Autor: RNDr. Horáková, CSc. 2018/2019 doc. Mgr. M. Vítězová, Ph.D. ÚEB Oddělení mikrobiologie Mikrobi a člověk jsou dvě extrémní formy jedné živé hmoty. Život na této planetě se obejde bez lidí, nikoliv však bez mikrobů. Adolf Branald Doporučená literatura Miroslav Němec, Dana Horáková Základy mikrobiologie ISBN: 80-210-2060-1 Miroslav Němec, Dagmar Matoulková Základy obecné mikrobiologie ISBN: 978-80-210-7923-6 Doporučená literatura Miroslav Votava Lékařská mikrobiologie obecná ISBN: 80-86850-00-5 Ludmila Šilhánková Mikrobiologie pro potravináře a biotechnology ISBN: 978-80-200-1703-1 Doporučená literatura Stanislav Rozsypal Obecná bakterologie Jiří Schindler Ze života bakterií ISBN: 978-80-200-1666-9 Doporučená literatura Joanne M. Willey Prescott's Microbiology ISBN: 0073402400, 978-0073402406 Michael T. Madigan Brock Biology of Microorganisms, Global Edition ISBN: 1292068310, 9781292068312 Organizace výuky a pravidla závěrečného hodnocení • Výuka 2 h týdně – přednáška • Studentům budou ve Studijních materiálech k dispozici přednášky v pdf • Ke zkoušce doporučuji:  studium z uvedené povinné a doporučené literatury  studium z poznámek z přednášek • Zkouška písemná, test 30 otázek (odpovědi „multi choice“ a slovní odpovědi) • Minimální počet bodů pro úspěšné ukončení: 17 Mikroorganizmy jsou tak malé… Mohou být opravdu důležité? • Původci onemocnění • Zemědělství • Potravinářský průmysl • Výroba energie • Bioremediace • Biotechnologie 10 nejvýznamnějších příčin úmrtí – vývoj v průběhu století Zdroj: United States National Center for Health Statistics Chřipka a zánět plic Tuberkulóza Chřipka a zánět plic Onemocnění žaludku Onemocnění srdce Infarkt Onemocnění ledvin Onemocnění plic Onemocnění srdce Rakovina Nehody Dětské nemoci Záškrt Rakovina Mozková mrtvice Nehody Sebevražda Cirhóza jater Vražda AIDS Cukrovka Případů úmrtí na 100 tis. obyvatelPřípadů úmrtí na 100 tis. obyvatel Historie mikrobiologie Robert Hooke (1635-1703) První pozorování buňky ASM News 54: 183-185 (1665) „Hookův" mikroskop Plíseň rostoucí na kůži Vynález mikroskopu Zacharias Janssen - holandský výrobce brýlí Popularizace mikroskopu a jeho využití Anton van Leeuwenhoek (1632-1723) Replika jednoduchého mikroskopu k pozorování živých organizmů (zvětšení až 200x) První pozorování živých organizmů obchodník s textilem v holandském Delftu, člen městské rady, dvorní zeměměřič Leeuwenhoekovy kresby Kresby bakterií v dopise pro londýnskou Royal Society z roku 1683 Pozoroval mikroflóru v biofilmu na vlastních zubech Mikroorganizmy označil jako „little animalcules“ V 17. století byly mikroorgnaizmy považovány za „kuriozity přírody“, původ onemocnění byl přisuzován magii Leeuwenhoekovy preparáty Řez očním nervem býka Bakterie Spirillum pozoroval v kalné vodě v r. 1674 • Pozoroval pod mikroskopem např. vlasy, spermie, vlastní výkaly • Kresby prvoků, mikromycet a řas Carl Linné (1707-1778) švédský botanik Carolus Linnaeus Hierarchie Binomická nomenklatura Rostliny a živočichové Nomenklatura organizmů v knize Systema Naturae, 1735 Francesco Redi • První experiment v historii biologie v r. 1670 • Série vzorků masa v miskách zakrytých krajkou nebo korkem (ochrana před hmyzem) • Závěr: maso neprodukuje larvy bez přítomnosti hmyzu, který na něj naklade vajíčka • Popírá Aristotelovu teorii samoplození (400 