P09 Přehled virologické diagnostiky Bi7170c (podzim 2019) Osnova ● klasifikace a struktura virů ● replikace virů; adenoviry, picornaviry, respirační viry; mykoplasmata ● virus klíšťové encefalitidy ● viry spalniček, zarděnek, příušnic ● viry hepatitid ● HIV virus ● herpesviry ● izolace a kultivace virů, cytopatický efekt 2/125 Viry ● elementární biosystém, který vykazuje některé vlastnosti živých systémů (přítomnost genomu, schopnost adaptace) ● nejsou schopny zabezpečit své energetické nároky bez živé buňky a mimo ni nejsou funkčně aktivní ● intracelulární parazité, postrádají proteosyntetický aparát ● 2 fáze: – neživé agregáty makromolekul mimo hostitelskou buňku (metabolicky inertní) – uvnitř buňky replikace a exprese genomu (metabolicky aktivní) 3/125 Viry (2) ● společné znaky s živými organizmy: – schopnost rozmnožování (de novo) – přítomnost genomu – variabilita (proměnlivost, mutace) – adaptace (změna spektra hostitelů) – vývoj (evoluce) ● odlišné znaky od živých organizmů: – charakter genetického materiálu (RNA genomy) – specifický druh parazitizmu (na genetické úrovni) – nepřítomnost proteosyntetického aparátu => nebuněčná forma života 4/125 Viry ● původ není jasný, zdá se, že nemají společného předka ● rozdělení: – DNA viry, RNA viry – jednovláknové (ss = single stranded), dvouvláknové (ds = double stranded) ● +ssRNA – slouží jako mRNA ● -ssRNA – RNA komplementární k mRNA, před translací musí být nejdříve přepsána do +ssRNA – přítomnost reverzní transkriptázy – obal (obalené, neobalené) 5/125 Baltimorova klasifikace virů 6/125 Struktura virů ● virion = diskrétní virová částice – intaktní virová částice = komplex virové NK a proteinů (popř. i obalu) schopný infikovat buňku ● kapsid(a) = plášť viru tvořený bílkovinami (chrání a stabilizují NK); určuje symetrii/tvar ● kapsomera = morfologická jednotka sdružující strukturální podjednotky a tvořící kapsidu ● nukleokapsid(a) = strukturní útvar tvořený virovou NK a bílkovinným obalem – přítomná u většiny virů (bez ohledu na obal) ● proteinové podjednotky se k sobě spojují autoagregací (energeticky výhodný proces; bez dodání energie) 7/125 Struktura virů (2) ● vnější obal (envelope) = lipidová dvojvrstva s transmembránovými glykoproteiny – glykoproteiny tvoří výběžky (peplomery, spikes) na povrchu viru – pro přichycení viru k hostitelské buňce – tvořena komponenty z hostitelské buňky (původně část cytoplazmatické nebo jaderné membrány, endoplazmatického retikula nebo Golgiho aparátu) – obalené viry méně mechanicky odolné (citlivější k vyschnutí, teplu nebo detergentům) – výhodou je adaptabilita obalu → únik před imunitním systémem hostitele 8/125 Symetrie kapsid 9/125 ● ikosahedrální (kubická) = dvacetistěn se třemi osami symetrie (2-, 3-, 5-četnou) Symetrie kapsid (2) ● helikální (šroubovicová) = jednotlivé polypeptidy (protomery) se řadí za sebou a jako šroubovice sledují vlákno genomu 10/125 Symetrie kapsid (3) ● komplexní = uspořádání kapsomer neumožňuje jednoznačné zařazení do předchozích skupin 11/125 Symetrie kapsid (4) ● symetrie nukleokapsidů pod vnějším obalem 12/125 Adenoviry ● neobalené dsDNA viry, ikosahedrální symetrie, středně velké (90 nm) ● původně izolované z adenoidní vegetace (nosní mandle) ● přes 50 serotypů patogenních pro člověka – respirační onemocnění (rýmy, tonsilitidy, faryngitidy; ojediněle až fatální pneumonie – Ad 14) – konjunktivitidy (faryngokonjunktivální horečka – Ad 3, 4, 7; keratokonjunktivitidy – Ad 8, 19) – gastroenteritidy (Ad 40, 41) – akutní hemoragická cystitida (nefritida) (Ad 11, 21) ● pouze symptomatická léčba 13/125 Adenoviry (2) 14/125 Adenoviry (3) ● přichycení viru glykoproteiny ● endocytóza ● rozrušení endosomu lytickými enzymy po snížení pH ● uvolnění virionu do cytoplasmy ● transport k jádru (mikrotubuly) 15/125 Adenoviry (4) ● přenos NK do jádra 16/125 Adenoviry (5) ● DNA v jádře: – exprese časných genů (regulační proteiny): ● exprese proteinů nutných k replikaci DNA ● aktivace dalších virových genů ● zamezit IS zničit virus/napadenou buňku (blokování apoptózy, interferonu a exprese a transportu MHC I) – replikace DNA (DNA viry často využívají DNA polymerázu hostitele, ale adenoviry mají vlastní) – exprese pozdních genů (strukturní proteiny) ● sestavení nových virionů, maturace ● opuštění buňky (lyze