1 1 Metody chemického výzkumu Fluorescenční spektroskopie Fluorescence a další luminiscenční spektroskopie Doba života, kvantový výtěžek Intenzita fluorescence, zhášení a samozhášení Spektra excitační a emisní Spektrometr a postup měření Aplikace Spojení se separačními technikami Jan Preisler 2 Luminiscence Pro zájemce podrobněji: Petr Táborský, Jan Preisler Molekulová luminiscence St v 17:00 v učebně AK1 3 Molekulová luminiscenční spektroskopie • Luminiscence je jev, při kterém molekula absorbuje energii (např. ve formě fotonu) a následně ji vyzáří ve formě světla • Molekulová luminiscenční spektroskopie je významná analytická metoda (nízké detekční meze, selektivita) • Fluorofor ... skupina v molekule zodpovědná za luminiscenci se nazývá luminofor (fluorescence - fluorofor) 4 Klasifikace luminiscence ... podle zdroje excitační energie: • fotoluminiscence • chemiluminiscence • bioluminiscence • elektroluminiscence 5 Jablonského diagram v=3 v=2 v=1 v=0 S0 S2 S1 T1 ______ radiační přechody (s účastí fotonu) ............ neradiační přechody (bez účasti fotonu) absorpce absorpce vibrační relaxace vnější konverze fosforescence přechod mezi systémyvnitřní konverze fluorescence 6 Franck-Condonův princip • Zářivé přechody: přechod elektronu je podstatně rychlejší než pohyb jader • V okamžiku vybuzení má molekula v excitovaném stavu stejnou pozici a moment atomových jader jako ve stavu základním • Excitovaná molekula má vyšší energii, než základní uspořádání, do kterého molekula přechází dodatečně • K luminiscenci dochází ze základního uspořádání 2 7 Radiační (zářivá) deexcitace Fluorescence 1. Po absorpci záření přechází elektron na jednu z vibračních hladin stavu excitovaného stavu (S0Sn) 2. Vibrační relaxace a vnitřními konverze (přechody v rámci hladin S až na S1) 3. Zářivý přechod na jednu z vibračních hladin základního stavu (S1 S0) Fosforescence 1. Elektron přechází z nejnižší vibrační hladiny excitovaného stavu na tripletovou hladinu (S1T1) 2. Vibračními relaxacemi přechází na nejnižší hladinu T1 3. Zářivý přechod na jednu z vibračních hladin základního stavu (S0). Zakázaný přechod ... musí dojít ke změně spinu, aby byl dodržen Pauliho princip  nízká pravděpodobnost přechodu a delší čas vyhasínání. 8 Neradiační (nezářivá) deexcitace Vibrační relaxace Po excitaci na jednu z vibračních hladin (vn) excitovaného stavu (Sn) dochází postupně k přechodu na nižší vibrační hladiny téhož excitovaného stavu. Energie se rozptýlí v okolí (solvent). Vnitřní konverze Nezářivý přechod mezi stavy o stejné multiplicitě; typicky SnSn-1; pravděpodobnostvzrůstá při překryvu daných vibračních hladin obou stavů. Mezisystémový přechod Elektron může přejít do jedné z vibračních hladin tripletového stavu o podobné energii (ST1). Přímý přechod (S0T1) absorpcí fotonu je nepravděpodobný (nutná změna spinu). 9 Neradiační (nezářivá) deexcitace Vnější konverze Přenos energie do okolní – solvent, rozpuštěné látky, krystalová mřížka. Souvisí se zhášením fluorescence. 