1
Procvičování 10
1. Naimportujte do R dataframy spe a env z excelového souboru dat09.xls ve studijních materiálech (cv09).
2. Vytvořte sekvenci celých čísel od -5 do 5 (vec). Pomocí smyčky vynásobte každou hodnotu vektoru vec -1 a výsledné hodnoty uspořádejte do vektoru resž.
3. Pomocí smyčky upravte hodnoty vektoru vec následovně: x2 — x.
4. Pomocí smyčky spočítejte kumulativní sumy vektoru vec. V základní instalaci R je funkce, která kumulativní sumy počítá. Najděte ji, na vektor vec použijte a výsledek porovnejte.
5. Pomocí smyčky spočítejte pro každou lokalitu dataframu spe, kolik druhů na ní bylo zaznamenáno.
6. Pomocí smyčky spočítejte pro každý druh dataframu spe jeho celkovou abundanci.
7. Pomocí smyčky zjistěte pro každý druh dataframu spe: počet nulových abundanci (počet lokalit, na kterých chyběl), minimální, mediánovou a maximální abundanci nenulových hodnot. Zjištěné hodnoty uspořádejte do matice spočtem řádků rovným počtu druhů a čtyřmi sloupci. Řádky i sloupce matice si rozumně pojmenujte.
8. Pro všechny druhy zaznamenané alespoň na třetině lokalit (9) zjistěte Adjusted R Squared lineárního modelu závislosti log(x + 1) abundance na Froudeho čísle. Použijte polynom druhého řádu:
ml<- lm(log.abundance ~ poly(froude,2))
Adjusted R Squared najdete v summary(ml), musíte jen přijít na to, jak si pro něj sáhnout.
9. Pro 10 druhů s nejvyšším Adjusted R Squared zobrazte bodový graf závislosti jeho log(x + 1) abundance na Froudeho čísle.