buňky) 17/125 Adenoviry (6) 18/125 Čeleď Picornaviridae ● neobalené +ssRNA viry, malé (30 nm), ikosahedrální, odolné ● rod Enterovirus (poliovirus, rhinoviry, coxsackie viry, echoviry) ● rod Hepatovirus (virus hepatitidy A) ● replikace: adsorpce → endocytóza → translace do polyproteinu → replikace ve viral factories → sestavení prokapsidu → maturace (neznámá proteáza) → lyze buňky ● viral factories (intracelulární kompartmenty různého původu; zvyšují efektivitu virové replikace a sestavení virionů; ochrana před obranými mechanismy hostitele) 19/125 Čeleď Picornaviridae (2) 20/125 Viral factories 21/125 Viry chřipky ● obalené -ssRNA viry, 80 – 120 nm, kulaté, oválné, někdy i protáhlé, segmentovaný genom (8 segmentů) ● replikace v jádře (u RNA virů výjimka) ● hemaglutininy – membránové proteiny, hlavní povrchový antigen H – přichycení k povrchu buňky – receptor kys. sialová – fúze virového obalu a endosomu) ● neuraminidáza (N) – štěpení kys. sialové – umožní pronikání viru přes hlen na sliznicích – uvolnění virionů z buňky a zabránění jejich agregaci 22/125 Viry chřipky (2) ● https://www.youtube.com/watch?v=YSgkoldBNkI 23/125 Viry chřipky (3) 24/125 Chřipka ● příznaky: horečka (zimnice a třesavka), silné bolesti hlavy, artralgie, myalgie, nevolnost až zvracení, suchý dráždivý kašel ● nebezpečná u lidí se sníženou imunitou, těhotných a starších osob ● některé subtypy vyvolávají u mladých lidí s dobrou imunitou tzv. cytokinové bouře (neadekvátní reakce IS) – pandemie španělské chřipky (H1N1, 1918), prasečí (mexické) chřipky (H1N1, 2009) ● virus chřipky A (nejčastější a nejzávažnější) ● virus chřipky B (sezónní, možné i střevní příznaky) ● virus chřipky C (mírný průběh, hlavně děti) 25/125 Chřipka (2) ● léčba: – symptomatická (analgetika, antipyretika, antitusika, expektorancia, nazální dekongescencia) – specifická terapie – antivirotika ● antivirotika: – amantadin, rimantadin (inhibitory M2-proteinu) – modernější zanamivir (Relenza; inhal.) a oseltamivir (Tamiflu) (inhibitory neuraminidázy) ● prevence: – vakcína 2 subtypů chřipky A a dvou chřipky B – v ČR nejvhodnější dobou pro očkování období od října do prosince 26/125 Chřipka (3) ● evoluční vývoj: – antigenní drift: ● malé změny hemaglutininu a neuraminidázy způsobené náhodnými mutacemi ● infekce (epidemie) přichází v době, kdy je virus dostatečně odlišný a IS ho nerozezná od předchozí prodělané infekce – antigenní shift: ● reasortace segmentů genomu mezi různými kmeny viru (nejčastěji ptačí, prasečí a lidské kmeny) ● rychlé získání odlišných antigenů, vyvolává pandemie 27/125 Chřipka (4) ● pandemie: – jen chřipka A (u ostatních je prakticky nemožné, aby nastal antigenní shift) – H1N1, španělšká chřipka (1918), prasečí (mexická) chřipka (2009) – H2N2, asijská chřipka (1957) – H3N2, hongkongská chřipka (1968) – H5N1, ptačí chřipka (2003, nejvíce od 2005) ● samotné subtypy H a N neříkají nic o nakažlivosti a virulenci, záleží na konkrétní struktuře viru ● viry nebezpečné až po vhodné rekombinaci různých částí různých virů 28/125 Viry parachřipky ● obalené -ssRNA viry, větší (150 nm), 4 typy ● příbuzné virům příušnic a spalniček ● postihuje zejména malé děti ● horečnaté infekce HCD (kašel, často katar), může přejít i na DCD vč. zánětu plic ● diagnostika: KFR, HIT, ELISA (časté zkřížené reakce) 29/125 RS virus ● respirační syncyciální virus (rod Pneumovirus) ● obalené -ssRNA viry ● příbuzné virům parachřipek ● postihuje zejména kojence a malé děti ● jedna z nejčastějších příčin hospitalizace dětí ● bronchitidy, bronchiolitidy, zánět plic ● diagnostika: ELISA, buněčné kultury ● při replikaci viru vznikají mnohojaderná syncytia ● metapneumovirus (napadá starší děti; mírnější příznaky onemocnění) 30/125 Mykoplasmata ● bakterie, nejmenší a nejjednodušší prokaryota, která nepotřebují cizí buňku ● nemají buněčnou stěnu (→ nepůsobí β-laktamová ATB), mají trojvrstevnou plazmatickou membránu (tvar pleomorfní) ● rody Mycoplasma a Ureaplasma 31/125 Mycoplasma pneumoniae ● původcem tzv. atypických pneumonií ● často jen jako rýma nebo bez příznaků ● mohou nastat i mimoplicní komplikace (srdeční, nervové a jiné) ● ATB při těžších formách infekce ● citlivé na tetracykliny, makrolidy (u dětí), ● ATB bakterii neusmrcují, pouze zastavují její množení (působení na