P07b Diagnostika anaerobních bakterií Bi7170c (podzim 2019) Osnova ● rod Clostridium ● přehled nejběžnějších druhů nesporulujících anaerobů ● diagnostika anaerobů ● anaerobióza ● úkoly 2/41 Rod Clostridium ● G+ tyčky, anaerobní, spóry (oválné či kulaté endospory vyklenující buňku) ● kvůli správné funkci některých enzymů vyžadují k růstu nižší redoxní potenciál (snížení cysteinem, thioglykolátem apod.) ● některé druhy tolerují malá množství kyslíku (enzymy superoxiddismutáza, peroxidáza, kalatáza) ● saprofyté v půdě (hnilobné procesy) a ve vodě, součástí normální mikroflóry člověka i živočichů ● k rozšíření napomáhá tvorba vysoce odolných endospor (přitomny v půdě, vodě, prachu → kontaminace potravin) ● čím kratší inkubační doba, tím horší prognóza 3/41 Clostridium tetani ● G+ tyčka, anaerobní, rovné, štíhlé, terminální endospora („paličky na buben“) ● saprofyt savců (zejména koní) ● původce tetanu (vstupní branou obvykle hlubší znečištěné rány, méně často popáleniny, vředy apod.) ● pro klíčení spor nutné anaerobní prostředí (zhmožděné a ischemické okolí rány, hnisavé procesy, cizí těleso v ráně) ● za projevy infekce zodpovědný tetanický toxin ● závažnost klinických projevů závislá na množství produkovaného neurotoxinu ● očkování součástí hexavakcíny, přeočkování jednou za 10 – 15 let 4/41 Clostridium tetani (2) ● tetanus – patofyziologie: – tetanospasmin proniká do neuronu → poškození exkrečního aparátu neuronů → zábrana uvolňování inhibičních mediátorů (GABA, glycin) → zablokována normální inhibice motorických neuronů → snížení prahu dráždivosti motorických neuronů → tonické křeče příčně pruhovaného svalstva ● tetanus – klinické příznaky: – tonické křeče (při plném vědomí) žvýkacích svalů (trismus), mimických svalů (risus sardonicus), svalů laryngu a krku, svalů trupu (opistothonus), dýchacích svalů (vede k udušení) – zvýšené pocení a teplota, komplikace (zlomeniny, ...) 5/41 Clostridium tetani (3) 6/41 Clostridium botulinum ● G+ tyčka, anaerobní, rovné, velké, oválná subterminální endospora ● komenzál ve střevech zvířat → ve vodě, půdě, … ● tvoří botulotoxin → otravy potravinami kontaminovanými sporami (nedostatečně sterilizované masové a zeleninové konzervy; 100 °C 10–15 minut) ● botulotoxin je endopeptidáza → hydrolýza proteinů zodpovědných za transport vezikul s acetylcholinem → inhibice uvolňování acetylcholinu → paralýza příčně pruhovaných svalů ● využití v kosmetice (botox) 7/41 Clostridium botulinum (2) 8/41 Clostridium botulinum (3) 9/41 Clostridium botulinum (4) ● formy botulismu: – alimentární botulismus: ● požití toxinu v potravě (mikrob samotný není v těle přítomen) ● nevolnost, zvracení, bolesti břicha, pokles očního víčka (ptóza), rozšíření zornic (mydriáza), ztížené polykání, zácpa, zástava močení, symetrické sestupné paralýzy, ochrnutí dýchacích svalů ● vědomí a citlivost zůstávají nezměněny – traumatický botulismus (infekce rány) – kojenecký botulismus (toxin produkován přímo ve střevě dítěte) 10/41 Klostridia anaerobních traumatóz ● C. perfringens, C. septicum, C. novyi ● různé klinické projevy (typicky inkefce měkkých tkání – kůže, podkoží, svaly) od kontaminace ran, přes hnisavě-nekrotické procesy s lokálním účinkem toxinů po plynatou sněť (vysoce invazivní nekrotické procesy s celkovou intoxikací) ● některé kmeny způsobují svými