10 Časové relace Absorpce ~10-15 s (~perioda fotonu) Vibrační relaxace 10-11 – 10-10 s postupný přechod (Dv = 1), perioda vibračního pohybu ~10-13 s Vnitřní konverze ~10-12 s pravděpodobnost vzrůstá při překryvu vibračních hladin singletů Fluorescence 10-10 – 10-6 s obvykle z nulového vibračního pásu excitovaného singletu Vnější konverze energie předána okolí (solvent aj.) Fosforescence 10-4 – 104 s zakázaný přechod (změna stavu spinu) 11 0 2 4 6 450 500 550 600 650 Wavelength (nm) IF(a.u.) Emission Excitation Emisní a excitační spektra • Emisní spektrum závislost intenzity luminiscence na vlnové délce; lex=konst. • Excitační spektrum (aktivační, absorpční) závislost absorpce luminoforu (fluoroforu) na vlnové délce, lem=konst. (rhodamin B) 12 Emisní a excitační spektra Stokesův posun Rozdíl mezi vlnovými délkami emisního a excitačního maxima (nm). Antistokesův posun Ve vzácných případech může být emisni maximum při kratší vlnové délce než excitační maximum Nejvyšší výtěžek fluorescence: excitace při lex max Fluorescenční záření bývá posunuto k delším vlnovým délkám v důsledku ztráty části energie konverzemi U fosforescenčních spekter je posun k delším vlnovým délkám ještě výraznější; přechod T1S0 je spojen s menším rozdílem energie než přechod z S1S0 3 13 Emisní a excitační spektra Zrcadlové pravidlo emisní a excitační spektra organických látek mají podobný tvar, ale jsou zpravidla zrcadlově obrácené Vavilovův postulát Tvar emisního spektra není ovlivněn vlnovou délkou excitace a lze excitovat zářením s kteroukoli vlnovou délkou z excitačního spektra. Aditivita spekter 14 Zrcadlové pravidlo 15 Fluorescence a fosforescence 16 Aditivita spekter 17 Základní vztahy A = c x ε = log (Io/I) (Lambert-Beerův zákon) A – absorbance, c – koncentrace, ε – absorbční koeficient, x – tloušťka kyvety, Io – světelný tok dopadající na vzorek, I - světelný tok prošlý vzorkem IF = k f Io (1-10-cxε) IF – fluorescence (fotony/s), k – podíl emitovaných fotonů, které dorazí na detektor, f – výtěžek fluorescence IF ~ k f Io 2.3 c x ε zjednodušený vztah pro nízké koncentrace 18 Výtěžek luminiscence Kvantový výtěžek fk = Nem/Nabs = Iem/Iabs = Iem/(I0-I) fk  1 Energetický výtěžek fe = Eem/Eabs = hnem/hnex fe  fk (Stokesův posun) N počet fotonů za sekundu I světelný tok (emitovaný, absorbovaný) E energie n frekvence fotonu k rychlostní konstanty nradrad rad kk k    4 19 Stanovení kvantového výtěžku • fluorescenční standard musí mít absorpční a fluorescenční maximum blízké látce, jejíž kvantový výtěžek stanovujeme • fluorescenční standardy: – roztoky chinin bisulfát (250nm/450nm) naftalén (290nm/330nm) ovalén (342nm/482nm) fluorescein (488nm/503nm) rhodamin B (562nm/573nm) – hranoly x st st x stx A A I I  20 Vyhasínání luminiscence Úbytek fluorescence: -dIF/dt = kF IF Exponenciální průběh vyhasínání fluorescence: IF = IF0 e – t/ t Doba života (luminescence lifetime): t = 1/ kF ... doba potřebná k poklesu fluorescence na hodnotu IF(t=0)/e Časově rozlišená (time-resolved) luminiscence t IF IF e t 21 Časově rozlišená luminiscence Vyhodnocení • poločas vyhasínání luminiscence (luminescence life-time), t1/2 nebo t - pokles na ½ nebo 1/e počáteční intenzity, nejlépe z log závislosti • time-gated fluorescence (integrace signálu v definovaném iontervalu) – rozlišení mezi analyty s různou dobou vyhasínání 22 Struktura látek a luminiscence: typy luminiscenčních přechodů organické luminofory – typické luminiscenční přechody jsou hlavně: p→ p* p→ n* anorganické luminofory a) přechody mezi energetickými hladinami ligandu b) přechody mezi energetickými hladinami kovu (d-d, f-f) c) kov i ligand („charge transfer“ přechody) 23 Luminiscence organických molekul – obecná pravidla • podmínkou fotoluminiscence je absorbce • intenzita luminiscence a posun emise k vyšším vlnovým délkám roste s počtem konjugovaných aromatických kruhů (hyperchromní a bathochromní posun) • heteroatomy v aromatickém kruhu - vyšší intenzita luminiscence a posun emise k vyšším vlnovým délkám • heteroatomy mimo aromatický kruhu - vyšší intenzita luminiscence a posun emise k vyšším vlnovým délkám (ale méně, než u heteroatomů v arom. kruhu) • stabilizace molekuly do planární konfigurace přispívá k zvýšení intenzity luminiscence 24 Luminiscence organických molekul – obecná pravidla 1. Nasycené uhlovodíky (bez p či n e-) obvykle nefluoreskují 2. Nearomatické uhlovodíky s několika dvojnými vazbami fluoreskují zřídka. Sloučeniny s vysoce konjugovanými dvojnými vazbami, např. karoteny, vykazují fluorescenci 3. Aromatické uhlovodíky fluoreskují (p-p*). Pravděpodobnost fosforescence vzrůstá s výskytem n e- příp. substituentů. 4. Fosforescence podpořena v aromatických molekulách přítomností karbonylové skupiny nebo heteroatomů (n-p*). Výsledná zvýšená pravděpodobnost přechodu mezi systémy obvykle snižuje intenzitu fluorescence. 5. Substituenty na aromatikém kruhu ovlivňují hladinu nejnižšího excitovaného stavu a mohou dramaticky zvýšit kvantové výtěžky a emisní vlnové délky (červený, bathochromní posun). Donory e-, např –OH, zvyšují fluo. výtěžek, akceptory jej snižují. 5 25 Luminiscence organických molekul – obecná pravidla 6. Vliv vnitřního těžkého atomu – vliv halidových substituentů: podpora přechodů mezi systémy, ST. 7. S rostoucí velikostí a konjugovaností aromatického systému roste kvantový výtěžek fluorescence, klesá výtěžek fosforescence. 8. Luminiscence je typická pro molekuly s planární strukturou, které jsou charakteristické vysokou konjugací e- a slabými interakcemi s rozpouštědly. 9. Fluorescence z atomů kovů se obvykle vyskytuje v rigidních organometalických komplexech, samotný ligand nemusí fluoreskovat. Kromě přechodů v ligandech se na vzniku fluorescence mohou podílet d e- a f e- (prvky vzácných zemin). 26 Struktura a luminiscence 27 Fotolumioniscence aromatických látek 28 Substituce aromátů skupinami zvyšujícími konjugaci O O O OOH kumarin f= 0.0001 7-hydroxykumarin f= 0.5 vliv substituentů: CR3  CH3  SR  SH  NH2  OR  OH 29 Vliv některých substituentů 30 Vliv vnitřního těžkého atomu 6 31 Luminiscence – vliv prostředí Teplota obvykle snižuje luminiscenci v důsledku vyššího dynamického zhášení Solvent viskozita – vyšší viskozita = méně kolizí, zvýšení fluorescence polarita a schopnost tvorby H můstků ovlivňují povahu exc. stavu např pro p-p* je excitovaný stav obvykle polárnější a zvýšení polarity solventu snižuje energii exc. stavu více než energi stavu základního, což vede k červenému posunu fluorescence. U přechodu n-p* je tomu naopak. pH fluorescence protonované a neprotonované formy se mohou výrazně lišit mezi pKa excitovaném a základním stavu může být řádový rozdíl Vliv externího těžkého atomu zvýšení fosforescence podpořením přechodů mezi systémy 32 Zhášení luminiscence Jevy vedoucí k redukci intenzity luminiscence 1. statické zhášení - např. nefluorescenční komplex, energii absorbuje jiná část molekuly atd. 2. dynamické (kolizní) zhášení – srážka s molekulou zhášedla (např. solventu) 3. vnitřně-filtrační efekt (reabsorpce u molekul s malým Stokesovým