proteosyntézu) ● diagnostika: KFR, ELISA (v rámci serologie respiračních virů) 32/125 Další mykoplasmata ● Mycoplasma hominis – běžně nacházený patogen převážně v urogenitálním systému u žen a sexuálně aktivních mužů – záněty pochvy, močové trubice, apod., které mohou vyústit v hluboký pánevní zánět ● Mycoplasma genitalium – negonokoková uretritida (muži), cervicitida (ženy), hluboký pánevní zánět ● Ureaplasma urealyticum – záněty pochvy, močové trubice 33/125 Virus klíšťové encefalitidy ● obalený +ssRNA virus, 50 nm, čeleď Flaviviridae ● klíšťová encefalitida: – nejdříve mírné „chřipkovité“ příznaky – encefalitida, meningitida, meningoencefalitida – letalita 1 – 5 % – arbovirus (arthropod-borne virus) – viry přenášené členovci – zdrojem lesní savci (hlodavci) – diagnostika: KFR, HIT, ELISA, PCR, izolace na sajících myšatech 34/125 Virus klíšťové encefalitidy (2) 35/125 Virus klíšťové encefalitidy (3) ● symptomy a diagnostika 36/125 Čeleď: Togaviridae ● obalené +ssRNA viry, ikosahedrální symetrie, 65-70 nm ● rod Rubivirus – virus rubeoly (zarděnky) ● rod Alphavirus – arboviry (arthropode born) – viry koňské encefalitidy (EEE, WEE, VEE) – viry horeček Chikungunya a O'nyong nyong 37/125 Virus rubeoly (zarděnky) ● lat. rubeo = zardívám se, angl. rubella ● čistě lidský virus ● benigní dětské onemocnění ● přenos vzduchem, inkubace 16–18 dní, začíná se vylučovat nosohltanem už před výsevem vyrážky ● nebezpečné u těhotných (první trimestr → vrozené vady – malformace srdce, sluchu či jiných orgánů ● diagnostika: klinické příznaky, ELISA, přímý průkaz množením na tkáňových kulturách bez CPE (pomnožení viru prokazováno interferencí, tj. přidáme virus, který by normálně dělal CPE, např. echovirus 11) ● léčba: symptomaticky 38/125 Virus rubeoly ● obalený, +ssRNA, 65-70 nm 39/125 Zarděnky – příznaky ● makulopapulózní vyrážka, začíná na obličeji, šíří se na celé tělo 40/125 Čeleď: Paramyxoviridae ● obalené -ssRNA viry, sférické, 150 nm ● podčeleď Paramyxovirinae – Respirovirus – virus parachřipky 1 a 3 – Morbillivirus – virus spalniček – Rubulavirus – virus příušnic, parachřipky 2, 4a, 4b ● podčeleď Pneumovirinae – Pneumovirus – lidský RS virus – Metapneumovirus – lidský metapneumovirus 41/125 Čeleď: Paramyxoviridae ● obalené -ssRNA viry, sférické, 150 nm 42/125 Virus spalniček (Morbillivirus) ● angl. measles nebo rubeolla ● neexistují bezpříznakové infekce: – po 10–11 dnech horečka, rýma, kašel, záněty spojivek → charakteristická vyrážka, začínající na tvářích a za ušima (po 3–4 dnech vybledá) – v ústech tzv. Koplikovy skvrny (šedé makuly) ● možné komplikace postihující dýchací a nervovou soustavu ● vzácně reaktivace v dospělosti: subakutní sklerózující panencefalitida (SSPE) ● diagnostika: serologie (ELISA, KFR, HIT) ● léčba: symptomaticky 43/125 Spalničky – příznaky ● vyrážka ● Koplikovy skvrny (dole) 44/125 Virus příušnic ● angl. mumps ● vstup přes respirační trakt (kapénkově) → inkubační doba 2-3 týdny, generalizovaná infekce ● otok slinných žláz, možné postižení CNS, slinivky břišní a varlat (nebezpečné u mužů v pubertě → vzácně vede ke sterilitě) ● diagnostika: serologie (HIT, KFR, ELISA), izolace ● léčba: symptomaticky 45/125 Příušnice – příznaky 46/125 MMR vakcína ● očkování proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám ● živé oslabené viry ● indikováno dětem starším 15 měsíců, osobám vnímavým na alespoň jednu z nákaz, při riziku komplikací v těhotenství ● postexpoziční profylaxe po kontaktu se spalničkami 47/125 Viry hepatitid ● pět hlavních typů virových hepatitid VHA až VHE ● každý patří do jiné skupiny, většina jsou RNA viry, kromě VHB je DNA virus s RT ● VHA a VHE – přenášejí se fekálně-orální cestou (ruce), nepřecházejí do chronicity ● VHB, VHC a VHD – přenos krví, popř. sexuálně (u VHC spíše nevýznamné), mohou přecházet do chronicity, prekanceróza ● existují i další viry hepatitid ● pacient má horečky, trávicí potíže, může být přítomno zežloutnutí skléry či kůže, změna barvy moče a stolice atd. 48/125 Virus Zařazení Přenos HAV Picornaviridae +ssRNA fekálně-orální HBV Hepadnaviridae dsDNA (RT) sexuální, krví HCV Flaviviridae +ssRNA krví HDV Deltavirus (Delta agens – viroid) -ssRNA sexuální, krví HEV Hepeviridae +ssRNA fekálně-orální Viry hepatitid – přehled 49/125 Hepatitis A virus ● neobalený, +ssRNA, 