před n.l.) Edward Jenner (1749 – 1823) britský lékař vakcinace proti pravým neštovicím (1798) „otec imunologie“ osmiletý James Phipps Louis Pasteur (1822-1895) • Mikroorganizmy jsou příčinou nemocí • Fermentace • Pasteurace Kniha o pivu Kniha o vínu „otec mikrobiologie“ Slavný Pasteurův experiment s lahví s labutím hrdlem (1854) 1857 studium fermentace 1860 původce choroby bource morušového (Nosema bombycis) 1862 vyvrácení teorie samoplození mikroorganizmů (živé organizmy mají původ v neživé hmotě) 1864 příčinou přeměny vína v ocet je mikroorganizmus „Mycoderma ceti“, v množení se jí zabrání zahřátím (pasteurace) 1864 – 1876 příčinou etanolového, mléčného a máselného kvašení jsou živé mikroorganizmy, nikoliv „fermenty“ (vs. Liebig) 1879 studium cholery drůbeže (Pasteurella) a imunity slepic 1881 vyvinul vakcínu proti sněti slezinné (veřejný pokus: ovce) 1882 sérum proti vzteklině vyzkoušeno na zvířatech 1885 sérum proti vzteklině vyzkoušeno na člověku Louis Pasteur Louis Pasteur - život bez kyslíku u mikroorganizmů Louis Pasteur - mikroorganizmy jsou zodpovědné za kvasné procesy, efektivita aerobního metabolizmu (1857) 1847 - ve vídeňské porodnici zavedl dezinfekci rukou mezi vyšetřeními (a po pitvách) vymýcení horečky omladnic (poporodní sepse způsobené bakteriemi) Pozn.: neprokázal agens způsobující onemocnění, přestože si všiml shody příznaků u zemřelého lékaře a ženy po porodu, nikdy nenechal vzorky mikroskopovat Sherwin B. Nuland Špinavé ruce Mikrobi, horečka omladnic a podivuhodný příběh Ignáce Semmelweise nakladatelství Dokořán Překlad Marta Jakešová ISBN 80-7363-002-8 Ignaz Filip Semmelweiss (1818-1865) Streptococcus pyogenes Zdroj: Wikimedia Joseph Lister – aseptické metody v chirurgii (1864) Robert Koch (1843-1910) německý lékař a mikrobiolog zakladatel bakteriologie • Potvrdil Pasteurovu teorii o mikroorganizmech jako původcích nemocí („germ theory“) • Zavedl metodiku kultivace čistých kultur 1876 kultivace původce sněti slezinné (Bacillus anthracis) - počátky vědeckého výzkumu nakažlivých nemocí 1877 barvení mikrobů anilinovými barvami 1877 společně s Tyndallem: zničení spor bacilů je možné jen zahřátím na teplotu >100oC nebo opakovaným varem 1882 společně s Hessem: příprava tuhých médií (želatina, agar) pro izolaci a kultivaci mikrobů 1882 objev původce tuberkulózy (Mycobacterium tuberculosis, 'BK') [Nobelova cena 1905] 1883 objev původce cholery (Vibrio cholerae), Egypt Robert Koch Od roku 1982 se 24. březen připomíná jako Světový den tuberkulózy. Robert Koch: Etiologie anthraxu (1876) Kochovy mikrofotografie kultur Bacillus anthracis Kožní léze způsobené anthraxem Zdroj: Bravata, DM; Holty, JE; Liu, H; McDonald, KM; Olshen, RA; Owens, DK (2006):Systematic review: a century of inhalational anthrax cases from 1900 to 2005. Annals of Internal Medicine 144 (4): 270–80. Bioterorismus – použití biologických agens za účelem smrti nebo vyvolání onemocnění populací Zdroj: textbookofbacteriology.net zvětšení 1000x Vibrio cholerae - 1883 Fotografie: elektronový mikroskop, Leodotia Pope, Department of Microbiology, University of Texas, USA Kochovy postuláty (1876) 1. Z nemocného jedince musí být mikrob opakovaně izolován, nesmí se vyskytovat ve zdravém jedinci 2. Mikrob musí být izolován v čisté kultuře 3. Po naočkování čisté kultury vnímavému zvířeti