posunem) 4. fotovybělování – degradace luminoforu vlivem světla, kterým excitujeme 5. koncentrační zhášení (nelinearita při vyšších koncentracích) 33 Instrumentace - fluorimetr Fluorimetr • měření celkové fluorescence • kvantitativní analýza • zdroj záření: lampa nebo laser (větší citlivost stanovení) • místo monochromátoru(ů) může být filtr Spektrofluorimetr • měření fluorescenčních (emisních a excitačních) spekter • zdroj záření: zpravidla lampa (možnost volby vlnové délky exc. záření) • možné další režimy (synchronní sken, časově závislá fluo aj.) 34 Měření fotoluminiscence Zdroj lampa (Xe, deuteriová, atd.), laser (různé typy), LED Excitační monochromátor (M1) výběr excitační vlnové délky, není nutný u laserového excitačního zdroje Emisní monochromátor (M2): výběr emisní vlnové délky Detektor: úhel nastavení detektoru je zpravidla 900. M1 Zdroj Vzorek M2Detektor 35 Instrumentace AMINCO- Bowman, Series 2 (AB-2) 36 Zdroje excitačního záření • Lampa • Laser • LED 7 37 Lampa Typ xenonová (200-1500nm, UV-Vis) deuteriová (185-370 nm, hlavně UV oblast) rtuťová výbojka (253.4 nm a 302.6 nm) Výhody zpravidla možnost výběru z velkého rozmezí vlnových délek a nízká cena Nevýhody slabý výkon (při vybrané vlnové délce) 38 Typické spektrum lampy 39 Laser Jako zdroje excitačního záření lze použít pulsní i kontinuální lasery Výhody vysoký výkon při dané vlnové délce koherence prostorové vlastnosti paprsku (zaostření, kompatibilita s mikrometodami) pulsní lasery pro studium časově závislé fluorescence Nevýhody rel. vysoká cena fixní excitační vlnová délka Laditelné lasery diskrétně a kontinuálně laditelné lasery 40 Běžné lasery 41 LED • light-emitting diodes • rozvoj CD, DVD, blue ray • běžné v IR a Vis, nyní i v UV • pro fluorimetrii vhodné UV a Vis LED • Vis: 450 - 800 • UV: 285 – 400 42 Monochromátory • Filtr • Hranol • Mřížka 8 43 Detektory Požadavky • vysoká citlivost • široký dynamický rozsah Fotonásobič (PMT) Charge-Coupled Device (CCD) Diode array (DA) 44 Instrumentace pro časově rozlišenou luminiscenci excitace zábleskovou lampou obvykle pro časy delší než desítky mikrosekund (nejčastěji Xe lampa) excitace pulsním laserem velmi krátké trvání pulsu femtosekundové lasery (Heisenbergův princip: Dt vs. Dn) 45 Srovnání absorpční a luminiscenční spektroskopie v oblasti UV-Vis Spektroskopie v oblasti UV-Vis A = c x ε = log(Io /I) Absorpční spektroskopie: měření poměru dvou světelných toků + přesnost (odolnost vůči změnám abs. hodnoty světelného toku Φo) - citlivost při (nepatrný rozdíl mezi Io/I při nízké koncentraci analytu) Luminiscenční spektroskopie F ~ k φ Io 2.3 c x ε Luminiscenční spektroskopie: měření vyzářené energie + vysoká citlivost při použití citlivého detektoru (i jednotlivé fotony) - přesnost (fluorescence je přímo úměrná ecitačnímu světelnému toku (Io); projevuje se u ní negativně kolísání excitačního zdroje 46 Další režimy spektrofluorimetru 3D spektra • emisní spektrum vs. excitační • emisní (resp. excitační spektrum) vs. čas • vyhasínaní luminescence vs. emisní spektrum Synchronní sken • Současný sken obou monochromátorů • Stokesův posun je konstantní • Stokesův posun není konstantní (jen speciální případy) 47 Příklad: synchronní sken Ref: E. Sikorska, T. Górecki, I. V. Khmelinskii, M. Sikorski and D. De Keukeleire, J. Inst. Brew. 110(4), 267– 275, 2004 48 Příklad 3D