30 nm 50/125 Hepatitis B virus ● obalený, částečně dsDNA (RT), 42 nm 51/125 Hepatitis B virus (2) ● neinfekční částice produkované v nadbytku 52/125 Hepatitis B virus (3) ● neinfekční částice produkované v nadbytku 53/125 Hepatitis C virus ● obalený, +ssRNA, 50 nm 54/125 Hepatitis D virus ● obalený, -ssRNA 22 nm ● satelitní virus (vyžaduje koinfekci s HBV) 55/125 Hepatitis E virus ● neobalený, +ssRNA, 32-34 nm 56/125 Hepatitidy ● infekční záněty jater, lidově žloutenky ● hepatitida jako přenosné virové onemocnění ● hepatitida jako příznak, který je přítomen nejen při virové hepatitidě, ale i např. při obstrukci žlučových cest kameny ● nevirové hepatitidy: – metabolická (Wilsonova choroba – abnormální střádáním mědi v játrech → způsobuje poškození jaterních buněk, poruchy funkce CNS a hemolytickou anémii; porfyrie = hromadění prekursorů hemu v játrech) – toxická (alkohol, léky) 57/125 Hepatitida příznaky ● typická ikterická forma (u všech hepatitid je však častější forma anikterická) 58/125 Prevence hepatitid ● očkování proti hepatitidě A je dostupné a doporučené např. i při cestách do jižní Evropy či severní Afriky ● očkování proti hepatitidě B nyní součástí normálního očkovacího kalendáře (hexavakcína) ● možné současné očkování proti hepatitidě A i B ● očkování proti hepatitidě C není (několik genotypů, velké množství subtypů, snadno mutuje) ● očkování proti hepatitidě D = proti HBV ● experimentální vakcíny proti HEV (různé fáze klinických studií, uvedení na trh zřejmě nebude v dohledné době) 59/125 Diagnostika hepatitid A, C, D, E ● HAV: stanovujeme metodou ELISA anti-HAV IgM s IgG, nebo IgM a celkové protilátky ● HCV: stanovujeme IgM a IgG protilátky metodou ELISA, dále se používá PCR ● HDV: prokazuje se delta antigen (HDAg), protilátky (anti-HD) či virová RNA pomocí PCR ● HEV: průkaz IgM a IgG protilátek metodou ELISA, ve výzkumu i PCR 60/125 Zvláštnosti diagnostiky HBV ● nuleokapsida – dvě dřeňové bílkoviny, které mají povahu antigenů (HBcAg a HBeAg) ● obal – antigen HBsAg ● HBsAg je nadprodukován (v krvi kolují i prázdné obaly) ● do prázdného HBsAg může proniknout delta agens – původce hepatitidy D ● delta agens podstatně zhoršuje prognózu virové hepatitidy 61/125 Hepatitis B virus (2) ● neinfekční částice produkované v nadbytku 62/125 Diagnostika HBV ● HBV má tři pro diagnostiku významné antigeny, jen dva z nich však nalézáme v séru: HBsAg a HBeAg ● HBsAg se tvoří v nadbytku, takže je ho vždy v séru hodně, proto se hodí pro screening ● protilátky naopak můžeme stanovovat proti všem třem z nich: anti-HBs, anti-HBe i anti-HBc. ● diagnostiku případně doplní PCR, průkaz jaterních enzymů aj. ● z kombinace vyšetření plyne interpretace 63/125 Screening a léčba hepatitid ● screening hepatitidy B běžný (před operacemi, v těhotenství apod.) ● léčba akutních hepatitid je symptomatická a podpůrná ● základem terapie klidový dietní režim, použití hepatoprotektiv ● VHC –časná léčba interferonem může zabránit přechodu do chronicity ● antivirotika: lamivudin (HBV) 64/125 Virus HIV ● retrovirus (reverzní transkriptáza) ● HIV 1 – ve střední Africe a v ostatních kontinentech, kam se rozšířil ● HIV 2 – pouze v západní Africe, rozvoj onemocnění je pomalejší než u infekce HIV 1 ● přenos se krví, pohlavní cestou, z matky na dítě (transplacentárně i mateřským mlékem) 65/125 Průběh infekce virem HIV ● primoinfekce virem HIV (težký pokles CD4+ lymfocytů, přechodná virémie, příznaky podobné jako tonsilofaryngitida, infekční mononukleóze či chřipce) ● bezpříznakové stádium (18 měsíců až 15 let, perzistující generalizovaná lymfadenopatie) ● časné symptomatické stádium (celkové příznaky – horečka nad 38,5° C, noční pocení, únava, úbytek na váze; časté malé oportunní infekce ● pozdní symptomatické stádium, AIDS (konečné stadium HIV infekce, velké oportunní infekce, nádory, encefalopatie) 66/125 Virion HIV ● obalený, dvě kopie +ssRNA, 80-100 nm 67/125 Diagnostika HIV ● protilátky proti obalovým glykoproteinům pomocí ELISA testů (gp41, gp120) ● výsledek vyjde jako pozitivní, pošle se vzorek séra do referenční laboratoře, která výsledek ověří (konfirmuje) další reakcí ELISA a Western blottem ● do výsledků konfirmace je výsledek hodnocen jako „reaktivní“, nikoli jako „pozitivní“ ● přímý průkaz lze provádět pomocí PCR ● izolace