Determinace a vývoj pohlavnosti Pohlavnost v životě eukaryot : - diferenciace zárodečné dráhy a příslušných gamet (včetně tvorby pohlavních orgánů) - pohlavně specifický vývin somatických buněk (pohlavní dimorfismus) - řízení transkripčních hladin chromosomů X (umlčování či zesilování exprese vázaných genů) - metylační nastavení gametického imprintingu záznamu o expresi genů v příští filiální generaci - meiosa a kombinace gamet zajišťují evolučně výhodnou heterozygotnost a variabilitu Pohlavní funkce • Hermafrodité • běžné hlavně u rostlin • Separátní individua (gonochoristé) • běžné u obratlovců • “dioecie” četná hlavně u tropických stromů • separátní květy (všechny možné kombinace) • když náklady nejsou velké a kompetice je silná, je favorizována separace Caenorhabditis elegans : vznik a dědičnost pohlaví systém X : A XX XX XO XX XO 2X:2A=1 1X:2A=0,5 primární stabilní genetické „přenašeče“ sexuálního efektory signál přepnutí stavu pohlavního fenotypu Determinační dráhy somatické pohlavnosti u C-elegans chromosomy X0-lethal negativní faktor inhibice XX koncentrace: nízká vysoká ….. vysoká XO koncentrace: vysoká nízká ….. nízká sdc-1 inhibice inhibice sdc-2 sdc-3 herma- frodit same- ček ( her-1, tra-2,3, fem-1,2,3 ) tra-1 samičí prvojádro samčí prvojádro (základová) (zárodečná) prvojádra buňka AB buňka P1 granule P rýhovací záhyb Po fertilizaci oocytu C-elegans se granule P akumulují přednostně u posteriorního pólu, v dceřinných blastomerách výhradně v linii buněk P zárodečné dráhy Po fertilizaci oocytu C-elegans se granule P akumulují v posterioru, v dceřinných blastomerách výhradně v linii buněk P zárodečné dráhy granule P a protein pie-1 somatické buňky somatické buňky somatické buňky somatické buňky somatické buňky zárodečné buňky XX Double sex female XY Double sex male Determinace pohlavnosti u drosofily posttranskripční úpravou (sex-specifický sestřih) RNA RNA samička sameček promotor genu „založení“ Sex-lethal promotor genu „udržení“ Sex-lethal časný protein Slx pozdní protein Slx funkční sestřih časný protein Slx nevzniká nefunkční sestřih pozdní protein Slx nevzniká Drosofila nemá pohlavní hormony: bilaterální gyandromorfie samčí XO část: bílé oko, miniaturní křídlo samičí XX část: heterozygotní pro oba markery (ztráta jednoho chromosomu X-wt při prvním mitotickém dělení) Bonellia viridis environmentální determinace pohlaví EPIGENETICKÁ DETERMINACE POHLAVÍ Sciara coprophilia, moucha smutnice XX/XO (specifická eliminace paternálního X, Metz 1938) samičí gamety + samčí gamety Am Xm Ap Xp Xp všechny Am Ap Xm Xp Xp zygoty samičky (X / A) samečci somatické buňky Am Ap Xm Xp Am Ap Xm zárodečné buňky Am Ap Xm Xp Am Ap Xm Xp (zde nastane nondisjunkce X chromozomů!) červec citroníkový Planococcus citri, Homoptera fakultativni heterochromatinizace paternálních chromosomů ( Uzi Nur 1990, Rochester ) PSEUDOARRHENOTOKIE selektivní umlčování či eliminace paternálních chromosomů Nettie Maria Stevens (1861-1912) Studies in spermatogenesis, with especial reference to the accessory chromosome… OBJEV POHLAVNÍCH CHROMOSOMŮ ( 1905 ) Tenebrio molitor ( F = AAXX, M = AAXY ) potemník moučný, Coleoptera Co to jsou pohlavní chromosomy ? … nesou vždy sex determinující geny, i když dráhy vedoucí ke gonochorismu/dioecii jsou odlišné … morfologicky odlišné chromosomy mezi pohlavími … dva základní systémy – XX/XY (homogametní samičky) a ZZ/ZW (homogametní samečci) … rekombinace částečně potlačena v meióze u heterogametního pohlaví … zjištěny u většiny živočišných a některých rostlinných druhů s genetickou determinací pohlaví Evoluční původ sex chromosomů Vyvinuly se z normálního párů autosomů … … evoluce provázena progresivní redukcí rekombinace mezi X a Y chromosomem. X Y Stádia evoluce chromosomu Y výskyt mutace genu samčí fertility/promotion akumulace male-prospěšných a female-nevýhodných genů v těsné vazbě na Y částečná ztráta rekombinace mezi X a Y evoluce kompenzace dávky genů vázaných na chromosom X postupná degenerace Y-chromosomových sekvencí ztráta chromosomu Y, může jej nahradit jiný chromosom alespoň jeden X je nezbytný k somatickému vývoji Evoluce pohlavních chromosomů Silene latifolia savci Rumexhmyz sex determinující alela potlačení rekombinace degenerace Y ztráta Y U většiny druhů (vejcorodých) plazů je pohlaví určováno teplotou: Temperature Sex Determination krokodýli aligátoři a ještěrky želvy hadi (GSD) teplota ( oC ) Viviparní samičky scinka Eulamprus tympanum regulují pohlavnost svých embryí: TSD (K. A. Robert & M. B. Thompson 2001) Pohlavní determinace u ptáků  homogametní pohlaví – samčí ZZ, heterogametní – samičí ZW  samičí chromozóm W obvykle rozsáhle degenerován  někteří ptáci pohlavní chromosomy vůbec nemají (ratites) ?  je pohlaví determinováno dominantním W ( savci) nebo poměrem Z/A ( drosofila) ?  existuje kompenzace dávky Z-vázaných genů ?  některé Z-geny kompenzovány nejsou, exprese jiných Z-genů je pohlavně ekvalizována  na chromosomu Z lokalizována oblast tandemových repeticí (>200 kopií 2,2-kb sekvence) s vysokým stupněm metylace CpG na obou chromozómech v embryích samečků (MHM=male hypermethylated region)  hypotetický W-faktor brání metylaci MHM-oblasti u samiček za vzniku abundantní netranslatované RNA  jde o mechanismus kompenzace dávky genů ( Xist u savců) nebo determinace pohlavnosti Ptakopysk má diploidní počet chromozomů 52 Samička: 2n = 42 + 10X Sameček: 2n = 42 + 5X + 5Y Determinace pohlaví u savců Pohlaví u savců na úrovni embrya • samečci a samičky jsou po dobu prvních 6 týdnů identičtí • embryonálními gonádami jsou ovotestes • chromosom Y indukuje vývin ovotestes v testes a tvorbu samčích hormonů • absence chromozomu Y ovlivní vývin ovotestes ve vaječníky a tvorbu samičích hormonů Chromosom Y člověka druhá pseudoautosomální oblast (PAR) ? locus SRY (kóduje testis determining factor) centromera p q pseudoautosomální oblast (PAR) heterochromatinnerekombinující oblast Y X-homologní geny testis-specifické geny Vývin gonád a příbuzných struktur u savců (vnější epitel-vaječník, vnitřní medula testis) časné indiferentní stádium sameček samička (budoucí pravé) ledviny gonáda embryonální ledviny kloaka Wolffův vývod močovod Mullerův vývod testes měchýř měchýř močovod Wolffův vývod (vas deferens) ovaria ovidukt močovod uterus vagina Mullerův vývod (ovidukt) anti-Mullerův hormon, testosteron SRY nepřítomen +Y -Y testosteron testosteronový receptor testosteronový receptor Hormon se váže na receptor uvnitř buňky Hormon-receptorový komplex se váže na chromatin Hormon-receptorový komplex aktivuje geny ke tvorbě samčích orgánů