Speciální metody analýzy mikroorganizmů II
doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta MU, 2017
Bartos.Milan@atlas.cz

Obsah přednášky I
1)Repetitorium metod analýzy mikroorganismů. Metody kultivační, metody nekultivační.
2)Amplifikační metody v molekulární diagnostice mikroorganismů. Amplifikace cílové sekvence DNA,
amplifikace sondy a signálu neseného sondou.
3)PCR v reálném čase. Detekce amplifikačních produktů v reálném čase. TaqMan sondy, hybridizační
sondy, vlásenkové sondy a molekulární majáčky.
4)Enzymy používané při manipulaci s nukleovými kyselinami. Restrikční mapy. Detekce polymorfismů v
genomech. Molekulárně typizační metody v mikrobiologii. DNA fingerprinty. Analýza proteinů a
proteinové fingerprinty.
5)Způsoby provedení hybridizace. Hybridizace v roztoku a na pevné fázi. Fluorescentní in situ
hybridizace. Využití metod hybridizace v analýze mikroorganismů.

Obsah přednášky II
7)Mikročipy, jejich konstrukce a jejich použití v mikrobiologii.
8)Různé způsoby sekvenování nukleových kyselin a analýza DNA sekvencí.
9)Techniky rekombinantní DNA a jejich význam při studiu mikroorganismů.
10)Příprava rekombinantních DNA molekul pro diagnostické účely. Sondy NK, jejich charakterizace a
použití. Značení a způsoby detekce sond.
11)Analýza mikrobiálních komunit – metagenomika.
12)Validace laboratorních mikrobiologických metod. Akreditace laboratoří.

Doporučená literatura
1)Persing  et al. (2016): Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd edition
MCj03701400000[1]
3)  Šmarda et al. (2005): Metody molekulární biologie, MU Brno
4)  Rolfs et al. (1992): PCR: Clinical Diagnostics and Research, Sringer-Verlag Berlin
5)  www.farmakogenomika.cz
1)
1)
2)   Brown (2007): Klonování genů a analýza DNA. Univerzita Palackého v Olomouci (1. české vydání,
překlad 5. vydání)

Kde najdete studijní materiály?
Pokud toto čtete, tak jste je našli
MCAN00610_0000[1]

Podmínky ke zkoušce
•Písemný test, zisk alespoň 60% bodů
•Ústní rozprava
Ptejte se mne na přednáškách,
u zkoušky se budu ptát já!

A sledujte novinky !
•www.osel.cz
logo_osel
•http://www.plospathogens.org/home.action
http://www.the-scientist.com/
tslogo