viru je dnes již možná, ale velmi náročná a běžně se neprovádí 68/125 Herpetické viry ● obalené, dsDNA, ikosahedrální symetrie, poměrně velké (HSV-1 150-200 nm) ● typické dlouhodobé přetrvávání v organismu (fáze latence) v nervových a lymfatických tkáních ● reaktivace při stresové situaci popř. oslabení imunitního systému 69/125 Herpetické viry (2) ● obalený, lineární dsDNA, 150-200 nm 70/125 Zkratka, podčeleď Celé jméno Choroba HSV-1 + 2 (alfa) Herpes simplex virus herpes simplex (prostý opar) VZV (alfa) Varicella zoster virus plané neštovice, pásový opar EBV (gamma) Virus Epstein-Barrové infekční mononukleóza CMV (beta) Cytomegalovirus cytomegaloviróza HHV-6 + 7 (beta) Lidský herpesvirus 6 + 7 exanthema subitum HHV-8 (gamma) Lidský herpesvirus 8 Kaposiho sarkom Herpetické viry (2) 71/125 Herpes simplex virus ● po infekci viry přežívají v nervových gangliích ● HSV-1: herpes labialis (bolestivé puchýřky v oblasti úst, může se ale objevit i jinde) – závažné komplikace (encefalitida, infekce oka) ● HSV-2: herpes genitalis (bolestivé puchýřky v oblasti genitálu a anu ● diagnostika: klinické příznaky, PCR, popř. izolace viru ● léčba: aciklovir, valaciklovir a famciklovir (nepůsobí na latentní infekci, infekce nejsou vyléčitelné → latence) 72/125 Herpes labialis, herpes genitalis ● HSV-1 ● HSV-2 73/125 Varicella zoster virus (VZV) ● bránou vstupu respirační trakt → pomnožení v lymfatických uzlinách → hematogenní rozsev do kůže a sliznic → tvorba puchýřků (plané neštovice) ● perzistuje ve spinálních gangliích interkostálních nervů ● při oslabení imunity nebo stresu se šíří anterográdně do senzitivní oblasti příslušného nervu → pásový opar ● diagnostika: PCR, ELISA, popř. kultivace ● léčba: aciklovir, valaciklovir a famciklovir 74/125 Plané neštovice 75/125 Pásový opar 76/125 Cytomegalovirus (CMV) ● název odvozen od zvětšených buněk napadených virem (virus zabraní apoptóze zprostředkovanou mitochondriemi) ● vstup respiračním nebo trávicím traktem → pomnožení a hematogenní rozsev → perzistence ve slinných žlázách, renálních tubulech, leukocytech ● u většiny probíhá infekce bezpříznakově, méně často syndrom infekční mononukleózy (teplota, lymfadenopatie) ● infekce je závažná u těhotných (infekce plodu) a imunokompromitovaných (transplantace, AIDS, apod.) ● diagnostika: serologie, PCR, kultivace ● léčba: ganciklovir, foskarnet 77/125 Lidský herpesvirus 6 + 7 ● HHV-6A, HHV-6B; HHV-7 ● infekce probíhá u dětí nejčastěji do 1. roku života, přenos kontaktem → zvýšená teplota, někdy doprovázená exantémem (exanthema subitum neboli roseola infantum) ● reaktivace bezpříznakové, s výjimkou imunokompronitovaných jedinců ● diagnostika: klinické příznaky, serologie, izolace viru ● léčba: symptomaticky, výjimečně ganciklovir apod. 78/125 Exanthema subitum neboli roseola infantum 79/125 Virus Epsteinův – Barrové ● brána vstupu respirační trakt → pomnožení v B-lymfocytech → příznaky žádné, přes angínu s lymfadenitidu (infekční mononukleóza), až po postižení jater ● souvislost s určitými typy tumorů ● diagnostika: Paul-Bunnellova reakce – důkaz tzv. heterofilní protilátek shlukujících beraní krvinky, nebo průkaz specifických protilátek proti různým virovým antigenům (hlavně EBNA a VCA) ● léčba: obvykle symptomatická 80/125 Protilátky anti-VCA a anti-EBNA ● virový kapsidový antigen (VCA) – anti-VCA IgM se objevují časně při EBV infekci a zpravidla mizí během 4 až 6 týdnů – anti-VCA IgG se objevují v časné fázi EBV infekce, vrcholí během 2 až 4 týdnů po začátku nemoci, pomalu klesají, a pak přetrvávají během zbytku pacientova života ● EBV nukleární antigen (EBNA) – protilátky proti EBNA se pomalu objevují 2 až 4 měsíce po začátku příznaků a perzistují po zbytek pacientova života 81/125 Infekční mononukleóza 82/125 Lidský herpesvirus 8 (HHV 8) ● obsahuje neobvykle velké množství genů, pocházejících z hostitelské buňky ● souvisí s onkogenitou ● primární infekce může připomínat infekční mononukleózu, ale bez heterofilních protilátek ● souvisí s Kaposiho sarkomem (tvorba lézí na těle), zvláštním typem nádoru u pacientů s AIDS ● diagnostika je zatím spíše experimentální 83/125 Přímé vs. nepřímé metody přímé ● hledáme mikroba, jeho část či jeho produkt (produktem může být například nějaký bakteriální antigen či jed – toxin) ● agens je