spektra: Luminiscence lanthanoidů Tb3+, Eu3+, Dy3+, Sm3+ a Gd3+ 9 49 Využití luminiscence v chemickém výzkumu • stanovení anorganických a organických sloučenin a biosloučenin • stanovení sloučenin s vlastní fluorescencí • stanovení anorganických iontů a prvků (tvorba chelátů s organickými činidly) • fluorimetrická indikace ekvivalenčního bodu (stanovení Ca2+, Ba2+, Sr2+ chelatometricky za přítomnosti fluorexonu) • fluorescenční acidobazické indikátory: naftylamin (pH 3.4 – 4.8), chininbissulfát (pH 3.0 – 5.0), akridin (pH 4.8 – 6.6) • oxidačně redukční fluorescence: Hg2+ oxiduje thiamin na thiochrom (fluoreskuje) • široká škála biologických aplikací: informace o kvantitě, struktuře, vzájemných interakcích a lokalizaci 50 Luminiscence lanthanoidů - příklad anorganické luminiscence 7F 5D1 0 Absorption Ligandfluorescence Phosphorescence Internal crossing Energy transferT1 1 S1 1 S0 „Anténový efekt“ – ligand absorbuje energii, která je převedena na centrální iont, který vyzáří kvantum energie Charakteristické rysy luminiscence lanthanoidů: • dlouhé časy vyhasínání • dlouhý Stokesův posun • ostré píky náležící energetickým přechodům mezi hladinami 51 Příklady stanovení anorganických iontů Stanovení Al 3+ fluorimetricky s alizarinem 52 Příklady stanovení anorganických iontů – fluorescence v pevné fázi • fluorescence UO2 2+ v taveninách (NaF, KF, LiF aj.) • luminiscence nosičů polovodičového typu v přítomnosti aktivátorů nosič: CaO, CaSO4, NaF, CaCO3 aktivátor: Sb, Bi, Tl, Sn, lanthanoidy 53 Příklady luminiscenčních stanovení – organické látky a biomolekuly s vlastní fluorescencí 54 Derivatizace Rhodamine B (c =1x10-12 mol.l-1) Rhodamin B (c =1x10-12 mol.l-1) Vnitřní (nativní) x vnější luminiscence - značky a sondy Molekuly bez vlastní (vnitřní, nativní, přirozené) luminiscence lze derivatizovat luminiscenčními značkami/sondami Detekce jednotlivých molekul a obsahu jednotlivých buněk „single molecule/cell detection“) 10 55 Výběr fluorescenčních značek Kritéria: spektrální vlastnosti (excitace, emise, kvantový výtěžek atd.) vazebné místo (-NH2, -SH skupina a další) podmínky reakce (pH, koncentrace...) další vlastnosti (acidobazicita, hydrofobicita ...) 56 Fluorescenční značky a sondy fluorescenční značky (fluorescent labels) nevlastní (extrinsic fluorescence) fluorofory, které se ke sledovaným biomolekulám (proteinům, peptidům, ligandům, oligonukleotidům a jiným) vážou kovalentní vazbou fluorescenční sondy (fluorescent probes) nevlastní fluorofory, které se ke sledované struktuře vážou nekovalentně a často přitom mění své fluorescenční vlastnosti Značky a sondy jsou velmi důležitými nástroji především v bioanalytice 57 Použití luminiscenčních značek • analytické stanovení (příp. v kombinaci se sep. metodou) • fluorescenční mikroskopie, značení buňek a tkání • fluorescenční in situ hybridizace (FISH) • měření vzdálenosti funkčních skupin (FRET) • průtoková cytometrie • fluorescenční „imunoassays“ 58 Výběr fluorescenční značky – spektrální vlastnosti 59 Výběr fluorescenční značky – spektrální vlastnosti RBITC 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3 450 500 550 600 650 λ [nm] IF[a.u.] Emise Excitace O OH O N + NCH3 CH3 CH3 CH3 N S N S Cl Analyt: peptidy, aminokyseliny, aminosloučeniny Nd:YAG (x2): 532 nm rhodaminB isothiokyanát Ar+: 488 nm fluorescein isothiokyanát 60 