C2115 Praktický úvod do superpočítání -1-
C2115
Praktický úvod do
superpočítání
Petr Kulhánek, Tomáš Bouchal
kulhanek@chemi.muni.cz
Národní centrum pro výzkum biomolekul, Přírodovědecká fakulta,
Masarykova univerzita, Kotlářská 2, CZ-61137 Brno
III. lekce
C2115 Praktický úvod do superpočítání -2Ubuntu
14.04.3
http://www.ubuntu.com/
 Instalace Ubuntu Server
VirtualBox, přístup přes ssh, instalace aplikací
C2115 Praktický úvod do superpočítání -3Virtualizace
- Hypervisor
Hardware
Hostitelský OS
Hypervisor
OS
1
OS
2
OS
3
Virtualizace jsou postupy a techniky, které umožňují k dostupným zdrojům přistupovat
jiným způsobem, než jakým fyzicky existují. Virtualizovat lze na různých úrovních, od
celého počítače (tzv. virtuální stroj), po jeho jednotlivé hardwarové komponenty (např.
virtuální procesory, virtuální paměť atd.), případně pouze softwarové prostředí
(virtualizace operačního systému).
zdroj: www.wikipedia.org
Hypervisor – správce virtuálního strojů
Hostující OS (ve virtuálním stroji)
VirtualBox
www.virtualbox.org
Podporovaný hostitelský OS:
MS Windows, Mac OS X, Linux
Licence: freeware + proprietární rozšíření pro
nekomerční použití
C2115 Praktický úvod do superpočítání -4POZORNĚ
ČTĚTE NÁSLEDUJÍCÍ ZADÁNÍ
C2115 Praktický úvod do superpočítání -5Cvičení
1
Nainstalujte Ubuntu Server 14.04.3 do virtuálního prostředí VirtualBox.
1. Stáhněte instalační obraz (ISO) pro Ubuntu Server 14.04.3 (64 bit verzi), pokud
vaše instalace nenabízí instalaci 64 bitové verze, stáhněte si 32 bit verzi. Instalční
obraz stahujte do vašeho scratch adresáře (/scratch/login_name) [cestu pro
ukládání lze změnit v nastavení Firefoxu].
2. Nastavení VirtualBoxu (File -> Preferences)
1. Default Machine Folder: změňte na podadresář (dle vaší volby) ve vašem
scratch adresáři (/scratch/login_name)
3. Vytvoření virtuálního stroje
1. Název stroje podle vašeho uvážení, Linux, Ubuntu 64/32 bit, další nastavení
ponechte na výchozích hodnotách.
2. Ověřte, že se vám virtuální disk vytvořil ve vašem scratch adresáři (Nastavení:
Storage, označit virtuální disk ze seznamu, ověřit cestu uvedenou v položce
"Location")
3. Pokud virtuální stroj nepodporuje hardwarovou akceleraci, je nutné
instalovat 32-bitovou verzi.
C2115 Praktický úvod do superpočítání -6Cvičení
1, pokračování
1. Nastavení virtuálního stroje
1. Network -> Attached to: NAT
2. Network -> Advanced -> Port Forwarding
1. Host Port: 2222
2. Guest Port: 22
3. Zbytek ponechat nezměněn
2. Spuštění virtuálního stroje
1. Volba instalačního media, zvolit instalační ISO obraz.
2. Při instalaci následujte pokyny na další straně.
C2115 Praktický úvod do superpočítání -7Stručné
pokyny pro instalaci
1. teritorium – Czech Republic (v Others -> Europe)
2. anglická klávesnice (US) – nepoužívejte autodetekci
3. jméno stroje - libovolný název (pouze písmena, bez diakritiky)
4. jméno uživatele – libovolné, přihlašovací jméno – STEJNÉ* jako na klastru WOLF, heslo
– nejlépe stejné jako na klastru WOLF (není podmínkou), pro zadávání hesla
nepoužívejte numerickou část klávesnice
5. nešifrujte domovský adresář
6. použijte celý disk bez LVM
7. nainstalujte OpenSSH server (volba se označuje klávesou Space), pokud se zapomene
zvolit, je možné později doinstalovat pomocí:
8. Grub instalovat do MBR (Master Boot Record) zařízení /dev/sda
Poznámka: grafické rozhraní je možné zprovoznit instalací balíčku ubuntu-desktop
(neděláme, je časově náročné a zvyšuje paměťové nároky virtuálního stroje)
$ sudo apt-get install openssh-server
* jinak si velmi zkomplikujete život
C2115 Praktický úvod do superpočítání -8Virtuální
síť
ssh vzdálený term. #2
(konsole)
ssh vzdálený term. #3
(konsole)
port 2222
ssh server
port 22
VirtualBox
NAT
Hostitelský stroj (wolfXX)
Obrazovka
lokální term. #1
Ubuntu server
virtuální stroj (ubuntu)
ID: ubuntu
ID: wolfXX
port
forwarding
ssh vzdálený term. #4
(konsole)
virtuální stroj může přistupovat
k venkovní síti přes NAT
k virtuálnímu stroji není
možné přistupovat přímo z
venkovní sítě
ssh server
port 22
ssh vzdálený term. #1
(konsole)
C2115 Praktický úvod do superpočítání -9Cvičení
2
1. Přihlaste se do běžící instance serveru přes grafické rozhraní virtualizačního prostředí.
2. Přihlaste se do běžící instance serveru pomocí programu ssh z hostitelského počítače.
Otevřete několik nezávislých sezení.
3. Příkazem w (nebo who) vypište seznam aktuálních sezení na virtuálním stroji.
ssh -p 2222 server_login@wolfXX
nebo
ssh -p 2222 server_login@localhost
verze s localhost se musí spouštět ze
stroje, na kterém běží váš virtuální
strojčást server_login@ se použije, pokud
jste si při instalaci vytvořili účet s
jiným přihlašovacím jménem (spojeni
server_login se nahradí vašim
přihlašovacím jménem)
C2115 Praktický úvod do superpočítání -10Cvičení
3
1. Nainstalujte program mc : $ sudo apt-get install mc
2. Vypněte server: $ sudo poweroff
3. Zapněte server.
4. Vytvořte snapshot virtuálního stroje (Machine->Take Snasphot ...)
5. Přihlaste se interaktivně jako superuživatel ($ sudo su -)
6. Co je to NAT?
instalace balíčku (aplikace) s názvem mc