1	
  
Structural	
  Virology	
  
Lecture	
  6	
  
Pavel	
  Plevka	
  
©	
  2012	
  John	
  Wiley	
  &	
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  Ltd.	
  
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2	
  
©	
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  John	
  Wiley	
  &	
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3	
  
©	
  2012	
  John	
  Wiley	
  &	
  Sons	
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4	
  
5	
  
Parvoviruses	
  
6	
  
Parvoviruses	
  
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  Wiley	
  &	
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7	
  
©	
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  Wiley	
  &	
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8	
  
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  Wiley	
  &	
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9	
  
10	
  
11	
  
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  &	
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12	
  
13	
  
Minute	
  virus	
  of	
  mice	
  genome	
  
organizaLon	
  
14	
  
15	
  
Kozak’s	
  sequence:	
  
gccRccAUGG	
  
16	
  
17	
  
18	
  
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  2012	
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  Wiley	
  &	
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19	
  
•  give	
  examples	
  of	
  parvoviruses	
  and	
  explain	
  
their	
  importance;	
  	
  
•  describe	
  the	
  parvovirus	
  virion;	
  	
  
•  outline	
  the	
  main	
  features	
  of	
  the	
  parvovirus	
  	
  
•  genome;	
  	
  
•  describe	
  the	
  replicaLon	
  cycle	
  of	
  parvoviruses;	
  	
  
•  explain	
  the	
  difference	
  between	
  autonomous	
  
and	
  defecLve	
  parvoviruses.	
  	
  
Learning	
  outcomes	
  
20	
  
Reoviridae	
  
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21	
  
NSP4	
  induces:	
  
•  calcium	
  ion-­‐dependent	
  chloride	
  secreLon,	
  disrupts	
  SGLT1	
  transporter-­‐mediated	
  
reabsorpLon	
  of	
  water	
  
•  reduces	
  acLvity	
  of	
  brush-­‐border	
  membrane	
  and	
  possibly	
  limits	
  acLvity	
  of	
  enteric	
  
nervous	
  system	
  
22	
  
Reoviridae	
  
23	
  
24	
  
25	
  
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  Wiley	
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28	
  
29	
  
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30	
  
31	
  
32	
  
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  2012	
  John	
  Wiley	
  &	
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  Ltd.	
  
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33	
  
•  describe	
  the	
  rotavirus	
  virion;	
  	
  
•  discuss	
  the	
  main	
  events	
  of	
  the	
  rotavirus	
  
replicaLon	
  cycle;	
  	
  
•  explain	
  how	
  rotaviruses	
  cause	
  disease.	
  	
  
Learning	
  outcomes	
  
34	
  
Picornaviruses	
  
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  Wiley	
  &	
  Sons	
  Ltd.	
  
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35	
  
36	
  
FMDV	
  
37	
  
	
  Rhinoviruses	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  	
  
	
  –	
  40%	
  of	
  common	
  cold	
  cases	
  
	
  –	
  economic	
  losses	
  $16bn/year	
  in	
  USA	
  &	
  EU	
  
McMinn	
  et	
  al.	
  Clin	
  Infect	
  Dis	
  2001.	
  Image	
  by	
  Heng	
  Soy,	
  KI	
  Media	
  2012.	
  
Human	
  picornaviruses	
  
	
  Enteroviruses	
  (EV71)	
  
	
  –	
  hand-­‐foot-­‐and-­‐mouth-­‐disease	
  
	
  –	
  encephaliLs	
  	
  	
  
	
  
39	
  
Picornavirus	
  virion	
  
Plevka	
  et	
  al.	
  Science	
  2012.	
  
41	
  
42	
  
Picornavirus	
  genome	
  organizaLon	
  
©	
  2012	
  John	
  Wiley	
  &	
  Sons	
  Ltd.	
  
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43	
  
1.	
  Genome	
  delivery	
  into	
  cytoplasm	
  
Rossmann	
  Prot	
  Sci,	
  1994	
  	
  
Pocket	
  factor	
  in	
  EV71	
  
Smith	
  TJ,	
  et	
  al.	
  Science,	
  1986	
  
InhibiLon	
  of	
  EV71	
  by	
  WIN	
  51711	
  
Plevka	
  et	
  al.	
  PNAS	
  2013	
  
52	
  
53	
  
54	
  
Virion	
  assembly	
  
Knipe	
  et	
  al.	
  Fields	
  Virology,	
  2007	
  
4.	
  Virion	
  assembly	
  mechanism	
  
Genome	
  packaging	
  into	
  
pre-­‐formed	
  capsids	
  
Capsid	
  assembly	
  around	
  
condensed	
  genome	
  
57	
  
©	
  2012	
  John	
  Wiley	
  &	
  Sons	
  Ltd.	
  
www.wiley.com/college/carter	
  
58	
  
59	
  
60	
  
©	
  2012	
  John	
  Wiley	
  &	
  Sons	
  Ltd.	
  
www.wiley.com/college/carter	
  
61	
  
•  give	
  examples	
  of	
  picornaviruses	
  and	
  explain	
  their	
  
importance;	
  	
  
•  describe	
  the	
  picornavirus	
  virion;	
  	
  
•  describe	
  the	
  picornavirus	
  replicaLon	
  cycle;	
  	
  
•  discuss	
  picornavirus	
  recombinaLon;	
  	
  
•  describe	
  experimental	
  systems	
  used	
  for	
  picor-­‐	
  
navirus	
  studies.	
  	
  
Learning	
  outcomes