Cvičení 3: Vícerozměrné t-testy Příklad na vícerozměrný jednovýběrový t-test Podle údajů na obalu má rybí konzerva obsahovat 55 g masa, 30 g zeleniny a 15 g oleje. Náhodně bylo vybráno 10 konzerv a v každé z nich byla zjištěna hmotnost masa (proměnná X1), hmotnost zeleniny (proměnná X2) a hmotnost oleje (proměnná X3). Získané údaje jsou uloženy v souboru rybi_konzervy.sta. Úkol 1.: Vypočtěte vektor výběrových průměrů M a výběrovou varianční matici S. Řešení: Výpočet vektoru M: Statistiky – Vícerozměrné průzkumné techniky – Hlavní komponenty & klasifikační analýza - Proměnné X1, X2, X3 – OK – OK – záložka Popisné statistiky Shrnutí popisných statistik Souhrn. statistiky (rybi_konzervy.sta) Proměnná Průměr Sm. Odch. X1 X2 X3 53,18000 0,576965 31,40000 1,675974 14,95000 0,447834 Výpočet matice S: Návrat do výsledky hlavních komponent – Kovarianční matice Kovariance (rybi_konzervy.sta) Proměnná X1 X2 X3 X1 X2 X3 0,332889 -0,408889 -0,032222 -0,408889 2,808889 0,307778 -0,032222 0,307778 0,200556 Komentář: Ve zkoumaných 10 konzervách je v průměru o něco méně masa a oleje než jsou deklarované hodnoty, zato více zeleniny. Dále vidíme, že s klesajícím podílem masa roste podíl zeleniny a podíl oleje. S rostoucím podílem zeleniny roste i podíl oleje. Největší variabilitu vykazuje zelenina, menší maso a nejmenší olej. Úkol 2.: Na hladině významnosti 0,05 testujte hypotézu, že proměnné X1, X2, X3 se řídí normálním rozložením. Vytvořte normální pravděpodobnostní grafy. Řešení: Grafy – 2D grafy – Normální pravděpodobnostní grafy – Proměnné X1, X2, X3 – OK zaškrtneme S-W test a Více grafů v jednom obrázku – OK Normální p-graf z X1 rybi_konzervy.sta 6v*10c X1 X2 X3 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 Pozorovaný kvantil -2,0 -1,5 -1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 Oček.normál.hodnoty X1: SW-W = 0,9033; p = 0,2380 X2: SW-W = 0,9138; p = 0,3079 X3: SW-W = 0,9165; p = 0,3283 Komentář: S-W test ani v jednom případě nezamítá hypotézu o normalitě dat na hladině významnosti 0,05. Rovněž tečky v N-P grafech leží v těsné blízkosti ideální přímky. Data budeme tedy považovat z realizace výběru z třírozměrného normálního rozložení. Úkol 3.: Na hladině významnosti 0,05 testujte hypotézu H0:           =           µ µ µ 15 30 55 3 2 1 proti alternativě H1:           ≠           µ µ µ 15 30 55 3 2 1 . Řešení: Statistiky – Základní statistiky a tabulky – t-test. samost. Vzorek – OK – Proměnné X1, X2, X3 – OK – záložka Možnosti – zvolíme Test průměrů vůči různým volitelným konstantám Specif. X1: 55, X2: 30, X3: 15 – OK – zaškrtneme Vícerozměrný test (Hotellingovo T2 ) – Výpočet Test průměrů vůči referenční konstantě (hodnotě) (rybi_konzervy.sta) T2(celé případy ChD)=103,532 F(3,7)=26,842 p<,00033 Proměnná Průměr Sm.odch. N Sm.chyba Referenční konstanta t SV p X1 X2 X3 53,18000 0,576965 10 0,182452 55,00000 -9,97520 9 0,000004 31,40000 1,675974 10 0,529990 30,00000 2,64156 9 0,026845 14,95000 0,447834 10 0,141618 15,00000 -0,35306 9 0,732169 Komentář: Testová statistika vícerozměrného jednovýběrového t-testu se realizuje hodnotou 26,842, odpovídající