NUKLEÁRNI MAGNETICKÁ RESONANCE Moment hybnosti (elektron): Ľ = rxp Spin (elektron) Spin (jádro) Jedno jádro v magnetickém poli Pohyb vektoru magnetizace - dalšf magnetické pole Bi Experiment • Přijímač vypnut, vysílač zapnut: Excitace • Přijímač zapnut, vysílač vypnut: Detekce • Přijímač vypnut, vysílač vypnut: Relaxace Magnetická pole v molekule: • Pľfmá interakce s ostatními jádry • Interakce s elektrony • Interakce s jádry zprostředkovaná elektrony Prfmá interakce s jiným jádrem: Prfmá interakce s jiným jádrem: Prfmá interakce s jiným jádrem: Prfmá interakce s jiným jádrem: Prfmá interakce s jiným jádrem: Interakce s elektrony: Interakce s elektrony: E Jádro H + Bo = 11-75 T Molekula H2 B0 = 11.749695 T / = 500 MHz / = 499 987 000Hz Interakce s elektrony -CH=0 -C=CH- -CHo-O- -CHo-C=0 -CHo-C- (CH3)4Si H2 H+ I I I I 499.9985 499.9990 499.9995 500.0000 MHz Interakce s elektrony -CH=0 -C=CH- -CH2-0- -CH2-C=0 -CH2-C- (CH3)4Si H2 H+ I I I I 99.997% 99.998% 99.999% 100.000% Interakce s elektrony - chemický posun -CH=0 -C=CH- -CHo-O- -CHo-C=0 -CHo-C- (CH3)4Si H2 i i H+ 4 0 ppm 10 ppm 20 ppm 30 ppm Interakce s jádry zprostředkovaná elektrony (J-coupling, spin-spin skalární interakce) E f = 500.0002 MHz / = 499.9998 MHz Měřený signál - FID (Free induction decay) 0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9 1 t/s 06 Spektrum (frekvenční závislost) 1 - 1 1 1 1 1 1 1 1 1 -3000 -2000 -1000 0 1000 2000 3000 f/Hz Spektrum (frekvenční závislost) 1 1 J 1 1 1 1 1 1 -1500 -1400 -1300 -1200 -1100 -1000 f/Hz Spektrum (frekvenční závislost) 2300 2400 2500 2600 f/Hz 2700 2800 Acetaldehyd Methyl acetaldehydu Písnička Hänschen klein P GET ONE 3N ]H H5XFS, H ELO DV "HflENSÖCN KLEIN" L£-ftJB 5FILE EKtlCO IR H CT raiMT FFEGJU FILTR SCANS ĽĽHľTi' fiCBTH PÜ FĚPDJ FU1 lehlľ üefrü ÜE5ET DÍHLĽ IRFRÜ i IRGET i mam i IRfiPU i IKHP] i BiflPĚ i D?fiN£ i TRHUC i TRFRŮ i TREET i TRUTH i TR B PH i TRBP1 i TRAPS i TftíNS CTEHP CSPED SLYNT RE50L NNBHD EF OF PF Feapo FĚ3F1 Ti TZ TT3 T4 REFU. TT13F *E K3 VB L3:H5:£9.34 HHN5 HHN5 NBN Z04B Z04B 90UB.3B Hl «DB Hl 1 D Ü.2275 iuc 2.7232 íbc JD LUD ucŕĹ ]H 5ÚB.LID HHi 1GÜ2BÜ.BÜ Hi 13C LĽ5.ť5 HHi J2795S.QO Hi 511 50. D ufíľO 5B D 1H 50B.0B HHi JĚ2410.B0 Hi 5J1 50. D u sto 3B D 24.1 r CfiK 11 Hi ■í. 39 Hi B B.1B Hi B.OB Hi S4B Op Li den o.oo lea B.OB B.OB 3B.0B LOB.OB B.OB p [in WZ 4ZĽ3Z Hl ■6Tfi.S3 Hl □.□DL] ID 1H spektrum proteinu 600000 500000 \- 400000 \- -100000 '-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-'— 12.0 11.0 10.0 9.0 8.0 7.0 6.0 5.0 4.0 3.0 2.0 1.0 0.0 -1.0 5(1H)/ppm 2D 1H-15N korelační spektrum (HSQC) proteinu 10 o E Q_ CÍ- LO to t * ***** i i i i i i i i i i i 10 5 0 S(1H)/ppm srovnání ID and 2D spekter proteinu amidická oblast 2D 1H-lbN korelačního spektra (HSQC) proteinu Strategie prirazení signálů (frekvencí) jader pátere jednotlivých aminokyselin - experimenty HNCA a HN(CO)CA informace o vzdálenosti mezi atomy (NOE) 1/r6 —> krátké vzdálenosti hodně interakcí = hodně signálů lepšf rozlišení - výběr signálů + více dimenzí 9.0 8.5 8.0 7.5 0.5H 1.0H E 1.5H CL CL 2.0H 2.5H 3.0J TT J_I_I_L C02-15N : 113.721 (ppm) 0 o 9.0 8.5 8.0 t-1-1-r 7.5 7.0 7.0 6.5 J_I_I_I_I_I_I_I_L. t-1-1-1-1-1-1-1-r 6.5 h0.5 1.0 1.5 h2.0 h2.5 h3.0 C03-1H (ppm) lepšf rozlišení - výběr signálů + více dimenzí Postup práce - označení sigálů Postup práce - asociace signálu s (určitým) atomem v proteinu Prevod intenzity signálu na informaci o meziatomové vzdálenosti S S ref 'rreŕ \ r ) (1) S ry* ry* ref ref \ S (2) Známé vzdálenosti protonů geminálnr v CH2 skupině H-C-H 0.17 nm ortho v aromatickém kruhu H-C=C-H 0.25 nm meta v aromatickém kruhu H-C=CH-C-H 0.42 nm Výsledek výpočtu - modely struktur Výsledek výpočtu - modely struktur