přítomno nyní nepřímé ● hledáme protilátky ● protilátka není součástí ani produktem mikroba (produkt makroorganismu, odezvou na činnost mikroba) ● agens bylo přítomno někdy v minulosti 84/125 Přehled metod ● přímé metody – mikroskopie – elektronová (morfologie virionů), optická (buněčné kultury, CPE, inkluze) – kultivace, izolace – buněčné a tkáňové kultury – biochemické metody – u virů se nepoužívají – průkaz antigenu (pomocí protilátky) – pokus na zvířeti (izolace, průkaz toxicity) – průkaz nukleové kyseliny ● nepřímé metody – základ diagnostiky virů – KFR, HIT, VNT, ELISA 85/125 Mikroskopie ● elektronová mikroskopie: – pozorování většiny virů – nákladná a není vždy dostupná → nepoužívá se k rutinní diagnostice, ale k výzkumným účelům ● optická mikroskopie: – pozorování cytopatických efektů in vitro – pozrování buněčných inkluzí in vivo (Negriho tělíska u vztekliny) – spíše v rámci histologie – možné pozorování velkých virů (> 0,2 μm, např. poxviry) – výjimečně, pro praxi se nehodí 86/125 Izolace a kultivace virů ● zvíře se používá dnes již méně často (sající myšata) ● kuřecí zárodek (asi 10 dnů staré embryo): – pod skořápkou papírová blanka (uzavírá vzduchovou bublinu) – na papírovou blanku nasedá chorioalantoidní membrána, která ohraničuje allantoidní dutinu – v allantois se vznáší amniová dutina s vlastním embryem – žloutkový vak 87/125 Izolace a kultivace virů (2) ● směry očkování do jednotlivých struktur 88/125 Izolace a kultivace virů (3) ● směry očkování do jednotlivých struktur 89/125 Izolace a kultivace virů (4) ● amniová dutina – obklopující zárodek,používá se často, např. u virů chřipky ● allantois (odpadní váček) poskytuje větší objem tekutiny, ale je méně výživný (hodí se pro viry, které byly předtím pěstovány v amniu a adaptovaly se; využívá se při výrobě chřipkové vakcíny) ● žloutkový vak – kultivace chlamydií a rickettsií (používají se sedmidenní embrya → vak je větší) ● chorioalantoidní membrána – pěstování zejména poxvirů a herpesvirů 90/125 Izolace a kultivace virů (5) ● výsledek není na kuřecích zárodcích vidět – výjimka chorioalantoidní membrána – poky (bělavá ložiska) – využíváme schopnosti většiny virů aglutinovat erytrocyty → Hirstův test ● buněčné kultury: – „nesmrtelné“ zvířecí či lidské buňky – embryonální, nádorové – HeLa (nádor cervixu), Vero (opičí ledviny), HEL (Human Embryonic Lung) – některé viry způsobují cytopatický efekt (CPE) 91/125 Cytopatický efekt ● morfologicky patrné důsledky infekce buňky virem (ne všechny viry způsobí CPE!) ● následek narušení metabolismu a s ním spojených životních funkcí buněk ● projevy: – změny cytoskeletu: ● zakulacení buněk ● odlupování od podkladu – v důsledku změny obsahu vody a přesunu iontů: ● vakuolizace cytoplazmy ● svraštění buněk 92/125 Cytopatický efekt (2) ● total destruction: – úplná destrukce buněk monolayeru, zhuštění buněk (kondenzace chromatinu) – enteroviry (poliovirus, rhinoviry, coxsackie viry, echoviry) ● subtotal destruction: – částečná destrukce buněk monolayeru (nejsou zasaženy všechny buňky) – togaviry, pikornaviry, paramyxoviry 93/125 Cytopatický efekt (3) 94/125 Cytopatický efekt (4) ● focal degeneration: – místo generalizované infekce monolayeru → virus produkuje lokalizovaná ohniska – infekce probíhá šířením viru z buňky do buňky (ne difúzí z média) – buňky zvětšené, zakulacené, refraktilní – herpesviry, poxviry 95/125 Cytopatický efekt (5) 96/125 Cytopatický efekt (6) ● swelling and clumping: – infikované buňky se zvětšují a postupně shlukují do střapcovitých (hroznovitých) útvarů, nakonec se odloučí od podkladu – adenoviry 97/125 Cytopatický efekt (7) ● foamy degeneration (vaculalization) – produkce velkých a početných vakuol v cytoplazmě infikovaných buněk – těžko pozorovatelné bez barvení – retroviry, paramyxoviry, flaviviry 98/125 Cytopatický efekt (8) ● cell fusion (syncytium formation/polykaryon formation) – fúze plazmatických membrán čtyř a více buněk – produkce jedné velké buňky se čtyřmi a více jádry (lépe pozorovatelné po obarvení) – paramyxoviry, herpesviry 99/125 Cytopatický efekt (9) ● inclusion bodies: – obvykle místa syntézy virových proteinů nebo replikace virového genomu nebo místa vzniklá po působení viru – liší se dle infikujícího viru (různý počet, velikost a tvar, v