toxiny nekrotizující enterokolitidy ● celková stabilizace pacienta, chirurgické ošetření ran, ATB, léčba kyslíkem v hyperbarické komoře 11/41 Plynatá sněť 12/41 Clostridium difficile ● přítomno ve střevech (5 % zdravých dospělých, více u dělí a kojenců) ● způsobuje lehčí průjmy, ale i pseudomembranózní kolitidu ● onemocnění často nozokomiálního původu (po podání antibiotik) – především klindamycin, širokospektré peniciliny (amoxicilin+klavulanát) a cefalosporiny (cefoxitin) – tato ATB eliminují normální střevní mikroflóru → přemnožení C. difficile (rezistentní) – léčba metronidazol, vankomycin per os, fekální transplantace (FMT – fecal microbiota transplantation) 13/41 Clostridium difficile (2) 14/41 Clostridium difficile (3) 15/41 Přehled klostridií 16/41 C. tetani původce tetanu C. botulinum producent botulotoxinu C. perfringens, C. septicum, C. novyi, aj. klostridia plynatých snětí (+ enteropatogenita) C. difficile enteropatogenní Přehled nejběžnějších druhů nesporulujících anaerobů ● text 17/41 Koky Tyčky G+ Peptococcus Peptostreptococcus Propionibacterium*** Eubacterium G– Veillonella Fusobacterium, Leptotrichia* Bacteroides, Prevotella, Porphyromonas** * tyčky se zašpičatělými konci ** tyčky s rovnými konci *** není obligátní anaerob Nesporulující anaerobní G+ koky ● rody Peptococcus a Peptostreptococcus – běžná mikroflóra GIT a vaginy → infekce endogenního původu – zánětlivé procesy v malé pánvi (poporodní endometritidy, …), periodontitidy, abscesy (peritonsilární, plicní, ...), sinusitidy, otitidy, peritonitidy při proniknutí střevního obsahu do dutiny břišní 18/41 Nesporulující anaerobní G+ tyčky ● rod Propionibacterium – tyčky kyjovitého tvaru morfologicky podobné rodu Corynebacterium – běžná mikroflóra dutiny ústní, GIT, urogen. traktu – nejvýznamnější Propionibacterium acnes – produkuje lipázy → vznik a rozvoj akné – izolován i z hemokultur při endokarditidách a sepsích ● rod Eubacterium – běžná mikroflóra dutiny ústní, GIT, urogen. traktu – bakteriální vaginózy, smíšené anaerobní infekce 19/41 Nesporulující anaerobní G– koky ● rod Veillonella – běžná mikroflóra flóru dutiny ústní (součást zubního plaku), nosohltanu, GIT a urogen. traktu – smíšené anaerobní infekce (zejména) ústní dutiny, výjimečně meningitidy, osteomyelitidy – Veillonella parvula původcem endokarditidy či sepse 20/41 Nesporulující anaerobní G– tyčky ● běžná mikroflóra lidského těla (dutina ústní, nosohltan, GIT, urogen. trakt) ● značně pleomorfní (obyčejně tyčky, ale i koky nebo vlákna), netvoří spóry, pestrá biochemická aktivita → využití v diagnostice ● původci infekcí endogenního původu ● terapie ATB (klindamycin, linkomycin, metronidazol, chloramfenikol, peniciliny s inhibitory beta-laktamáz) většinou v kombinaci s chirurgickým výkonem 21/41 Nesporulující anaerobní G– tyčky (2) ● rod Bacteroides – nejčastěji izolované z infekcí (dutina břišní, malá pánev, vagina, dutina ústní, …) – Bacteroides fragilis ● rod Porphyromonas – infekce dutiny ústní (gingivitidy, gingivostomatitidy) a urogenitálního traktu – Porphyromonas gingivalis ● rod Prevotella – infekce HCD (anginy, sinusitidy) – Prevotella melaninogenica 22/41 Nesporulující anaerobní G– tyčky (3) ● rod Fusobacterium – polymorfní, až vřetenovitý tvar – infekce chirurgických a traumatických ran, komplikují rány po