22.11.2018
1
Imunogenom
 Imunitní funkce jako komplexní
znak(y)
 Imunitní funkce jako základ obrany
proti infekčním nemocem
 Imunogenom jako funkční celek v
evolučním kontextu
Deschamps, Quintana-Murci 2016
Imunogenom a selekce
Imunogenom a selekce
Horizontal axis: ratio of the synonymous and nonsynonymous
mutation rates (Ka/Ks)
Vertical axis: ratio of number of synonymous and nonsynonymous
SNPs in the genes (Pn/Ps)
Deschamps, Quintana-Murci 2016
Ortutay, Vihinen Human Mutation 2012
Imunogenom, selekce, adaptace
22.11.2018
2
Vývoj člověka,
imunogenom, selekce
http://ancients-bg.com/wp-content/uploads/2016/04/0021.jpg
Vývoj člověka, imunogenom, selekce
Deschamps, Quintana-Murci 2016
Vývoj člověka, imunogenom, selekce
Deschamps, Quintana-Murci 2016
Vývoj člověka, imunogenom, adaptace
22.11.2018
3
Imunogenom, evoluce, selekce
 Sympatrie hoinoidních populací
 „Differential pathogen resistance“
 Nižší diversita neandertálců
 MHC, OAS, TLR 1/6/10
 H. pylori, alergie“ hygienická hypotéza
Skylla and Charybda odolnosti/vnímavosti k
nemocem
Věčné dilema:
Silná nebo slabá imunitní
odpověď?
Protektivní imunita
Resistence k infekci
Autoimunita, alergie
Zánět
Imunogenom a selekce
Deschamps, Quintana-Murci 2016
Vývoj člověka,
imunogenom, selekce
http://ancients-bg.com/wp-content/uploads/2016/04/0021.jpg
22.11.2018
4
Genetická diversita a „pathogen richness“
MHC
Prugnolle et al. Curr Biol 2007
Genetická diversita a „pathogen richness“
IL18RAP
Sironi, Clerici 2010
Imunogenom, evoluce, selekce
 Patogeny a evoluce
 IR genes jako geny přežití
 Otisky (signatures) evolučních interakcí
mezi hostitelem a patogenem v genomu
patogenů i imunogenomu hostitele
 Imunogenom a adaptace na
prostředí/patogeny
 Příklad: Introgrese archaických genů/alel
ve vývoji člověka