1
BIOCHEMIE II - SEMINÁŘ
Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
Ústav biochemie PřF MU
e-mail: bouchal@chemi.muni.cz
Tel. 54949 3251, 3252
Kamenice 5, budova A5, místnost 208, 212
Konzultace: po dohodě

2
1.Nukleové kyseliny: Nukleové báze, nukleotidy, primární struktura NK.
2.Replikace, transkripce, translace a proteosyntéza. Úvod do molekulární biologie
3.Test 1
4.Metabolismus a biosyntéza sacharidů: Glykolýza, glukoneogeneze, Coriho cyklus, pentosový cyklus
5.Metabolismus a biosyntéza lipidů: b-oxidace a biosyntéza mastných kyselin, fosfolipasy
6.Citrátový cyklus
7.Respirační řetězec
8.Test 2
9.Fotosyntéza
10.Bioenergetika redoxních reakcí
11.Metabolismus bílkovin a aminokyselin, močovinový cyklus a metabolismus dusíku. Biosyntéza
aminokyselin.
12.Test 3
•Opravné termíny zápočtu
1.
PROGRAM SEMINÁŘE

3
–Skripta Seminar 2.rtf Skripta Cvičení z biochemie, V. Mikeš
–(IS: Studijní materiály/Učební materiály)
–Biochemie II – seminář www.ppt
LITERATURA
•Účast ve výuce: max. 1 neomluvená absence (více absencí: jen nemoc – lékařské potvrzení, řeší se
individuálně)
•Testy (3), min. 50% z celkového počtu bodů => zápočet v řádném termínu
•Souhrnný test z učiva celého semestru => zápočet v 1. (2.) opravném termínu
PODMÍNKY ZÍSKÁNÍ ZÁPOČTU

4
PRIMÁRNÍ
STRUKTURA
NUKLEOVÝCH
KYSELIN
NK primstr1 NK primstr2
G

5
•Provede se štěpení před:
•G      (DMS/DT)
•G+A (H+/DT)
•C      (hydrazin, 5M NaCl)
•C+T (hydrazin)
•
•Příklad:
•   5´                     3´
•32P-TGTAGGAGCT
•
•Štěpení před G (DMS/DT) vede ke vzniku fragmentů:
•32P-TGTAGGAGCT
•32P-TGTAGGAGCT
•32P-TGTAGGAGCT
•32P-TGTAGGAGCT
•
•K jiným souborům fragmentů povedou štěpení před G+A, před C a před C+T.
•
•
•
•
•
MAXAM-GILBERTOVA METODA SEKVENOVÁNÍ
NUKLEOVÝCH KYSELIN

6
MAXAM-GILBERTOVA METODA SEKVENOVÁNÍ
NUKLEOVÝCH KYSELIN
DETEKCE FRAGMENTŮ SEPAROVANÝCH ELEKTROFORÉZOU
NA FOSFOIMAGERU
(detekce radioaktivity - vizualizovány jsou pouze 32P značené fragmenty)
G+A   G C+T   C
________________________________  start
____
____ ____
____ ____
____
____
____ ____
____
____
____
____ ____
____ ____
____ ____
____
____
____

Biochemie nukleových kyselin
7
umax29

Biochemie nukleových kyselin
8
umax30

Biochemie nukleových kyselin
GENETICKÝ KÓD mRNA U PROKARYOT


metabolismus souhrn
PŘEHLED AEROBNÍHO
METABOLISMU
3

11
NAD


12
FAD


cAMP



Metabolismus a biosyntéza sacharidů
glykolýza souhrn
GLYKOLÝZA – VARIANTY A BILANCE
4

Metabolismus a biosyntéza sacharidů
hexokinasa
glukosa-6-fosfát
fruktosa-6-fosfát
fruktosa-1,6-bisfosfát
dihydroxyaceton-
fosfát
glyceraldehyd-
fosfát
1,3-bisfosfoglycerát
3-fosfoglycerát
2-fosfoglycerát
pyruvát
fosfoenolpyruvát
C2H5OH + CO2
CO2 + H2O + ATP
fosfofruktokinasa
aldolasa
#
glyceraldehydfosfátdehydrogenasa
fosfoglycerátkinasa
fosfoglycerátmutasa
enolasa
pyruvátkinasa
glukosafosfát
isomerasa
anaerobní glykolýza,
mléčné kvašení
aerobní oxidace
laktát DH
GLYKOLÝZA – PRŮBĚH
anaerobní alkoholové
kvašení
#=triosafosfátisomerasa











5

Metabolismus a biosyntéza sacharidů
glyko vs glukoneo
GLYKOLÝZA
vs.
GLUKONEOGENEZE
6

Metabolismus a biosyntéza sacharidů
Coriho
CORIHO CYKLUS
7

pentosovy
PENTOSOVÝ
CYKLUS
8

CH3-CO-COO- pyruvát
CoA + NAD+
CO2 + NADH
oxidační
dekarboxylace
citrát-
synthasa
akonitasa
isocitrát DH
α-oxoglutarát DH
sukcinyl CoA
synthetasa
sukcinát DH
fumarát DH
malát DH
pyruvát DH
KREBSŮV CYKLUS
9

20
GLYOXYLÁTOVÁ DRÁHA
glyoxylat_dr

Metabolismus a biosyntéza lipidů
cholesterol
ŽLUČOVÉ KYSELINY A CHOLESTEROL
zluc kys
10

Metabolismus a biosyntéza lipidů
betaoxidace
β-OXIDACE MASTNÝCH
KYSELIN
11

Metabolismus a biosyntéza lipidů
biosynt mk
BIOSYNTÉZA MASTNÝCH
KYSELIN
12

Metabolismus a biosyntéza lipidů
betaox vs biosynt mk
ROZDÍLY MEZI β-OXIDACÍ A
BIOSYNTÉZOU MASTNÝCH
KYSELIN
13

Metabolismus a biosyntéza lipidů
fosfolipasy
ŠTĚPĚNÍ FOSFOLIPIDŮ: FOSFOLIPASY
14

Respirační řetězec
mal asp kyv
TRANSPORT ELEKTRONŮ DO MITOCHONDRIÁLNÍ MATRIX

Respirační řetězec
resp řet3 Tvorba ATP probíhá za katalýzy ATPasy díky gradientu [H+], vytvořenému komplexy I,IV a
CoQ
RESPIRAČNÍ ŘETĚZEC
18

Respirační řetězec
resp řet2
RESPIRAČNÍ ŘETĚZEC
19

Respirační řetězec
resp řet4
RESPIRAČNÍ ŘETĚZEC
20

Respirační řetězec
ATPasa
H+
RESPIRAČNÍ ŘETĚZEC – TVORBA ATP
ADP + Pi        ATP
21

Fotosyntéza
fotosynt1
FOTOSYNTÉZA: 1. SVĚTELNÁ FÁZE
PS 680
PS 680*
PS 700
PS 700*
chloroplast
22

Fotosyntéza
Calvinuv
FOTOSYNTÉZA:
2. TEMNOSTNÍ FÁZE=
CALVINŮV CYKLUS
(tvorba glukosy)
(->glukosa…)
23

Metabolismus bílkovin a aminokyselin
met aa1
METABOLISMUS AMINOKYSELIN
15

Metabolismus bílkovin a aminokyselin
met aa
METABOLISMUS AMINOKYSELIN (II)
16

moccykl
MOČOVINOVÝ CYKLUS
17