kousnutí zvířetem, směsné kultury při pneumonii, hrudním empyému, intraabdominální infekci a abscesech – Fusobacterium nucleatum (součást zubního plaku) – Fusobacterium necrophorum (nekrotizující tonsilitida) ● rod Leptotrichia – součást ústní mikroflóry – Leptotrichia buccalis (orodentální infekce) 23/41 „Veillonova flóra“ ● název pro skupinu anaerobních G+ a G– nesporulujících bakterií kolonizujících kůži a sliznice člověka ● není možné jednoznačně označit hlavního původce onemocnění ● za původce onemocnění se pokládají rovnoměrně všechny bakterie, kterých bývá izolován větší počet → za etiologického původce se pokládá celá tzv. Veillonova flóra ● součástí např. rody Peptococcus, Peptostreptococcus, Veillonella, Eubacterium, Propionibacterium, Fusobacterium , Bacteroides, ... 24/41 Lactobacillus acidophilus ● nejvýznamnější zástupce rodu („Döderleinův bacil“) ● G+ tyčky, často v řetízcích, mikroaerofilní (ne anaerobní, nicméně rostou v nedokonalé anaerobióze běžných anaerostatů) ● běžná mikroflóra dutiny ústní, GIT, vaginy ● laktobacily utilizují sacharidy na laktát → snížení pH → zastavuje množení hnilobných bakterií (využití i v potravinářství) ● utilizace glykogenu (z rozpadajících se epitelií) ve vagině → snížení pH brání usídlení patogenů ● může způsobovat endokarditidy, novorozenecké meningitidy, endometritidy, abscesy, ... 25/41 Vztah bakterií ke kyslíku * V praxi někdy vyrostou – běžně dosahovaná anaerobióza není dokonalá. ** V praxi někdy nevyrostou – běžně dosahovaná anaerobióza není dokonalá. Takové bakterie (EOS – Extremely oxygen sensitive) běžně nelze kultivovat. 26/41 Prostředí Normální ↓O2 ↑CO2 Bez O2 Striktní aeroby ano ano ano ne* Fakultativ. anaeroby ano ano ano ano Aerotolorantní bakt. Mikroaerofilní bakt. ne ano (ano) ne* Kapnofilní bakterie ne (ano) ano ne* Striktní anaeroby ne ne ne ano** Diagnostika anaerobů ● mikroskopie: barvíme podle Grama, rozlišujeme na koky a tyčky, G+ a G–; anaerobní tyčky pleomorfní (nacházíme i vláknité formy a koky), u spor sledujeme morfologii a uložení (světlolomné útvary, nikoliv jen ztluštění tyčky!) ● kultivace: pevné půdy (anaerobióza pomocí anaerostatu či anaerobního boxu), tekuté půdy přelité parafinem (VL bujón, VL krevní agar a různé speciální půdy); většinou prodloužená kultivace na 2 dny až týden ● biochemie: většinou KAT– a OXI–, možné vzájemné rozlišení biochemicky a analýza plynů chromatografií ● antigenní analýza a nepřímý průkaz se v diagnostice anaerobů příliš nepoužívají 27/41 Diagnostika anaerobů (2) ● přednost má tekutý vzorek, např. hnis, nejlépe zaslaný ve stříkačce s krytkou (po odstříknutí přebytečného vzduchu) – dříve doporučený postup, kdy se na stříkačce ponechala jehla a zabodla do gumové zátky se již z bezpečnostních důvodů nedoporučuje ● výtěr zanořen v transportní půdě (např. Amiesova půda) ● lze domluvit s laboratoří naočkování vzorku přímo na půdy např. peroperačně 28/41 Kultivace anaerobních bakterií ● rostou často v nepravidelných koloniích, někdy výběžkaté okraje, někdy pigment ● typický je pro ně značný (hnilobný) zápach ● pro kultivaci anaerobů používáme VL krevní agar ● získávání anaerobiózy: – mechanicky: VL bujony přelijeme parafinovým olejem – fyzikálně: v anaerobním boxu se nahradí vzduch směsí anaerobních plynů, vháněných z bomby – chemicky: z organických