Jméno a UČO:

            Datum:



                                              Úloha D

                     Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity




VYHODNOCENÍ


-          Na základě výsledku RealTime PCR vypočítejte metodami absolutní nebo relativní
kvantifikace za použití ΔΔCt metody, zdali dochází po přidání neznámého vzorku ve sledovaném
časovém intervalu (24h) ke zvýšení transkriptů vybraných genů a o jak velké zvýšení se jedná.

-          Z pořízených fotek vypočítejte dle vztahu z kapitoly „Vyhodnocení nekrózy“ míru nekrózy
po přímé infiltraci a taktéž po infiltraci skrze petiolu.

-          Na základě výsledků z RT-PCR a nekrotického působení určete, jaký efektor byl ve vašem
neznámém vzorku. Pro vyhodnocení použijte tabulku:


Tabulka 1: Schéma odpovědi rostlin tabáku na jednotlivé testované molekuly.

                                           Typ molekuly

                                              Nekróza

                                              RT-qPCR



                                         Přímá infiltrace

                                          Nasátí petiolou

                                                PR5

                                              ntPRP27

                                            Cryptogein

                                            b-elicitin

                                                +++

                                                +++

                                                +++

                                                +++

                                             Infestin

                                            a-elicitin

                                                +++

                                                -/+

                                                +++

                                                +++

                                           K. salicylová

                                            Fytohormon

                                                -/+

                                                -/+

                                                +++

                                                 +

                                               Voda

                                             Kontrola

                                                 -

                                                 -

                                                 -

                                                 -



Nekróza:




RT-PCR:

Relativní kvantifikace:



Absolutní kvantifikace:




Výsledky:

Náš neznámý vzorek indukoval .......krát zvýšenou/sníženou/nezměněnou expresi PR5

                                                   .......krát zvýšenou/sníženou/nezměněnou expresi
PI-1


Náš neznámý vzorek způsoboval ……..% nekrózu na listech tabáku po přímé infiltraci

                                                     .…….% nekrózu na listech tabáku po nasátí
petiolou



Dle výsledků výše byl v našem neznámém vzorku …………………………….. .

Odůvodněte: