. 19. 11. Kolizně indukovaná disociace (CID). Tandemová MS (MS/MS). Další možnosti
disociace (ECD, ETD, fragmentace ve zdroji a za zdrojem – ISD a PSD). Techniky TOF-TOF,
LIFT. Spektrometrie iontové mobility (IMS). Zobrazovací hmotnostní spektrometrie (MSI).
8. 26. 11. Detektory a detekční elektronika. Principy vakuové techniky. Spojení separace a
hmotnostní spektrometrie: instrumentace (on-line, off-line, čipy)
9. 3. 12. Biologické aplikace MS: proteomika. Separační techniky. Enzymatické štěpení
proteinů. Identifikace proteinů: mapování peptidů, sequence tag, accurate mass tag.
10. 10. 12. Aplikace: proteiny a peptidy. Izotopové značení. Metody ICAT a iTRAQ. Stanovení
sekvence. Post-translační modifikace.
11. 17. 12. Aplikace: Analýza S-S můstků. Proteiny. MS databáze. DNA, sacharidy, syntetické
polymery. Různé.
12. 7. 1. Konzultační novoroční besídka (s příklady otázek u zkoušek).