Sylabus výuky předmětů Bi5000 Bioinformatika				
a Bi5000c Bioinformatika - cvičení v semestru podzim 2019				
				
		Přednášky:	"úterý A11-306, 11:00-12:50"	
		Cvičení:	"středa A9-316, 11:00-12:50, 13:00-14:50, 15:00-16:50"	
Datum	č.	Předmět	Lekce	
9/24/2019	1	Bi5000	"Bioinformatika –  základní definice, molekulárně biologické databáze"	
9/25/2019		Bi5000c	Cvičení - textové vyhledávání v databázích	
				
10/1/2019	2	Bi5000	Manipulace se sekvenčními daty	
10/2/2019		Bi5000c	"Cvičení – formáty sekvencí, manipulace se sekvenčními daty"	
				
10/8/2019	3	Bi5000	Posuzování podobnosti sekvencí nukleových kyselin a proteinů 	
10/9/2019		Bi5000c	"Cvičení – párové přiložení sekvencí, BLAST"	
				
10/15/2019	4	Bi5000	"Genomové projekty, sekvenování nové generace"	
10/16/2019		Bi5000c	"Cvičení – návrh oligonukleotidů pro PCR, sekvenování, klonování  a mutagenezi"	
				
10/22/2019	5	Bi5000	Mnohonásobné přiložení sekvencí a fylogeneze	
10/23/2019		Bi5000c	Cvičení - mnohonásobné přiložení a fylogeneze	
				
10/29/2019	6	Bi5000	Počítačové vyhledávání genů a srovnávací genomika	
10/30/2019		Bi5000c	"Cvičení – hledání prokaryotických genů, práce s programy pro srovnávací genomiku"	
				
11/5/2019	7	Bi5000	Příprava anotované sekvence DNA pro zaslání do databáze	
11/6/2019		Bi5000c	Cvičení – zpracování sekvence v programu Sequin	
				
11/12/2019	8	Bi5000	Analýza sekvencí proteinů	
11/13/2019		Bi5000c	Cvičení – analýza sekvencí proteinů	
				
11/19/2019	9	Bi5000	Strukturní databáze	
11/20/2019		Bi5000c	"Cvičení –  základní strukturní analýzy, vizualizace proteinových struktur v PyMOL"	
				
11/26/2019	10	Bi5000	Predikce struktury proteinů	
11/27/2019		Bi5000c	Cvičení –  predikce struktury proteinů	
				
12/3/2019	11	Bi5000	"Testy k ukončení zkouškou ke každému z předmětů (předtermín, skenovaná písemka)"	
12/4/2019		Bi5000c	Zápočtový test na PC (odpovědník v ISu)