kyselin tvoří H2 a CO2 → na palladiovém katalyzátoru reaguje H2 s O2 za vzniku vody → O2 se spotřebovává 29/41 Anaerobní box 30/41 Mikrobiologický ústav, foto O. Z. zdroj anaerobních plynů prostor pro vkládání misek vstupy pro ruce personálu Anaerostat 31/41 vzduchotěsné víčko palladiový katalyzátor (pod víčkem) konstrukce pro ukládání Petriho misek generátor anaerobiózy (sáček s chemikáliemi) tlakový ventil šroubovací uzávěr Úkol 1: Mikroskopie klinického vzorku a mikroskopie kmene ● úkol 1a: Prohlídka klinického vzorku (popište směs patogenů, leukocyty, epitelie, atd.) ● úkol 1b: Mikroskopie podezřelých kmenů (rozlište G+ a G– koky a tyčky, pokuste se najít spóry) 32/41 Úkol 2: Anaerostat a anaerobní box ● popište anaerostat a anaerobní box podle obrázku z prezentace 33/41 Úkol 3: Kultivace na agarových půdách ● popište kultivační výsledky daných kmenů na aerobních i anaerobních půdách ● popište morfologii kolonií 34/41 Úkol 4: Druhová diagnostika anaerobů biochemickými testy ● odečtěte ANAEROtest 23 ● výsledky sloupců „B“ a „A“ se při výpočtu kódu nezapočítávají, získáte tedy šestimístný kód za sloupce H až C ● u druhého z kmenů vyjdou dvě možnosti výsledku ● předpokládejte, že tento kmen byl již testován na citlivost na penicilin a byl shledán citlivým → nejde tedy o zástupce (primárně na penicilin resistentního) rodu Bacteroides 35/41 Úkol 5: Citlivost anaerobů na antibiotika ● lékem volby u většiny anaerobů penicilin ● rezistentní je však rod Bacteroides (v užším slova smyslu – rody Prevotella a Porphyromonas, které se z něj kdysi odštěpily, jsou citlivé) ● antibiotická citlivost se u anaerobů dříve prováděla difusním diskovým testem (nikoli na MH, ale na VL krevním agaru) ● nyní se ale zpravidla používá E-test ● odečtěte hodnotu MIC a určete, zda je daný kmen citlivý nebo rezistetní (odečítá se v místě, kde se kříží okraj zóny s testovacím proužkem) 36/41 Úkol 6a: Průkaz toxinu (lecitinázy) Clostridium perfringens ● Clostridium perfringens tvoří specifickou lecitinázu, jež je možno neutralizovat specifickou protilátkou ● polovina misky je potřena protilátkou (anti-lecitinázou), druhá potřena není ● toxický efekt lecitinázy spatříte jako oblast precipitace kolem kmene na žloutkovém agaru ● pravý toxin je neutralizován antitoxinem, jiné lecitinázy neutralizovány nejsou 37/41 Úkol 6a: Průkaz toxinu (lecitinázy) Clostridium perfringens ● pravý toxin je neutralizován antitoxinem, jiné lecitinázy neutralizovány nejsou ● „Negativní I“ vůbec neprodukuje lecitinázu ● „Negativní II“ produkuje, ale nějakou jinou, než nás zajímá 38/41 Úkol 6b: Průkaz toxinu Clostridium tetani ● průkaz toxinu Clostridium tetani se prování očkováním tetanické myš ● typická je pozice ocásku a končetin (zakreslete) 39/41 microvet.arizona.edu Obrázek Petra Ondrovčíka (graficky upraveno) Úkol 6c: Detekce A a B toxinů Clostridium difficile ● odečtěte imunochromatografické testy tří pacientů 40/41 test přítomnosti klostridiového antigenu test toxinů A a B kontrola Po tomto cvičení byste měli umět: ● popsat hlavní zástupce rodu Clostridium, včetně testů, které slouží pro jejich identifikaci, popř. identifikaci jejich toxinů ● popsat nejběžnější druhy nesporulujících anaerobů, jejich diagnostiku a obvyklou léčbu ● popsat základy anaerobní kultivace a možnosti získání anaerobiózy 41/41