se musí vyvinout typické onemocnění 4. Z tohoto zvířete musí být izolován tentýž mikrob Kochovy postuláty - animace Robert Koch - objev původce tuberkulózy (1882) Bakterie ve sputu pacienta Řez plicním uzlíkem Mycobacterium tuberculosis Koch a Hess - zavedení pevných půd pro kultivaci mikroorganizmů (1882) Z historie mikrobiologie 1877 - SCHLOESING, MÜNTZ: nitrifikace půdy je dílem mikroorganizmů 1878 - SÉDILLOT: prvé použití termínu 'mikrob' 1879 - NEISSER: objev původce kapavky (Neisseria gonorrhoeae) 1879 - HANSEN: objev původce malomocenství Mycobacterium leprae) 1880 - EBERTH: objev původce břišního tyfu (Salmonella typhi) 1882 - LÖFFLER, SCHÜTZ: objev původců červenky a vozhřivky 1883 - KLEBS: tyčinkovité bakterie v hrdle nemocných záškrtem 1884 - MEČNIKOV: fagocytóza mikroorganizmů 1884 - LICHTHEIM: patogenita houby Absidia corymbifera u člověka 1884 - LÖFFLER: kultivace původce záškrtu (Corynebacterium diphtheriae) v koagulovaném séru s bujonem a glukózou 1884 - GAFFKY: izolace a kultivace Salmonella typhi - viz 1880 1884 - NICOLAIER: mikroskopický průkaz původce tetanu 1884 - ESCHERICH: izolace Bacterium coli (dnes Escherichia coli) 1884 - GRAM: diferenciační barvení bakterií Hans Christian Joachim Gram Barvení bakterií dle Grama - 1884 Sergej Vinogradskij (1856-1953) • ruský mikrobiolog • člen Petrohradské akademie věd, Francouzské akademie věd, Královské společnosti v Londýně • studoval bakteriální procesy probíhající v půdě • izoloval nitrifikační bakterie • objevil chemolitotrofii • zformuloval principy koloběhu látek v přírodě Konec „zlaté éry“ mikrobiologie • 1914 – v době 1. světové války utlumen výzkum v oblasti mikrobiologie (uzavřen Pasteurův institut v Paříži) • Výzkum zaměřen na vývoj antibakteriálních sér potřebných pro válečnou medicínu (lepra, tuberkulóza, tyfus, záškrt, tetanus…) Paul Ehrlich zakladatel „moderní chemoterapie“ (Nobelova cena : 1907) Treponema pallidum - původce syfilis Alexander Fleming (1881 – 1955) objev penicilínu 1928, Nobelova cena: 1945 Rebecca C. Lancefield (1895 – 1981) Popis streptokokových antigenů - 1934 Popis virové infekce bakterií - 1943 Salvatore Luria Max Delbrück Luria, S. E., Delbrück, M.: Mutations of bacteria from virus sensitivity to virus resistance. Genetics 28, 491 (1943) „Moderní éra“ mikrobiologie ve 20. stol. Odvětví mikrobiologie: • Lékařská mikrobiologie a imunologie • Zemědělská mikrobiologie a průmyslová mikrobiologie (na základě koncepce Beijerincka a Winogradskeho) • Mikrobiologie vodních ekosystémů a půdní mikrobiologie • Mikrobiální ekologie (60. – 70. léta) • Mikrobiální systematika • Mikrobiální fyziologie • Cytologie • Mikrobiální biochemie • Bakteriální genetika • Virologie • Molekulární biotechnologie a. Biotechnologie b. Genomika (transkriptomika, proteomika, metabolomika) Další významná data…. 