Analytická cytometrie - podzim 2018

Klubovna BFÚ

Úterý 14-16h


                                               Datum

                                             vyučující

                                             přednáška

                                               18.9.

                                           Karel Souček

Obecný úvod do průtokové cytometrie

– základní principy a historie

Principy průtokové cytometrie a sortrování

-fluorescence

-zdroje excitace, optické systémy a způsoby detekce fluorescence

                                               25.9.


                                           Karel Souček

Principy průtokové cytometrie a sortrování

-zpracování a kompenzace signálu

-vizualizace, analýza a softwarové zpracování dat

                                               2.10.

                                           Karel Souček

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- buněčná biologie (analýza nukleových kyselin, analýza buněčných funkcí)

                                               9.10.

                                           Karel Souček

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- buněčná biologie (analýza nukleových kyselin, analýza buněčných funkcí)

                                              16.10,

                                           Karel Souček

Fluorescenční zobrazovací metody in vivo.

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- cytogenetika, - hydrobiologie, - rostlinná biologie

- aplikace ve fyziologii a imunologii bezobratlých

                                              23.10.

                                      Alena Hyršlová Vaculová

Biologické aplikace průtokové cytometrie

- buněčná biologie (metody průtokové cytometrie ve studiu buněčné smrti, princip a praktické
možnosti víceparametrových analýz)

                                              30.10.



                                               6.11.

                                           Lukáš Kubala

Aplikace průtokové cytometrie v klinické imunologii a hematologii I.

                                              13.11.

                                           Lukáš Kubala

Aplikace průtokové cytometrie v klinické imunologii a hematologii II.

                                              20.11.

                                            Eva Bártová


Principy digitální mikroskopie

- fluorescenční mikroskopie, konfokální mikroskopie, "temporally-resolved” digitální mikroskopie,
“time/frequency-resolved” digitální mikroskopie

Klinické a biologické aplikace digitální mikroskopie

- chromozómová a genová analýza

- analýza buněčných kompartment a metabolismu (pH, ionty)

- aplikace FRET a FRAP

                                              27.11.

                                            Radek Fedr

Základní principy a příklady analýzy obrazu.

                                               4.12.

                                            Radek Fedr

Základní principy a příklady analýzy obrazu.

                                              11.12.

                                           Karel Souček

Prezentace studentů

                                              18.12.

                                           Karel Souček

Prezentace studentů



                        Analytická cytometrie – sylabus praktických cvičení

Vyučující: Karel Souček, Radek Fedr, Stanislav Drápela, …barto

Termín: bude upřesněn

                                              cvičení

     Základy obsluhy rutinního průtokového cytometru. Nastavení, kalibrace, kontrola kvality.

        Základy obsluhy vysokorychlostního sorteru. Nastavení kalibrace, kontrola kvality.

  Analýza buněčného cyklu. Kultivace buněk, fixace, barvení, měření, separace, kontrola čistoty,
                                           analýza dat.

 Imunofenotypová analýza a separace. Kultivace buněk, značení, fixace, měření, separace, kontrola
                                       čistoty, analýza dat.

  Analýza exprese green fluorescent proteinu (GFP) a separace. Kultivace buněk, příprava vzorku,
                         měření, separace, kontrola čistoty, analýza dat.

                              Analýza dat – cvičení software FlowJo.