Klasická cytogenetika
•Zatížena chybou, subjektivní
•Malý počet spočítaných buněk
http://article.sapub.org/image/10.5923.j.ijbe.20120205.04_001.gif
(Jahani and Kamaledin Setarehdan, 2012)

Příprava vzorku (živočišné buňky)
http://www.beckman.cz/Media/Default/Dokumenty/DNAXII_presentations/1310-Kubickova-Sortovani%20savci
ch%20chromozomu%20a%20jejich%20prakticke%20vyuziti.pdf

Barvení
•Etidium bromid
•
http://krauthammerlab.med.yale.edu/imagefinder/ImageDownloadService.svc?articleid=3431466&file=1014
2_2012_293_Fig2_HTML&size=LARGE
(Doležel et al., 2012)
http://www.web-books.com/MoBio/Free/images/Ch1C3.gif
http://www.web-books.com/MoBio/Free/images/Ch1C3.gif

Barvení
•Hoechst + Chromomycin
http://flowbook.denovosoftware.com/@api/deki/files/123/=Chapter_10_Figure_05.png?size=webview
http://flowbook.denovosoftware.com/@api/deki/files/123/=Chapter_10_Figure_05.png?size=webview

Rostlinné chromosomy
•Obtížná příprava neporušených chromozomů
•Polyploidie
•Stejný poměr A/T vs. G/C
•
(Doležel et al., 2004; upraveno)

FISHIS
•
(Giorgi et al., 2013; upraveno)

Využití I
•Rychlá tvorba karyotypu
•Detekce chromozomových abnormalit
(Carter et al., 1992)

Využití II
•Sortrování
•Chromozomově specifické DNA knihovny
•Chromozomové malovací sondy
•Sekvenování
•Identifikace proteinů vážících se k DNA
•Evoluční a fylogenetické studie

Literatura
•Jahani, S., Kamaledin Setarehdan, S., 2012. Centromere and Length Detection in Artificially
Straightened Highly Curved Human Chromosomes. Int. J. Biol. Eng. 2, 56–61.
•Doležel, J., Vrána, J., Šafář, J., Bartoš, J., Kubaláková, M., Šimková, H., 2012. Chromosomes in
the flow to simplify genome analysis. Funct. Integr. Genomics 12, 397–416.
•Ng, B.L., Carter, N.P., 2006. Factors affecting flow karyotype resolution. Cytometry A 69A,
1028–1036.
•Doležel, J., Kubaláková, M., Bartoš, J., Macas, J., 2004. Flow cytogenetics and plant genome
mapping. Chromosome Res. 12, 77–91.
•Giorgi, D., Farina, A., Grosso, V., Gennaro, A., Ceoloni, C., Lucretti, S., 2013. FISHIS:
Fluorescence In Situ Hybridization in Suspension and Chromosome Flow Sorting Made Easy. PLoS ONE 8,
e57994.
•Carter, N.P., Ferguson-Smith, M.A., Perryman, M.T., Telenius, H., Pelmear, A.H., Leversha, M.A.,
Glancy, M.T., Wood, S.L., Cook, K., Dyson, H.M., 1992. Reverse chromosome painting: a method for
the rapid analysis of aberrant chromosomes in clinical cytogenetics. J. Med. Genet. 29, 299–307.
•
•
•

Děkuji za pozornost
•
•
https://cdn2.vox-cdn.com/thumbor/WSisWpYQNGwRmDAcz8KPbIMNBUc=/0x52:1000x615/1600x900/cdn0.vox-cdn.c
om/assets/3289859/chromosome.png