Analytická cytometrie - podzim 2014

Klubovna BFÚ

Úterý 16-18h


                                               Datum

                                             vyučující

                                             přednáška

                                               16.9.

                                           Karel Souček

Obecný úvod do průtokové cytometrie

– základní principy a historie

                                               23.9.

                                             AULA BFÚ

                                           Karel Souček

Principy průtokové cytometrie a sortrování

-fluorescence

-zdroje excitace, optické systémy a způsoby detekce fluorescence

                                               30.9.

                                           Karel Souček

Principy průtokové cytometrie a sortrování

-zpracování a kompenzace signálu

-vizualizace, analýza a softwarové zpracování dat

                                               7.10.

                                           Karel Souček

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- buněčná biologie (analýza nukleových kyselin, analýza buněčných funkcí)

                                              14.10.

                                           Karel Souček

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- cytogenetika

- hydrobiologie

- rostlinná biologie

- aplikace ve fyziologii a imunologii bezobratlých

                                              21.10.

                                      Alena Hyršlová Vaculová

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- buněčná biologie (metody průtokové cytometrie ve studiu buněčné smrti, princip a praktické
možnosti víceparametrových analýz)

                                               4.11.

                                            Eva Bártová


Principy digitální mikroskopie

- fluorescenční mikroskopie, konfokální mikroskopie, "temporally-resolved” digitální mikroskopie,
“time/frequency-resolved” digitální mikroskopie

Klinické a biologické aplikace digitální mikroskopie

- chromozómová a genová analýza

- analýza buněčných kompartment a metabolismu (pH, ionty)

- aplikace FRET a FRAP

                                              11.11.

                                           Lukáš Kubala

Aplikace průtokové cytometrie v klinické imunologii a hematologii

                                              18.11.

                                         Pavla Gajdušková

Biologické a klinické aplikace a analýza dat microarrays

- praktické příklady aplikací jednotlivých typů arrays v lékařské diagnostice a základním výzkumu

- analýza dat a konkrétních výstupů

                                              25.11.

                                         Pavla Gajdušková

Principy mikroarrays

- CGH, SNP, ChiP arrays

- expresní, genové a mutační arrays

RNA arrays

miRNA

                                               2.12.

                                           Karel Souček

Fluorescenční zobrazovací metody in vivo.

Praktická demonstrace vybraných přístrojů na BFÚ.

                                               9.12.

                                           Karel Souček

Prezentace studentů

                                              16.12.

                                           Karel Souček

Prezentace studentů






                        Analytická cytometrie – sylabus praktických cvičení

Vyučující: Karel Souček, Radek Fedr, Šárka Šimečková, Jan Remšík, Eva Sedlmaierová

Termín: bude upřesněn

                                              cvičení

    Základy obsluhy rutinního průtokového cytometru FACSCalibur. Nastavení, kalibrace, kontrola
                                             kvality.

        Základy obsluhy vysokorychlostního sorteru. Nastavení kalibrace, kontrola kvality.

  Analýza buněčného cyklu. Kultivace buněk, fixace, barvení, měření, separace, kontrola čistoty,
                                           analýza dat.

 Imunofenotypová analýza a separace. Kultivace buněk, značení, fixace, měření, separace, kontrola
                                       čistoty, analýza dat.

  Analýza exprese green fluorescent proteinu (GFP) a separace. Kultivace buněk, příprava vzorku,
                         měření, separace, kontrola čistoty, analýza dat.

                              Analýza dat – cvičení software FlowJo.