Fluorescenční značky • Klasifikace fluorescenčních značek podle vazebného místa biomolekuly: aminová skupina thiolová skupina další 11 61 Výběr fluorescenční značky – vazebná místa: amino-reaktivní značky sukcinimidyl estery (Rh6GSE) sulfonyl chloridy isothiokyanáty (FITC, RBITC) 62 Výběr fluorescenční značky dle vazebného místa: thiol-reaktivní značky 63 Fluorescenční imunoanalytické metody • Fluorescence Immuno Assay (FIA) • Fluorescence Polarization Immuno Assay (FPIA) • Time Resolved Fluorescence Immuno Assay (TR-FIA) • Elektroluminiscenční, chemiluminiscence a další • Enzymatické metody s luminiscenční detekcí • náhrada radioimuno technik s příchodem levných laserů a kvůli vyšší bezpečnosti • detekční limity obou metod jsou srovnatelné (až 10-12 g.l-1) 64 Fluorescenční sondy pro NK • Vizualizace a identifikace RNA a DNA • Různé principy interakce, např. „vmezeření“ barviva do šroubovice DNA (ethidium bromid) ethidium bromid akridinová oranž 65 Nativní fluorescence peptidů a proteinů V peptidech a proteinech fluoreskují zejména: W, Y a F. W fluoreskuje nejvíce, Y je nejpočetnější, W může zhášet Y. Excitace v oblasti UV, emise od 280 nm po 400 nm. Dále mohou fluoreskovat různé prostetické části proteinů (např. kofaktory), ale mohou také zhášet... tryptofan (W) O NH2 OH fenylalanin (F) O NH2OH OH tyrosin (Y) O NH2NH OH 66 Nativní fluorescence aminokyselin, proteinů a peptidů 0,00 0,50 1,00 1,50 2,00 2,50 3,00 3,50 4,00 4,50 5,00 5,50 6,00 6,50 7,00 270 290 310 330 350 370 390 410 430 450 470 l [nm] IF[a.u.] Trp Tyr Phe 0 7.0 Trp Tyr Phe lmax (nm) 348 303 282 ff 0.20 0.14 0.04 tf (ns) 2.6 3.6 6.4 Abs lmax (nm) 280 274 257 Abs emax 5600 1400 200 emax • ff 11 2 0.008 0,00 0,20 0,40 0,60 0,80 1,00 1,20 1,40 1,60 1,80 2,00 2,20 280 300 320 340 360 380 400 420 440 460 l [nm] IF[a.u.] Inhibitor trypsinu Ribonukleáza A Anhydráza uhličitá Myoglobin BSA Inzulin Cytochrom C 12 67 Nativní fluorescence peptidů a proteinů Unfolded (nesbalený): volná rotace, více kolizí, větší vliv polárnějšího solventu Folded (fixní konformace): méně kolizí, fluorescence je ovlivněna nepolárním jádrem proteinu Se zvyšující se polaritou prostředí (konformace, solvent) roste emisní maximum 68 Green Fluorescent Protein (GFP) Zeleně fluoreskující protein (GFP)- izolován z medúzy. Fluorescence pochází z konjugovaného systému vzniklého cyklizací vedlejšího řetězce proteinu a následnou oxidací sekvence Ser-Tyr-Gly. GFP má dva výrazné excitační pásy (kolem 395 a 475 nm) a maximum emise je 508 nm. V živém organismu je energie získána chemickou reakcí (chemiluminiscence). Po modifikaci DNA mohou produkovat GFP také jiné organismy (bakterie, mušky, savčí buňky...) 69 GFP, YFP a další... Proteiny s výraznou vlastní (vnitřní) fluorescencí jsou využívány: • neinvazivní fluorescenční „marker“ přímo v živých buňkách • sledování exprese genu • interakce protein-protein 70 Spojení separačních technik a fluorescence Kolonové i planární separační techniky - HPLC, CE, ITP, 2D GE aj. Laser výhodný jako zdroj excitačního záření zvláště pro on-column detekci u mikrokolonových sep. technik • LIF (laser induced fluorescence) • kompatibilita laserového paprsku s mikrokolonovými technikami - dostatečný světelný tok i při rel. malém výkonu laseru (~mW) - vyšší toky způsobují bělení • pro danou třídu analytů, resp. derivátů zvolen vhodný