Bi7311: Praktikum z molekulární biologie prokaryot

Mutace a reparace

Mutanta je varianta daného kmene nebo druhu, u nichž je modifikován jeden nebo více znaků, přenášejících se do potomstva. Aby mohla být změna dědičná, musí dojít ke změnám na úrovni genetického materiálu (DNA, RNA).

Mutanty bakteriálních kmenů jsou využívány v praxi ke studiu metabolických drah, způsobu regulace genové exprese a k přípravě laboratorních kmenů vhodných pro klonování. Příprava mutantních variant má značný význam pro přípravu průmyslově a zemědělsky využívaných bakteriálních kmenů, např. kmeny s nadprodukcí určitých látek (enzymů, mastných kyselin, vitamínů, antibiotik aj.) nebo kmenů vhodných k vakcinaci.

Proces vedoucí ke vzniku nových variant daného bakteriálního kmene se označuje jako mutageneze. K mutagenezi lze použít chemické, fyzikální nebo biologické mutageny. Po působení mutageny je třeba ponechat bakterie růst, aby došlo k fenotypové expresi navozených změn v genetickém materiálu (DNA, RNA). Obvykle je mutován jen jeden řetězec DNA. Buňka tak obsahuje zásobu standardních genových produktů. Mutantní buňky proto vykazují fyziologicky normální fenotyp, dokud nedojde k vyředění produktů nemutovaných genů. Následnou replikací genomu dojde k separaci řetězce obsahujícího mutovanou variantu genu do dceřiných buněk. Prodleva v projevu mutantního fenotypu je označována jako fenotypové zdržení (lag). Tento jev můžeme sledovat u mutací navozujících rezistenci k antibiotikům (rifampicinu, streptomycinu aj.). Aby došlo k projevu rezistentního fenotypu, musí dojít k rozdělení buněk a expresi mutované varianty genu zodpovědné za navození rezistence.

Vznikne-li mutace působením určitého fyzikálního nebo chemického faktoru, mluvíme o mutaci indukované. Pokud je vznik mutace náhodný, jedná se o mutaci spontánní. Tato mutace vzniká během některého z molekulárních procesů (replikace, transkripce, rekombinace, reparace) odehrávajících se v buňce bez působení vnějších faktorů. Molekulární podstata spontánních a indukovaných mutací je stejná (delece, inzerce nebo substituce nukleotidů). Frekvence spontánních mutací je podstatně nižší než u mutací indukovaných.

Je důležité odlišovat mutaci od adaptace. Adaptace je schopnost organizmu přizpůsobit se danému prostředí. K adaptaci organizmů vlivem řady faktorů v prostředí dochází v delším časovém horizontu a proces adaptace je reverzibilní. Dědí se pouze schopnost organizmu adaptovat se na dané podmínky.

Fluktuační test

Cílem testu je prakticky prokázat, zda mutace vznikají v organizmu spontánně, nebo jako odpověď na vliv prostředí. Fluktuační test odpovídá na otázku, zda jsou mutace přítomny v organizmu před působením daným mutagenem, nebo vznikají v organizmech po vystavení tomuto faktoru.

Tedy způsobem přirozeného výběru popsaným Darwinem, nebo jak se domníval Lamarck, že se organizmy přizpůsobují pouze díky okolnímu prostředí.

Teoretické předpoklady fluktuačního testu:

  • Pravděpodobnost mutace je velmi nízká, ale stejná pro každou buňku (10-6-10-10).
  • Při fyziologické adaptaci reagují buňky na přítomnost látky v prostředí. Ta působí jako selekční faktor, který indukuje adaptivní odpověď (např. tvorbu enzymů apod.). Počet reagujících buněk v různých populacích je zhruba stejný.
  • Uvažujeme-li určitou kulturu pocházející z jedné buňky, pak na konci kultivace bude počet mutant odrážet dobu, ve které mutace vznikla (tj. ve které generaci). Vzhledem k nízké pravděpodobnosti mutace lze předpokládat, že i počty mutant v jednotlivých klonech budou rozděleny podle Poissonovy řady - to proto, že záleží na generaci, ve které k mutaci došlo. Proto se budou významně lišit počty mutant v jednotlivých kulturách a v kultuře, kde byly buňky pěstovány dohromady.