1943 - 44: KIMURA, HOTTA: izolace viru dengue 1943 - 44: ESSEN, LEMBKE: průkaz viru infekční žloutenky 1944: WAKSMAN: objev streptomycinu, prvního účinného antibiotika proti tuberkulóze [výroba od roku 1949, Nobelova cena 1952] 1944: SABIN: izolace virů horečky papatači (SFN, SFS) z krve pacientů a průkaz vektoru (Phlebotomus, koutule) 1944: AVERY, MacLEOD, McCARTY: důkaz přenosu genetické informace u bakterií (Streptococcus pneumoniae) pomocí čisté DNA (DNA je chemickým základem dědičnosti) 1945: DELBRÜCK: přepis sekvence nukleotidů DNA do sekvence aminokyselin v proteinech 1946: LEDERBERG, TATUM: důkaz přenosu genetické informace u bakterií (Escherichia coli K12) konjugací [Nobelova cena 1958] Popis konjugace u bakterií - 1946 Joshua Lederberg (1928 – 2008) Source: U.S. National Library of Medicine, Profiles in Science Nobelova cena 1958 James Watson a Francis Crick 3D model struktury DNA - 1953 Nobelova cena - 1962 Foto: thehistoryblog.com rentgenová difrakce Rosalind Franklin rentgenová krystalografie Poválečná mikrobiologie 1954: SALK: usmrcená vakcína proti poliomyelitidě; zahájena masová vakcinace dětí v USA 1955: LITTLEFIELD, KELLER, GROSS, ZAMECNIK: důkaz biosyntézy proteinů v ribozómech 1955: TAYLOR: použití sajících myšek pro izolaci arbovirů 1956-57: VOLKIN, ASTRACHAN: průkaz m-RNA (po infekci bakteriálních buněk fágemT2 se v nich tvoří RNA, jejíž obsah nukleových bazí je stejný s obsahem bazí infikujícího fága) 1957: JACOB a MONOD: regulace syntézy proteinů u bakterií 1957: SABIN: živá (atenuovaná) vakcina proti poliomyelitidě (i v ČR) 1957: WORK, TRAPIDO: izolace viru KFD (horečky Kyasanurského lesa) z člověka, opic a klíšťat Haemaphysalis spinigera 1958: HOAGLAND, ZAMECNIK, STEPHENSON: poznání funkce t-RNA (vazba aktivovaných aminokyselin a jejich přenos do mikrozomálních proteinů) 1958: BÁRDOŠ, DANIELOVÁ: izolace viru Ťahyňa z komárů Aedes na Slovensku; první izolace arboviru z komárů v Evropě 1960: BÁRDOŠ, SLUKA: průkaz lidských onemocnění virem Ťahyňa ("valtická horečka") 1958: SIMPSON: izolace původce konžské hemorag. horečky CCHF Jacques Lucien Monod (1910 – 1976) Genetická regulace proteosyntézy - 1957 Nobelova cena 1965 “In science, self-satisfaction is death. Personal self-satisfaction is the death of the scientist. Collective self-satisfaction is the death of the research.“ New Scientist, 1976 Gerald M. Edelman (1929 – 2014) Rodney R. Porter (1917 – 1985) Popis chemické struktury a funkce protilátek - 1962 Nobelova cena 1972 Z historie mikrobiologie 60. let… 1961: OCHOA, KORNBERG: enzymy syntézy DNA [Nobel.cena 1967] 1961: BRENNER, JACOB, MESELSON, HALL, SPIEGELMAN: důkaz přenosu informace z DNA na m-RNA (jejím přepisem) a do ribozomů u bakterií infikovaných fágemT2 1961-66: NIRENBERG, MATTHAEI, LENGYEL, SPEYER, OCHOA, HOLLEY, KHORANA aj.: stanovení sekvence nukleotidů v kodonech (tripletech) DNA - rozluštění genetického kódu a důkaz molekulární podstaty dědičnosti [Nobelova cena 1968] 1962-63: SEITELBERGER, ZISCHINSKY: izolace viru zarděnek Rubella rod Rubivirus, čeleď Togaviridae; patří mezi RNA viry Exantém zarděnek Foto: dermnetnz.org Z historie mikrobiologie 60. let… 1964: EPSTEIN, ACHONG, BARR: virus Epstein-Barrové původcem karcinomu člověka 1967: ČUMAKOV: izolace původce krymské hemoragické horečky (CCHF) 1968: STEGERT, HENNESSEN, STILLE: izolace viru Marburg (epidemie 1967, zdroj kočkodani) 1969: BUCKLEY: izolace arenaviru Lassa - hemoragická (krvácivá)horečka Z historie mikrobiologie 70. let… 1970: TEMIN, BALTIMORE: objev reverzní transkriptázy u onkogenních virů (retrovirů): virová RNA je přepsána na DNA a ta včleněna do genomu hostitelské buňky [Nobelova cena 1975] 1970-71: NATHANS, SMITH, ARBER: objev restriktáz (sekvenčně specifické DNázy) 1972: JACKSON, SYMONS, BERG: včlenění genů fága lambda