logo-IBA logomuni
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita
J. Hřebíček, J. Kalina
Anketa
Obsah kurzu
Studijní materiály
Harmonogram výuky
Požadavky k ukončení
Instalace software Maple?
0. Organizace výuky
Bi3101 Úvod do matematického modelování

logo-IBA logomuni
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita
J. Hřebíček, J. Kalina
Kontakt
Jiří Kalina
A29 místnost 123 (Recetox)
kalina@mail.muni.cz
—
—

logo-IBA logomuni
3
1. Úvod do matematického modelování a jeho členění.
2. Definice problému, biologický model, zjednodušující předpoklady, počáteční a okrajové podmínky.
3. Návrh matematického modelu, posouzení jeho korektnosti a návrh způsobu řešení.
4. Naprogramování modelu s využitím ICT a jeho přibližné řešení na počítači.
5. Vyhodnocení přibližného řešení s využitím počítačové vizualizace a odhad chyby přibližného
řešení.
Původní osnova kurzu

logo-IBA logomuni
4
6. Metodika postupu zpřesnění matematického modelu s využitím moderních ICT a zdrojů informací
(Maplesoft, Internet, elektronické knihovny, atd.).
7. Příklady vybraných biologických problémů a metodika jejich řešení
8. Zadání projektu
9. Diskuse výsledků, vliv zjednodušujících předpokladů na výsledek, vizualizace a animace (Maple)
výsledků.
Původní osnova kurzu

logo-IBA logomuni
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita
J. Hřebíček, J. Kalina
Výukové materiály
—E-learningová učebnice:
http://portal.matematickabiologie.cz/index.php?pg=analyza-a-modelovani-dynamickych-biologickych-dat
--uvod-do-matematickeho-modelovani starší, obsahuje navíc některé neprobírané okruhy.
—Učebnice v pdf: http://is.muni.cz/do/rect/el/estud/prif/js11/maple/web/mat_model.pdf doposud
základní výukový materiál kurzu.
—Prezentace v pptx: hlavní zdroj materiálu, postupně budou vkládány do ISu vždy po skončení
přednášky/cvičení. Společně s přednáškou by měly být dostatečným materiálem pro přípravu ke
zkoušce.

logo-IBA logomuni
—16.   9. 2019 úvod do úvodu do matematického modelování;
—23.   9. 2019 základní definice, klasifikace modelů, úvod do Maple;
—30.   9. 2019 inverzní problém, kompartmentové modely,
— 7. 10. 2019 růst populace organizmů; modifikace modelu;
—14. 10. 2019 populace pod predátorem, úvod do R;
—21. 10. 2019 klasifikace modelů, modely více populací;
—28. 10. 2019 odpadne;
—  4. 11. 2019 populační modely v R;
—11. 11. 2019 modelování více populací v Maple a R (Lotka-Volterra);
—18. 11. 2019 odpadne;
—25. 11. 2019 odpadne;
—  2. 12. 2019 odpadne;;
—  9. 12. 2019 modelování nejistoty, práce s Metacentrem;
—16. 12. 2019 zdroje, diskuze, kontrola domácích úkolů (dobrovolně);
—Termíny zkoušky: 6. 1. 2020, 13. 1. 2019, 20. 1. 2020
Harmonogram výuky

logo-IBA logomuni
—Instalační soubory Maple jsou již ve studijních materiálech
—
—
—
—Verze 64 bit a 32 bit.
—
—licenseType=network
—serverName=grond.ics.muni.cz
—portNumber=27002
Maple

logo-IBA logomuni
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita
J. Hřebíček, J. Kalina
Podmínky pro splnění zkoušky
—100 minut přednášky a cvičení týdně.
—Účast je nepovinná, ale zapisuje se, zadání domácích úkolů bude probíráno jen na cvičeních.
—Podklady ke cvičením a studijní materiály budou postupně zveřejňovány v ISu + pracovní sešity a
řešení.
—Podmínkou je získat alespoň 60 % bodů za semestr, tj. 162 b.
—Během semestru bude zadáno 9 domácích úkolů po
20 bodech.
—Na závěr písemný test na 100 minut (pokud bude možnost, lze i více) za 90 bodů.

logo-IBA logomuni
Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita
J. Hřebíček, J. Kalina
Podmínky pro splnění zkoušky
—Klasifikace zkoušky: A 92 %–100 % 249–270
B 84 %–91 % 227–248
C 76 %–83 % 205–226
D 68 %–75 % 183–204
E 60 %–67 % 162–182
F   0 %–59 %     0–161