p-hodnota je 0,00033, tedy na hladině významnosti 0,05 považujeme za prokázané, že složení konzerv neodpovídá údajům na obalu. Úkol 4.: Zjistěte, vzhledem ke kterým složkám vektoru µ byla nulová hypotéza zamítnuta, tj. simultánně testujte H01: µ1 = 55, H02: µ2 = 30, H03: µ3 = 15 proti H11: µ1 ≠ 55, H12: µ2 ≠ 30, H13: µ3 ≠ 15. Řešení: Použijeme 3 jednovýběrové t-testy, kde hladinu významnosti α = 0,05 upravíme pomocí Bonferroniho korekce. H0j zamítneme na hladině významnosti α = 0,05, když vypočtená phodnota bude menší nebo rovna 017,0 3 05,0 čet testůpo == α . Podíváme-li se na tabulku uvedenou u úkolu 3, vidíme, že vícerozměrná hypotéza byla zamítnuta kvůli první složce, tj. kvůli podílu masa. U zeleniny a oleje se neprokázala odlišnost od deklarovaných hodnot. Příklad na vícerozměrný dvouvýběrový t-test V rámci předběžných úvah o způsobu zpracování tuhého komunálního odpadu byl analyzován obsah 24 náhodně vybraných kontejnerů umístěných v centrální zástavbě, která je vytápěna převážně dálkovým topením a obsah 28 náhodně vybraných kontejnerů ve smíšené zástavbě, kde se vedle dálkového topení hojně vyskytují i lokální topeniště. Byly zjišťovány hodnoty pěti proměnných: X1 … měrná hmotnost X2 … podíl hrubé frakce (zůstává v sítu s oky 40 mm) X3 … podíl jemné frakce (propadá sítem s oky 8 mm) X4 … vlhkost (v promile) X5 … výhřevnost (v kJ/kg) Výsledky analýz jsou uloženy v datovém souboru slozeni_komunalni_odpad.sta. Úkol 1.: Ve obou skupinách vypočtěte průměry a směrodatné odchylky proměnných X1, X2, X3, X4, X5. Vytvořte krabicové grafy proměnné Xi obou skupinách, i = 1, 2, 3, 4, 5. Řešení: Statistiky – Základní statistiky a tabulky – Popisné statistiky – OK – Proměnné X1, X2, X3, X4, X5 – OK – Anal. skupin – zaškrtneme Zapnuto a Sloučit tabulkové výsledky v jedné tabulce a zrušíme Výsledky za všech. skupiny – zadáme Skupin. proměnná ID – OK – Detailní výsledky – zrušíme Minimum a maximum – Výpočet Souhrnné výsledky Popisné statistiky (slozeni_komunalni_odpad.sta) Proměnná ID N platných Průměr Sm.odch. X1 X2 X3 X4 X5 X1 X2 X3 X4 X5 centralni zastavba 24 298,7500 53,0228 centralni zastavba 24 671,3750 102,0672 centralni zastavba 24 90,5000 58,8565 centralni zastavba 24 269,2083 59,3816 centralni zastavba 24 934,3333 206,9185 smisena zastavba 28 384,2857 68,8223 smisena zastavba 28 572,5714 110,6250 smisena zastavba 28 192,8571 83,7747 smisena zastavba 28 187,6429 59,6733 smisena zastavba 28 766,0357 148,0639 Komentář: Ve smíšené zástavbě je v průměru vyšší měrná hmotnost odpadu a vyšší podíl jemné frakce, u podílu hrubé frakce, výhřevnosti a vlhkosti je tomu naopak. Grafy – 2D grafy – Krabicové grafy – Typ grafu: Vícenásobný – Proměnné – Závisle proměnné X1 – Grupovací proměnná ID – Detaily – Střední bod – Průměr – v části Krabicový zvolíme Hodn.: SmCh, v části Svorka zvolíme Hodn.: SmCh, koeficient 1,96 Odlehlé hodnoty – Vypnuto – OK Tentýž postup zopakujeme pro proměnné X2, X3, X4, X5. Krabicový graf z X1 seskupený ID slozeni_komunalni_odpad.sta 6v*52c Průměr Průměr±SmCh Průměr±1,96*SmCh centralni zastavba smisena zastavba ID 260 280 300 320 340 360 380 400 420 X1 Krabicový graf z X2 seskupený ID slozeni_komunalni_odpad.sta 6v*52c Průměr Průměr±SmCh Průměr±1,96*SmCh centralni zastavba smisena zastavba ID 520 540 560 580 600 620 640 660 680 700 720 X2 Krabicový graf z X3 seskupený ID slozeni_komunalni_odpad.sta 6v*52c Průměr Průměr±SmCh Průměr±1,96*SmCh centralni zastavba smisena zastavba ID 60 80 100 120 140 160 180 200 220 240 X3 Krabicový graf z X4 seskupený ID slozeni_komunalni_odpad.sta 6v*52c Průměr Průměr±SmCh Průměr±1,96*SmCh centralni zastavba smisena zastavba ID 160 180 200 220 240 260 280 300 X4 Krabicový graf z X5 seskupený ID slozeni_komunalni_odpad.sta 6v*52c Průměr Průměr±SmCh Průměr±1,96*SmCh centralni zastavba smisena zastavba ID 650 700 750 800 850 900 950 1000 1050 X5 Úkol 2.: Na hladině významnosti 0,05 testujte hypotézu, že proměnné X1, X2, X3, X4, X5 se v obou skupinách řídí normálním rozložením. Řešení: Statistiky – Základní statistiky a tabulky – Tabulky četností – OK - X1, X2, X3, X4 – OK - Anal. skupin – zaškrtneme Zapnuto a Sloučit tabulkové výsledky v jedné tabulce a zrušíme Výsledky za všech. skupiny – zadáme Skupin. proměnná ID – OK – OK – záložka Normalita – zaškrtneme S-W test a zrušíme K-S test – Testy normality Souhrnné výsledky Testy normality (slozeni_komunalni_odpad.sta) Proměnná ID N max D Lilliefors p W p X1: merna hmotnost X2: podil hrube frakce X3: podil jemne frakce X4: vlhkost (v promile) X5: vyhrevnost (v kJ/kg) X1: merna hmotnost X2: podil hrube frakce X3: podil jemne frakce X4: vlhkost (v promile) X5: vyhrevnost (v kJ/kg) centralni zastavba 24 0,096522 p > .20 0,974771 0,783707 centralni zastavba 24 0,174723 p < ,10 0,924437 0,073260 centralni zastavba 24 0,136194 p > .20 0,927926 0,087624 centralni zastavba 24 0,149222 p < ,20 0,945015 0,210778 centralni zastavba 24 0,134568 p > .20 0,957839 0,396561 smisena zastavba 28 0,140229 p < ,15 0,945321 0,150917 smisena zastavba 28 0,130313 p > .20 0,954143 0,251352 smisena zastavba 28 0,149243 p < ,10 0,954354 0,254385 smisena zastavba 28 0,151968 p < ,10 0,937937 0,097953 smisena zastavba 28 0,160347 p < ,10 0,930071 0,061903 Komentář: Ani v jednom případě nebyla hypotéza o normalitě zamítnuta na hladině významnosti 0,05. Úkol 3.: Na hladině významnosti 0,05 testujte hypotézu, že varianční matice proměnných X1, X2, X3, X4, X5 jsou v obou skupinách shodné. Řešení: Statistiky – ANOVA – Jednofaktorová ANOVA – OK – Proměnné – Seznam závislých proměnných X1, X2, X3, X4, X5 - Kategor. nezávislá proměnná (faktor) ID – OK – OK – Více výsledků – záložka Předpoklady – Boxův M test Boxův M test (slozeni_komunalni_odpad.sta) Efekt: "ID" (Vypočteno pro všechny proměnné) Boxovo M Chí-kv. SV p Boxovo M 19,96967 17,82128 15 0,272178 Komentář: p-hodnota je 0,2722, což je větší než 0,05, tedy dále budeme varianční matice pro centrální zástavbu a pro smíšenou zástavbu považovat za shodné. Lze konstatovat, že důležité předpoklady vícerozměrného dvouvýběrového t-testu jsou splněny. Úkol 4.: Na hladině významnosti 0,05 testujte hypotézu, že vektory středních hodnoty proměnných X1, X2, X3, X4, X5 jsou v obou skupinách shodné. Řešení: