Plán přednášek C7895 Hmotnostní spektrometrie biomolekul pro rok 2020
Přednášky se konají online v úterý 10:00 – 11:50; případné změny budou ohlášeny předem.
Plán přednášek může být v průběhu semestru upraven.
1. 6.10. Úvod do hmotnostní spektrometrie. Stručná historie hmotnostní spektrometrie:
přehled metod a instrumentace. Základní koncepty MS (rozlišení, citlivost). Ionizační
metody a metody zavádění vzorku: Elektronová ionizace (EI)
2. 13.10. Chemická ionizace (CI). Doutnavý výboj. Indukčně vázané plazma (ICP). Ionizace
rychlými atomy (FAB). Ionizace (SIMS). Fotoionizace (PI). Plazmová Desorpce (PD)
3. 20. 10. Laserová desorpce/ionizace (LDI). Laserová desorpce/ionizace za účasti matrice
(MALDI). Sprejové ionizace: Termosprej (TSI). Ionsprej (ISI). Elektrosprej (ESI).
Desorpční elektrosprej (DESI)
4. 27. 10. Analyzátory. Základy iontové optiky. Weinův Filtr. Energetické analyzátory (E).
Hmotnostní analyzátory. Magnetický sektor (B).
5. 3. 11. Kvadrupólový filtr (Q). Iontová past (IT). Lineární past (LT). Iontový cyklotron (FTICR-MS).
Orbitrap (O). Elektrostatická past.
6. 10. 11. Time-of-flight hmotnostní spektrometr (TOF MS). Metody zvýšení rozlišení TOF
MS (reflektor, zpožděná a ortogonální extrakce).
7. 24. 11. Kolizně indukovaná disociace (CID). Tandemová MS (MS/MS). Další možnosti
disociace (ECD, ETD, fragmentace ve zdroji a za zdrojem – ISD a PSD). Techniky TOFTOF,
LIFT.
8. 1. 12. Detektory a detekční elektronika. Principy vakuové techniky. Spojení separace a
hmotnostní spektrometrie: instrumentace (on-line, off-line, čipy)
9. 8. 12. Biologické aplikace MS: proteomika. Separační techniky. Enzymatické štěpení
proteinů. Identifikace proteinů: mapování peptidů, sequence tag, accurate mass tag
10. 15. 12. Aplikace: proteiny a peptidy. Izotopové značení. Metody ICAT a iTRAQ.
Stanovení sekvence. Post-translační modifikace
11. 5. 1. Aplikace: Analýza S-S můstků. Proteiny. MS databáze. DNA, sacharidy, syntetické
polymery. Spektrometrie iontové mobility (IMS). Zobrazovací hmotnostní spektrometrie
(MSI). MS izotopových poměrů, preparativní MS. Doplňky (animace, příklady Simion).
12. 12.1. Konzultační novoroční besídka s příklady otázek u zkoušek.