Praktikum z molekulární biologie prokaryot - Bi7311 úterý: 13:00 - 16:50; čtvrtek: 08:00 - 09:50 místnost: A25-119 I. skupina Datum č. 17.9.2019 Bezpečnost práce a rozdělení studentů do skupin, informace k cvičení pro všechny zaregistrované 24.9.2019 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten 26.9.2018 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - pokračování, II.Úloha: HGT: GTA - příprava a teorie 1.10.2019 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - přečárkování sp. mutant; II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - přenos do recipienta 3.10.2019 II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - vyhodnocení, I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - vyhodnocení 8.10.2019 III. Úloha: Konjugace; IV. Úloha: PFGE - příprava bločků z transduktant a polylysogenních lab. kmenů 10.10.2019 III. Úloha: Konjugace vyhodnocení frekvence; IV. Úloha: PFGE - instrukce k vlastnímu přístroji 15.10.2019 IV. Úloha: PFGE - štěpení bločků; V. Úloha: Konformace plazmidové DNA (pDNA bude k dispozici, dělají ELFO), PCR na geny rezistence na plazmidech; VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu: Izolace RNA Trizolem 17.10.2019 IV. Úloha:PFGE - nanášení na gel 22.10.2019 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - přepis RNA do cDNA, PCR 24.10.2019 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - ELFO; V. Úloha: PCR na geny rezistence - ELFO 29.10.2019 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech z úlohy č. II 31.10.2019 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech - vyhodnocení; kontrola vyplněných pracovních listů II. skupina Datum č. Úloha 5.11.2019 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten 7.11.2019 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - pokračování, II.Úloha: HGT: GTA - příprava a teorie 12.11.2019 I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - přečárkování sp. mutant; II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - přenos do recipienta 14.11.2019 II.Úloha: HGT - transdukce phiJB, GTA - vyhodnocení, I. Úloha: Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten - vyhodnocení 19.11.2019 III. Úloha: Konjugace; IV. Úloha: PFGE - příprava bločků z transduktant a polylysogenních lab. kmenů 21.11.2019 III. Úloha: Konjugace vyhodnocení frekvence; IV. Úloha: PFGE - instrukce k vlastnímu přístroji 26.11.2019 IV. Úloha: PFGE - štěpení bločků; V. Úloha: Konformace plazmidové DNA (pDNA bude k dispozici, dělají ELFO), PCR na geny rezistence na plazmidech; VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu: Izolace RNA Trizolem 28.11.2019 IV. Úloha:PFGE - nanášení na gel 3.12.2019 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - přepis RNA do cDNA, PCR 5.12.2019 VI. Úloha: Sestřih fágového endolyzinu - ELFO; V. Úloha: PCR na geny rezistence - ELFO 10.12.2019 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech z úlohy č. II 12.12.2019 VII. Úloha: Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR v donorových a recipientních kmenech - vyhodnocení; kontrola vyplněných pracovních listů 17.12.2019 Závěrečný test na zápočet Seznám úloh plánovaných na podzim 2019: 1. Izolace spontánních mutant metodou gradientních ploten 2. HGT - transdukce phiJB, GTA 3. Konjugace 4. PFGE 5. Konformace plazmidové DNA 6. Sestřih fágového endolyzinu (metoda izolace RNA Trizolem, přepis do cDNA, PCR) 7. Stanovení počtu plazmidů pomocí qPCR 5 Úloha 1 2 3 4 6 6 1 2 3 4 5