Statistiky – Základní statistiky a tabulky – t-test, nezávislé, dle skupin – OK – Proměnné – Závisle proměnné X1, X2, X3, X4, X5, Grupovací proměnná ID – OK – na záložce Možnosti zaškrtneme Vícerozměrný test (Hotellingovo T2 ) – Výpočet t-testy; grupováno:ID (slozeni_komunalni_odpad.sta) Skup. 1: centralni zastavba; Skup. 2: smisena zastavba Hotellingovo 79,1167 F(5,46)=14,557 p<,00000 Proměnná Průměr centralni zastavba Průměr smisena zastavba t sv p Poč.plat centralni zastavba Poč.plat. smisena zastavba Sm.odch. centralni zastavba Sm.odch. smisena zastavba F-poměr Rozptyly p Rozptyly X1 X2 X3 X4 X5 298,7500 384,2857 -4,95502 50 0,000009 24 28 53,0228 68,8223 1,684743 0,207528 671,3750 572,5714 3,32653 50 0,001654 24 28 102,0672 110,6250 1,174718 0,699898 90,5000 192,8571 -5,01506 50 0,000007 24 28 58,8565 83,7747 2,025989 0,089454 269,2083 187,6429 4,92477 50 0,000010 24 28 59,3816 59,6733 1,009850 0,989295 934,3333 766,0357 3,40703 50 0,001304 24 28 206,9185 148,0639 1,952991 0,096578 Komentář: Testová statistika vícerozměrného dvouvýběrového t-testu nabývá hodnoty 14,557, odpovídající p-hodnota je velmi blízká 0, tedy na hladině významnosti 0,05 zamítáme hypotézu, že vektory středních hodnot proměnných X1, X2, X3, X4, X5 jsou v obou skupinách shodné. S rizikem omylu nejvýše 5 % jsme tedy prokázali, že mezi centrální zástavbou a smíšenou zástavbou existuje rozdíl z hlediska složení komunálního odpadu. Úkol 5.: Pomocí simultánních testů zjistěte, které složky vektorů středních hodnot proměnných X1, X2, X3, X4, X5 v centrální a smíšené zástavbě se liší na hladině významnosti 0,05. Řešení: Simultánní testy založené na statistice ( ) ( ) 2 j* 2 j2j121 j0 S MM n nn 2np 1pn T − ⋅⋅ − −− = STATISTICA neposkytuje. (V našem případě n = 52, p = 5, n1 = 24, n2 = 28, tedy ( ) 1300 30912 n nn 2np 1pn 21 =⋅ − −− .) S pomocí STATISTIKY však můžeme vypočítat vektory výběrových průměrů a směrodatných odchylek – viz tabulku v úkolu 4. V této tabulce ponecháme pouze proměnné obsahující průměry a směrodatné odchylky. Dále za poslední proměnnou vložíme dvě nové proměnné T0j a kvantil. Do Dlouhého jména proměnné T0j napíšeme: =(30912/13000)*(v1-v2)^2/((23*v3^2+27*v4^2)/50) Do Dlouhého jména proměnné kvantil napíšeme: =VF(0,95;5;46) t-testy; grupováno:ID (slozeni_komunalni_odpad.sta) Skup. 1: centralni zastavba; Skup. 2: smisena zastavba Hotellingovo 79,1167 F(5,46)=14,557 p<,00000 Proměnná Průměr centralni zastavba Průměr smisena zastavba Sm.odch. centralni zastavba Sm.odch. smisena zastavba T0j =(30912/13 kvantil =VF(0,95;5 X1 X2 X3 X4 X5 298,7500 384,2857 53,0228 68,8223 4,51761518 2,41735604 671,3750 572,5714 102,0672 110,6250 2,03610872 2,41735604 90,5000 192,8571 58,8565 83,7747 4,62775957 2,41735604 269,2083 187,6429 59,3816 59,6733 4,46261189 2,41735604 934,3333 766,0357 206,9185 148,0639 2,13584049 2,41735604 Komentář: Vidíme, že statistiky T01, T03 a T04 se realizují v kritickém oboru )∞= ;4174,2W . S rizikem omylu nejvýše 5 % jsme tedy prokázali, že centrální a smíšená zástavba se liší v měrné hmotnosti, podílu jemné frakce a vlhkosti komunálního odpadu.