jádře/cytoplazmě, eosinofilní/bazofilní) – pozorovatelné po obarvení (Giemsa: lze vidět fúzi buněk, vakuolizaci cytoplazmy, inkluze) 100/12 Cytopatický efekt (10) ● inclusion bodies 101/12 Průkaz viru ● výsledek izolace viru většinou není vidět (výjimky CPE, poky) ● Hirstův test (test hemaglutinace) – využíváme schopnosti viru shlukovat erytrocyty – amniová tekutina s pomnoženým virem aglutinuje krvinky → průkaz přítomnosti viru – přítomnost specifického viru provedeme přidáním protilátek proti hledanému viru → v pozitivním případě inhibujeme aglutinaci = HIT ● hemadsorpce na buněčných kulturách (chřipka) – i zdánlivě nezměněné buňky, v nichž se pomnožil virus, adsorbují na svůj povrch erytrocyty 102/12 Průkaz viru chřipky ● diagnostika má epidemiologický význam (důkaz, že epidemii působí opravdu chřipka) ● přímý průkaz (výplach z nosohltanu nebo výtěr do speciálního transportního média) – průkazem virového antigenu – izolace v amniové dutině (virus se pak prokazuje Hirstovým testem) – izolace na buňkách opičích ledvin – průkaz virové RNA pomocí PCR ● nepřímý průkaz: – klasické serologické metody – párová séra, KFR, HIT – ELISA – IgM, IgA 103/12 Úkol 1: Stanovení hemaglutinační jednotky viru chřipky v amniové tekutině (Hirstův test) ● do 8 důlků v destičce napipetujte po 25 µl fyziologického roztoku ● 1. důlek slouží jako kontrola erytrocytů ● do 2. důlku přidejte 25 µl amniové tekutiny, promíchejte a 25 µl přeneste do třetího důlku ● pokračujte v geometrickém ředění do 1:128, přebývajících 25 µl z posledního důlku odpipetujte do dezinfekčního roztoku ● do všech důlků přidejte 25 µl suspenze kuřecích erytrocytů ● reakci odečtěte po 90 minutách při lab. teplotě 104/12 Úkol 1: Vyhodnocení ● vyhodnoťte virové shlukování erytrocytů ● zakreslete výsledky a zapište jaké ředění odpovídá jedné hemaglutinační jednotce (1 HU) 105/12 Úkol 2: Izolace virů na kuřecím zárodku ● ovoskop = prosvětlovač vajec 106/12 Úkol 2: Izolace virů na kuřecím zárodku (2) ● očkování do amnia 107/12 Úkol 2: Izolace virů na kuřecím zárodku (3) ● vejce položte naležato, prosviťte v ovoskopu a naznačte tužkou okraj vzduchové bubliny (širší konec) ● odřízněte skořápku nad vzduchovou bublinou ● na papírovou blanku kápněte alkohol ● vejce opět prosviťte v ovoskopu a vyznačte pozici zárodku, resp. jeho oka ● jehlou se snažte trefit do oka kuřecího zárodku – buď přímo v ovoskopu, nebo případně mimo něj ● aplikujte inkoust (atrament) ● zvětšete si otvor ve vejci pomocí pinzety, poté vejce vyklopte do Petriho misky a sledujte výsledek 108/12 Úkol 3: Hodnocení buněčných kultur ● buněčná kultura bez a s CPE http://cmir.mgh.harvard.edu/cellbio/c ellculture.php?menuID_=122 www.herpesdiagnosis.com/diagnose.html 109/12 Úkol 4: Diagnostika parotitidy reakcí ELISA ● vyhodnoťte reakci ELISA ve třídách protilátek IgG a IgM, interpretujte 110/12 Úkol 5: Stanovení KFR protilátek proti nejčastějším původcům respiračních nákaz ● vyhodnoťte KFR ● na destičce je vyšetřena dvojice sér jediného pacienta s atypickou pneumonií ● POZ = sedimentace erytrocytů ● NEG = hemolýza ● za signifikantní považujte čtyřnásobný vzestup titru 111/12 Úkol 5: Stanovení KFR protilátek proti nejčastějším původcům respiračních nákaz (2) ● Řádek 1 – Chřipka A I 1 : 4 ● Řádek 2 – Chřipka A II 1 : 4 ● Řádek 3 – Chřipka B I – žádný titr ● Řádek 4 – Chřipka B II – žádný titr ● Řádek 5 – Parachřipka I – žádný titr ● Řádek 6 – Parachřipka II – žádný titr ● Řádek 7 – RS virus I 1 : 4 ● Řádek 8 – RS virus II 1 : 8 ● Řádek 9 – Adenovirus I – žádný titr ● Řádek 10 – Adenovirus II – žádný titr ● Řádek 11 – Mycoplasma pneumoniae I 1 : 8 ● Řádek 12 – Mycoplasma pneumoniae II 1 : 128 112/12 Úkol 5: Stanovení KFR protilátek proti nejčastějším původcům respiračních nákaz (3) ● závěry: – Mycoplasma pneumoniae je pravděpodobným původcem onemocnění – doporučena ATB léčba (např. doxycyklinem) – pacient se již za života setkal s chřipkou A a RS virem (respirační synciciální virus, pneumovirus) – pacient se nikdy nesetkal s ostatními testovanými viry 113/12 Úkol 6: Zjištění titru protilátek proti viru klíšťové encefalitidy pomocí HIT ● vyhodnoťte HIT ● na destičce jsou vyšetřena párová séra čtyř pacientů ● POZ = sedimentace erytrocytů ● NEG = hemaglutinace ● za signifikantní považujte čtyřnásobný vzestup titru ● ředění v prvním sloupci je 1:5 ● zkontrolujte kontrolu antigenu a erytrocytů v dolních rozích destičky 114/12 Úkol 6: Zjištění titru protilátek proti viru klíšťové encefalitidy pomocí HIT ● závěry: – jeden pacient se s klíšťovou encefalitidou vůbec nesetkal – dva ji prodělali (třeba i bez příznaků/možné očkovaní – jeden je pravděpodobně ve fázi akutního onemocnění (16× vzestup titru) 115/12 Úkol 11: Diagnostika HAV ● úkol 11a stanovujeme anti-HAV IgM ● úkol 11b stanovujeme celkové protilátky anti-HAV (IgM + IgG + ostatní) ● výpočet cut off: – průměr „c. o.