zapnut SRY gen výstelkové buňky testes intersticiální buňky testes anti-Mullerův hormon inhibuje Mullerův vývod (zabránění tvorby samičích orgánů) cholesterol testosteron stimuluje Wolffův vývod ke tvorbě samčích orgánů Klinefelter Syndrome (47, XXY) David Page (MIT), Bruce Lahn (Chicago) 1997 EVOLUCE POHLAVNÍCH CHROMOSOMŮ KOMPENZACE DÁVKY GENŮ (hermafrodit) savci Drosophila Caenorhabditis samička sameček samička sameček hermafrodit sameček poměr chromosomů X inaktivace vzrůst transkripce pokles jednoho X jediného X transkripce X transkripty poměr transkriptů X Odlišné mechanismy kompenzace dávky genů nesených chromosomem X Murray Barr Susumo Ohno Mary Lyon X-vázaný gen barvy srsti ( 1949 ) ( 1960 ) ( 1961 ) (Ne) náhodná fakultativní heterochromatinizace jednoho X Kompenzace dávky X-vázaných genů : imprinting a epigenetické umlčování ( úloha Xist-RNA, metylace DNA, acetylace a metylace histonů, chromo-proteiny Polycomb ) … vždy aktivnívždy inaktivní Inaktivovaný chromosom X je histon H3 a H4 hypoacetylován a hypermetylován Bryan Turner David Allis ( Birmingham 1993 ) ( Rochester 2001 ) MECHANISMUS INAKTIVACE SAVČÍHO CHROMOSOMU X EVOLUCE MECHANISMŮ KOMPENZACE DÁVKY X - VÁZANÝCH GENŮ (Matthew Wakefield, Melbourne 1997) CHROMOSOM X může být inaktivní, fragilní, chytrý i sexy a především je „epigenetický“ q27.3 Dědičnost mutací vázaná na chromosom X přenašečka postižený polovina synů je postižených, všichni synové jsou normální, polovina dcer jsou přenašečky všechny dcery jsou přenašečky FRAGILNÍ CHROMOSOM X ( Martin-Bellův syndrom 1943, identifikace FMR1 genu 1991) klasický model epigenetického řízení genové exprese c protein FMR1 kritický pro činnost mozku, gen X-vázaný dědičnost křížem c triplety CGG se podrobují stochastickým, sex-specifickým amplifikacím a metylacím > možná inaktivace promotoru c vznik premutace u mužů – amplifikace tripletu CGG z 50 až na 200 (přenos jen na dcery) c při oogenezi (tedy jen u žen) nastává expanze (200 až 1 000) a metylace tripletů, dochází k modifikaci FMR-promotoru c asi 50% synů takové ženy je postižených, u dcer výrazně méně (epigenetická inaktivace jednoho X - lyonizace) c expresivita a penetrance této nevyléčitelné neurovegetativní choroby jsou epigeneticky variabilní (mj. i Huntington) c normální X má 6-60 tripletů CGG v 5'UTR genu FMR1 : (CGG)10AGG(CGG)9AGG(CGG)9 c muži-přenašeči nesou premutaci mezi 60 and 200 kopiemi c M-B pacienti mají přes 200 kopií repetice David Skuse Turnerův syndrom ( London 1997 ) ( Xm0, Xp0, XXdel ) X-GEN ODPOVĚDNÝ ZA SOCIÁLNÍ CHOVÁNÍ JE MATERNÁLNĚ UMLČOVÁN ZVLÁŠTNÍ ROLE X VE VÝVOJI SAVCŮ c přítomen v jedné či dvou kopiích (XY, XX), parciální mozaiková inaktivace u samiček c dědí se křížem : dcery získávají X od obou rodičů, zatímco synové výhradně od matky c homologie X/Y malá, Y nese jen několik funkčních „X“ genů c evoluce X : nese výrazně více genů ovlivňujících inteligenci, sociální chování a reprodukční schopnosti c u mužů vyšší výskyt poruch psychiky a sociálního chování : příčinou je „hemizygotní X“ či „maternálně imprintovaný X“ c holandrická dědičnost: otec syn c haploidní (geny dominantní) c 33 znaků vázaných na Y, dosud 7 genů zmapovaných c SRY translokace/mutace vedou k sex-reverzi či intersexům c SRY není klíčovým genem: je „mladší“ než