laser podle vlnové délky • jednoduchá sestava 71 Příklad: schema sestavy CE LIF detektorová vialka laser mikroskopový objektiv na posuvném držáku štěrbina zdroj vysokého napětí injekční vialka v karuselu skříň kapilára fotonásobiččočka filtry stínítko 72 Konstrukce CE LIF 13 73 Výběr luminiscenčního barviva – spektrální vlastnosti 74 CE LIF: velmi nízké detekční limity Analyt: Rhodamin B, c = 1x10-12 mol/l, excitace: 532 nm, 5 mW; emise: > 560 nm, kapilára: 50 mm i.d., 375 mm o.d., l = 30/37 cm, dávkování: U = 5 kV, ti = 10 s nebo Dh = 2cm, ti = 30s, separace: 0,02 mol/l fosfát v 10% MeOH, pH 10; U = 10 kV LOD ~ 2 x 10-13 mol/l ... ~102 molekul 40 60 80 100 120 140 160 180 200 0 20 40 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 260 t[s] I[a.u.] 7 75 -0.00005 -0.00003 -0.00001 0.00001 0.00003 0.00005 0.00007 0.00009 300 350 400 450 500 550 t (s) Absorbance,540nm LOD: srovnání s absorbanční detekcí Analyt: Rhodamin B, c = 1x10-5 mol/l (při obdobném dávkování) 76 Rhodamin B Rhodamin 6G Rhodamin 123 Separace rhodaminových barviv 77 -32600 -32400 -32200 -32000 -31800 -31600 -31400 -31200 0 100 200 300 400 500 600 700 800 t (s) Fluorescence(lib.jedn.) 1 2 3 4 Separace rhodaminových barviv Píky: 1, 2 - Rh 123, 3 - Rh 6G, 4 - Rh B 78 -32500 -32000 -31500 -31000 -30500 -30000 -29500 0 100 200 300 400 500 600 700 800 Fluorescence(lib.jedn.) -33000 -32500 -32000 -31500 -31000 -30500 -30000 0 100 200 300 400 500 600 700 800 t (s) Fluorescence(lib.jedn.) blank peptid * 14 Rodina proteinů AHP – rozsah fosforylace? To, J.P.,Kieber, J.J. Trends Plant Sci. 2008, 13, 85-92 Cytokininová signální dráha rostlin A. thaliana proteiny AHP (Arabidopsis Histidinephospho-transfer Proteins) AHP1-5 fungují jako proteiny HPt doména HPt s evolučně konzervovaným strukturním motivem XHQXKGSSXS Role fosforylace na His? 79 Fosfohistidin (pHis) SICKMANN, A; MEYER, HE. Analyst. 2005, 130, 9, s. 1263-1270. typ fosforylované prostředí aminokyseliny kyselé zásadité O-fosfáty fosfoserin stabilní nestabilní fosfothreonin stabilní nestabilní fosfotyrosin stabilní stabilní N-fosfáty fosfohistidin nestabilní stabilní fosfoaspartát nestabilní nestabilní fosfoglutamát nestabilní nestabilní acyl-fosfáty fosfoarginin nestabilní stabilní fosfolysin nestabilní stabilní S-fosfáty fosfocystein stabilní stabilní 80 • 2 izomery pHis • 6 % z celkového počtu fosfoproteinů ...nelze separovat 2D PAGE  CE-LIF • separace v nativním prostředí • specificita • fúzní proteiny AHP-GFP CE-LIF standardu GFP LOD [ng/ml] LOD [M] V [nl] Ref. 0,08 3,0.10-12 17 1 - 1,3.10-10 3 2 90 3.10-9 1,9 3 10 4.10-10 0,6 tato práce Δh = 3 cm, tinj = 5 s, U = 8 kV, 50 mM Tris se 50 mM NaCl, pH = 9,0 1. Craig, D. B.; Wong, J. C. Y.; Dovichi, N. J., Biomedical Chromatography 1997, 11 (4), 205-206. 2. Zhang, H. F.; Ma, L.; Liu, X.; Lu, Y. T., Journal of Chromatography B- Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences 2004, 804 (2), 413-420. 3. Korf, G. M.; Landers, J. P.; Okane, D. J., Analytical Biochemistry 1997, 251 (2), 210-218. 81 2,5 3 3,5 4 4,5 5 5,5 4 5 6 7 8 t [min] fluorescence[a.u.] 10 µg.ml-1 1 µg.ml-1 0,1 µg.ml-1 Elektroforegram standardu GFP CE-LIF 0,01 µg.ml-1 10 µg.ml-1 1 µg.ml-1 0,1 µg.ml-1 0,03 - 20 µg.ml-1 vždy v objemu 30 µl Western blot ~1,0 µg.ml-1 CE-LIF ~0,01 µg.ml-1 WB standardu GFP Western blot standardu GFP 82 LOD