“ důlků C1 a D1 = cut off – hodnoty 110 % cut off a více = pozitivní – hodnoty 90 % cut off a méně = negativní – hodnoty 90–110 % cut off = hraniční ● stanovení IgM + celkových protilátek je alternativou ke stanovení IgM a IgG 116/12 Úkol 12: Diagnostika HBV ● úkol 12a + b: stanovení HBsAg a HBeAg ● úkol 12c + d: stanovení anti-HBs a anti-HBe ● výpočet cut off: průměr C1 a D1 – hodnoty 110 % cut off a více = pozitivní – hodnoty 90 % cut off a méně = negativní – hodnoty 90–110 % cut off = hraniční ● HBsAg (přítomnost viru v organismu v jakémkoli období infekce ● HBeAg (vylučována pouze během replikace viru) ● anti-HBs (po prodělané infekci nebo očkovaní) ● anti-HBe (po prodělané infekci) 117/12 Úkol 13: Diagnostika HCV ● úkol 13a: PCR, elektroforéza ● úkol 13b: průkaz anti-HCV metodou ELISA ● výpočet cut off: průměr negativních kontrol (důlku B1, C1 a D1) + 0,050 – hodnoty 110 % cut off a více = pozitivní – hodnoty 90 % cut off a méně = negativní – hodnoty 90–110 % cut off = hraniční) 118/12 Dodatečné indicie k úkolu č. 14 ● Pacient C – ikterický stav trvá několik týdnů, přetím potíže neměl ● Pacient D – ikterický stav již přetrvává několik let, ale neřešil to ● Pacient E – ultrazvuk ukazuje přítomnost útvarů v oblasti žlučníku. Urobilinogen negativní, stolice acholická ● Pacient G – z anamnézy: před deseti dny byl v kontaktu s kamarádem, u kterého se později potvrdila virová hepatitida A ● Pacient H – u pacienta snížená sérová hladina ceruloplasminu a zvýšené vylučování mědi močí. Přítomna též anémie a neurologické projevy 119/12 a-HAV IgM a-HAV TOTAL HBsAg HBeAg a-HBs a-HBe HCV PCR a-HCV A + + – – – – – – B – – – – – – + + C – – + + – – – – D – + + – – +/– – – E – + – – – – – – F – – – – + + – – G – – – – – – – – H – – – – – – – – Úkol č. 14 – souhrn výsledků 120/12 Úkol č. 14 – závěr k pacientům ● A: akutní hepatitida A ● B: akutní hepatitida C ● C: akutní hepatitida B ● D: chronická (neaktivní) hepatitida B; v dětství prodělal VHA (nebo je očkován) ● E: současný ikterus zřejmě způsobily kameny; také on kdysi asi prodělal VHA (nebo je očkován) ● F: původ současné žloutenky nejasný, nutno vyšetřovat dále; prodělal VHB, vyléčen ● G: příliš čerstvá hepatitida A, ještě nemá vytvořeny protilátky ● H: Wilsonova choroba (nejde o infekci) 121/12 Úkol 15: Vyšetření protilátek antiHIV metodou ELISA ● výpočet cut off: – průměr „c. o.“ důlků C1 a D1 = cut off – hodnoty 110 % cut off a více = pozitivní – hodnoty 90 % cut off a méně = negativní – hodnoty 90–110 % cut off = hraniční ● pozitivní či hraniční séra je třeba konfirmovat (zaslat do NRL v Praze k ověření) ● v ČR registrujeme více než 2500 HIV pacientů 122/12 Úkol 16: Diagnostika virů čeledi Herpesviridae ● vyplněno za vás ● tvorba tzv. poků – viditelných struktur na chorioalantoidní membráně 123/12 Úkol 17: Praktická diagnostika infekční mononukleózy ● zhodnoťte výsledky daných pacientů proti EB-virovým antigenům a vyplňte následující tabulky s výsledky ● VCA – virový kapsidový antigen – u čerstvých infekcí jsou typické protilátky IgM a nízkoavidní IgG ● EBNA – Epstein-Barr (virový) nukleární antigen – nejsou přítomny u čerstvých infekcí, většinou jsou přítomny u latence a reaktivace ● interpretujte podle tabulky v protokolu 124/12 Po tomto cvičení byste měli umět ● klasifikovat viry na základě jejich NK a obalů, stručně popsat replikaci virů ● popsat agens způsobující atypické pneumonie, včetně diagnostických možností ● popsat viry spalniček, příušnic a zarděnek ● popsat viry hepatitid, virus HIV a herpetické viry včetně možných zdrojů nákazy ● popsat metody očkování do jednotlivých částí kuřecího zárodku ● rozeznat buněčné kultury s přítomností CPE ● správně posoudit výsledky různých laboratorních vyšetření 125/12