galaktózového operonu E. coli do DNA viru SV40 in vitro 1973: BISHOP, DAVIDSON, HOLMES, BUCK: rotaviry jako hlavní původci nebakteriálního průjmu dětí 1973-74: COHEN, CHANGOVÁ, BOYER, COHEN, HELLING: genetické inženýrství - do DNA bakteriálních plazmidů lze in vitro zabudovat jakýkoliv gen jiného organizmu (dokonce i eukaryota: Xenopus laevis) a dále zavést cestou transformace do Escherichia coli 1975: MILSTEIN, KOEHLER: příprava monoklonálních protilátek 1976: NIME: Cryptosporidium parvum jako původce akutního průjmu člověka (epidemie v Milwaukee se 400 000 případy) Z historie mikrobiologie 70. let… 1977: BOWEN, JOHNSON, PATTYN: izolace viru Ebola (velká epidemie hemorhagické horečky v Sudanu a Zaire 1976) 1977: McDADE: izolace původce legionářské horečky(Legionella pneumophila) - epidemie ve Philadelphii 1976 1977: SKIRROW: Campylobacter jejuni jako významný původce bakteriální enteritidy 1978: WOESE: doména Archaea Aaron Klug (*1926) Struktura viru tabákové mozaiky Nobelova cena - 1982 Stanley B. Prusiner (*1942) Objev prionů Nobelova cena - 1997 Priony : Proteiny jako genetický agens ? Onemocnění - kuru, Creutzfeldt-Jacob nemoc, nemoc šílených krav …. Jsou významní i mikrobiologové českého původu??? • August Josef Corda (1809 - 1849) jeden z prvních českých badatelů, kteří používali mikroskop; mykolog • Vilém Dušan Lambl (1824 – 1895) popsal bičíkovce Giardia (Lamblia) intestinalis Giardia lamblia střevní parazit Historie české mikrobiologie Stanislaus Josef Mathias von Prowazek šlechtic von Lanow (1875 Jindřichův Hradec - 1915 Cottbus), rodným jménem Stanislav Provázek - objevil patogen epidemie tyfu, na který ve 40 letech zemřel (Rickettsia prowazekii). Jaroslav Hlava (1855-1924) • Profesor patologické anatomie na LF Univerzity Karlovy v Praze • zakladatel české bakteriologie • nechal postavit nový patologicko-anatomický ústav pod názvem Hlavův ústav • Děkan lékařské fakulty UK, rektor UK 1906 – 1907 • Přítel Jaroslava Kvapila, divadelní nadšenec Historie české mikrobiologie Ivan Honl (1866-1936) • Hlavův asistent, první profesor bakteriologie na Karlově univerzitě • studoval hlavně tuberkulózu, zavedl u nás sérologickou diagnostiku • jako jeden z prvních pozoroval antibiotický účinek pseudomonádových metabolitů na G+ koky (pyocyanasa), výroba léčivého přípravku Anginol před 1. světovou válkou - „Honlovy Anginolky“) Historie české mikrobiologie František Patočka (1904-1985) • zakladatel moderní české bakteriologie a virologie • jako první u nás izoloval virus chřipky (1937) • studoval anaeroby, listerie, rickettsie aj. • zavedl metodu tkáňových kultur • v roce 1970 vydal učebnici Lékařská mikrobiologie Vybraní laureáti Nobelovy ceny Rok Jméno laureáta Oblast 1901 von Behring sérum proti záškrtu 1902 Ross malárie 1905 Koch tuberkulóza 1908 Mečnikov imunita 1945 Fleming penicilin 1962 Watson, Crick struktura DNA 1968 Holley, Khorana genetický kód 1997 Pruisner priony 2002 Brenner, Hervitz genetické regulace vývoje orgánů a programované buněčné smrti 2005 Marshall, Warren Helicobacter pylori, zánět žaludku 2008 zur Hausen Objev lidských papilomavirů způsobujících rakovinu děložního čípku 2011 Steinman Objev dendritických buněk a jejich role v adaptivní imunitě 2015 Campbell a Omura Nová terapie proti škrkavkám 2015 Youyou Tu Nová terapie proti malárii