Pokročilá chemoinformatika
•Úvod do QSAR/QSPR modelovaní
únor 2017

Deskriptor
•Jedná se se o “užitečné” číslo, které popisuje určitý aspekt struktury molekuly, toto číslo je
produktem matematického, logického nebo statitického výpočtu
•Z pohledu statistiky se jedná o nezávislou proměnnou nebo také regresorem
•Deskriptor = f(                 )
•
•V součastnosti známe přes 3300 deskriptorů

Deskriptor



Deskriptory – různý pohled na stejnou věc



Deskriptory – různý pohled na stejnou věc



Rozdělení deskriptorů
•Dle použité struktury
•0D,1D, 2D, 3D, 4D deskriptory
•Dle tématické skupiny
•Početní, topologické, QM, povrchové, …

0D, 1D, 2D a 3D deskriptory



4D deskriptory






Molekulový graf



Matice sousednosti



Matice vzdáleností



Další rozdělení deskriptorů









Software pro výpočet deskriptorů
•PaDEL – opensource (1444 1D, 2D descriptors and 431 3D descriptors)
•Dragon – komerční software (5270 molecular descriptors)
•

Výběr deskriptorů
•Manualní – dle intuice a korelací
•Poloautomatický
•Automatický – backward, forward nebo stepwise