Y, u některých hlodavců zmizel c další Y-testis-determining faktory (funkční koherence) c jen několik house-keeping genů, vesměs analogy X-chromosom vázaných genů c Y je po ztrátě rekombinace s X evolučně-geneticky ruinován asi 300 milionů let (teorie čtyř inverzí) c finálním krokem evoluce bude zřejmě jeho zánik (5-10 MY) a translokace SRY na autosom (či zkáza Homo sapiens) ZKÁZA CHROMOSOMU Y Rostliny nejsou vždy bisexuální Proč studovat rostlinné pohlavní chromosomy ? • Jsou evolučně mladé …mohou nám objasnit časná stádia evoluce a degenerace sex chromosomů • Vyvinuly se mnohokrát nezávisle u krytosemenných rostlin … můžeme zjistit, které rysy jsou v evoluci pohlavních chromosomů obecné EVOLUCE DVOUDOMOSTI U ROSTLIN Pohlavní chromosomy rostlin tykvice papája silenka šťovík model rostlinného sexu : Silene latifolia Johann Gregor Mendel Letters to Carl Naegeli 1866-1873 Silene latifolia, white campion (Melandrium album) female male květní meristém +Y Sex determinace – Silene latifolia -YXX XY hermaphrodite Aberace odhalují základní funkční mapu chromosomu Y male p q asexualmale sterile male fertility male activation female inhibition Y PAR RUMEX: SAMČÍ CHROMOSOMY Y JSOU KONSTITUTIVNĚ HETEROCHROMATICKÉ CHROMOSOMY Y TVOŘÍ PERIFERNÍ HISTON - HYPOACETYLOVANÁ TĚLÍSKA Rumex acetosa Evo-Devo Vývoj (individuální vývin, ontogeneze, development) je geneticky programovaný a cyklický. Evoluce (historický vývoj, fylogeneze) není programovaná, nýbrž nahodilá. Richard B. Goldschmidt (~ 1935) : “… Evoluce spočívá ve zdědění změn individuálního vývoje …” funkční biologie = anatomie, genová exprese vývoj = změny funkční biologie / reálný čas evoluce = změny individuálního vývoje / historický čas Vývojové zákony • Von Baerův zákon (1828): “znaky vyskytující se u vyšší systematické skupiny se obvykle objeví ve vývinu dříve než znaky nižší skupiny” • Haeckelův biogenetický zákon (1866): “ontogeneze rekapituluje fylogenezu” Evoluce a ontogeneze : EVOlution and DEVelOpment fylotypová stádia obratlovců Carl Ernst von Baer (1792-1876) Baerovy zákony fylotypového stádia obratlovců (1828) [1] Obecné znaky velké skupiny živočichů se v embryu vyskytují dříve než znaky specializované [2] Méně obecné znaky se vyvíjejí ze znaků obecnějších, přičemž znaky velmi speciální se tvoří až ke konci embryogeneze [3] Embrya odlišných druhů se od sebe v průběhu individuálního vývoje stále více a více odlišují [4] Časné embryo evolučně vyššího živočišného druhu není podobné dospělci nižšího živočicha nýbrž jeho časnému embryu Ernst Haeckel ( 1834 – 1919) „ ONTOGENEZE REKAPITULUJE FYLOGENEZU „ Omezení biogenetického zákona • Dospělé znaky předků jsou jen výjimečně časnými vývojovými stádii evolučních následovníků. • Adaptace ve vývoji jsou stadium-specifické, odráží se ve výsledných fenotypech • Ne všechny nové znaky vznikají prostřednictvím terminální adice Étienne Geoffroy Jonathan Slack Saint-Hilaire (*1949, Bath) (1772-1844, Paris) druh I druh II paralogní geny genová duplikace divergence druhů další evoluce ZOOTYP Xenopus Amphibia pijavice ploštěnci Drosophila myš ZOOTYP původ „helix-turn-helix“ genů původ homeoboxových genů původ genových shluků Hox zootyp (fylotypové stádium) P r o k a r y o t a houby rostliny žahavci červi vyšší živočichové Weismann (1889): somatické změny získané v průběhu života vyšších živočichů neovlivňují reprodukční buňky či potomstvo (“Weismannova bariéra“). evoluce Ontogeneze, embryogeneze, vývojová biologie (Genotyp, transmisní genetika, zárodečná dráha ) (Soma, fenotyp) V-trojúhelník Po selekci se dědí (přenáší) genotyp, selekce se však realizuje na bázi fenotypu ! Transplantace pólové cytoplasmy může indukovat tvorbu zárodečné linie … primordiální zárodečné buňky jsou prvními odlišnými, na posteriorním konci … u drosofily, hlístice (granule P) a žab ink ellow ellow reen cytoplasma posterioru oplozeného vajíčka přenesena do anterioru jiného anteriorní buňky (s pólovou plasmou) přeneseny do jiného posterioru moucha G vytváří zárodečné buňky s genotypem G a Y migrace do gonád syncycium celularizace Heterotopní evoluce • Změny pozice (topologie), ve které jsou znaky exprimovány v průběhu vývoje • Heterotopie může vytvářet nové morfologie odlišné od drah, které vyvářejí formy předků • Heterotopie je zvýrazněna prostorem, nikoli časem • Halder et al. (1995) indukovali extra-oči na křídlech, nohách a tykadlech Drosophila ektopickou expresí "eyeless" cDNA PAX6/Eyeless exprese v muších a myších očních základech William Bateson (1861-1926) Materials for the Study of Variation (1894) … HOMEÓZA je zvláštním typem variability, kdy jeden člen opakující se série přebírá rysy, které se normálně vyvíjejí u jiného člena série … Homeotické geny dávají vznik sériově homologním strukturám Edward Lewis (1963) : pravidlo spacio-temporální kolinearity HOMEOTICKÉ GENY jeden z klíčů specifikace a diferenciace embryo dospělec moucha myš Antennapedia Bithorax komplex komplex (anterior) (posterior) BITHORAX specifikuje třetí článek hrudi a zadeček: ztráta funkce – místo kyvadélek se tvoří druhý pár křídel (více anteriorní fenotyp) ANTENNAPEDIA specifikuje mesothorax: jeho ektopická „dominantní“ exprese vyvolává tvorbu nohou na hlavě (více posteriorní fenotyp) Antennapedia wt mutant zadeček hruď hlava Bithorax Homeotické geny řídí anteriorně - posteriorní specifikaci těla WT mutace : ztráta funkce genu C, „více anteriorní“ fenotyp mutace : ektopická exprese genu B, „více posteriorní“ fenotyp Objev homeoboxu (1982) Walter Gehring (Basel) Matthew Scott (Stanford) vazba homeodomény Antennapedia na DNA Polarizační oblast pupene specifikuje končetinu podél antero-posteriorní osy exprese genu Sonic hedgehog na posteriorním konci pupene poskytuje poziční signál podél A-P osy 0,1 mm pupen kuřecí končetiny polydaktylie u člověka Exprese homeotických genů v pupenu křídla kuřete Hox-a geny jsou exprimovány podél proximo-distální osy : Hox-a 13 je nejdistálnější Hox-d geny jsou exprimovány podél antero-posteriorní osy : Hox-d 13 je nezadnější HoxB5 HoxC8 HoxC6 Evoluce homeotických (selektorových) genů • vysoký stupeň podobnosti mezi geny skupin Antennapedia a Bithorax, duplikace • všechny obsahují homeobox, 180 bp • kódují 60-amino-kyselinovou homeodoménu, která se váže k DNA • příbuzné geny nalezeny i u všech jiných živočichů, člověka i rostlin Mouellic et al.: Homeosis in the mouse induced by a null mutation in th Hox-3.1 gene. – Cell 69, 251, 1992 - nahrazení kódující sekvence genu Hox3.1 signálním genem lacZ homologní rekombinací v kultivovaných embryonálních kmenových buňkách - gen rezistence k neomycinu zajišťuje selekci homologních rekombinantů - lacZ gen je reportérový – detekuje místa exprese Hox3.1 v heterozygotních myších Hox3.1 +/- (… hybridizace s mRNA či imunobarvení) - homozygotní stav Hox3.1 -/- je semiletální, několik segmentů kostry je transformováno jako více-anteriorní (podobně u drosofily loss-of-function, mutace Bithorax) - 8. pár žeber je spojen s hrudní kostí a tvorba 14. páru na bederním obratli Homeoboxové genové shluky u metazoí jsou staré asi 1 miliardu let, prostorová/časová kolinearita částečně zachována, poprve se vyskytují na evolučním přechodu Cnidaria/Bilateralia, souvislost se vznikem tří zárodečných listů MEGACLUSTER (ancestrální ProtoHox) se postupně amplifikoval a divergoval ve tři skupiny genů (a) Hox-shluk: (Lewis 1978; 5+3 geny u drosofily, 39 genů ve 4 shlucích u savců), působí především v ektodermu (b) ParaHox-shluk: Brooke, Garcia, Holland 1998; je pouze u obratlovců, blízký Hox-shluku, řídí vývin endodermu (c) NK-shluk: Kim-Niremberg 1989; 4 geny u drosofily, též u obratlovců, řídí hlavně vývin mesodermu Časování vývojových procesů, zapínání a vypínání genů v závislosti na koncentraci a čase, prahové hodnoty HETEROCHRONNÍ GENY Heterochonie • Evoluční změny v rychlosti nebo časování vývojových událostí dávají vznik novým adultním fenotypům • Odlišné rychlosti růstu různých částí těla během vývoje organismu jsou podstatou allometrických vztahů • Heterochonie tvoří zjevnou asociaci mezi ontogenezou a fylogenezou HETEROCHRONNÍ MUTACE model řízení časového vývoje larvy hlístice C-elegans specifická stádia larválního vývoje jsou určována hladinou proteinu lin-14 koncentrace lin-14 vysoká střední nízká časový gradient lin-14 je výsledkem transkripční represe lin-14 proteinem lin-4, začínající při časném vývoji larvy standardní typ represe lin-4 lin-14 mutace, „získání“ funkce, nebo „ztráta“ lin-4 funkce lin-14 mutace, „ztráta“ funkce Heterochronní evoluce • Pedomorfie: je způsobena redukcí rychlosti vývoje znaku, což vede k juvenilním charakteristikám adultního potomstva jedince (vývin nastává časně = progeneze, nebo relativní redukce rychlosti nástupu jednoho znaku relativně k jinému = neotenie) • Peramorfie: je způsobena zvýšením rychlosti vývoje znaku vedoucího ke zvýrazněnému znaku adultního potomstva (prodloužení růstové fáze = hypermorfóza) Heterochronní evoluce • Pedomorfie: neotenie u axolotla (Ambystoma mexicanum), kde juvenilní žábra jsou zachovány až do dospělosti • Peramorfie: vzrůst velikosti paroží (hypermorfóza) u irského losa (Megaloceros giganteus) PROGERIE (progeneze) předčasné stárnutí u člověka Obvykle single-genové mutace jsou odpovědné za senescentní fenotypy, které imitují normativní stárnutí - impakt na určitý (jediný) orgán či tkáň (unimodální progeroidní syndromy), př. Alzheimer - impakt na mnohé orgány a tkáně (segmentační progeroidní syndromy), př. Hutchinson-Gilford, Werner Dr. Alois Alzheimer (1864-1915, Mnichov) Hutchinson-Gilfordův progeria-syndrom je onemocnění dětí způsobené mutací proteinu významného pro architekturu jádra: aberantní morfologie. Filamenty u periferie jádra odpovídají za udržování struktury a stability jádra, ochrana před mechanickým stresem. Lamina též udržují genomové domény, regulační funkce v expresi. wt HGPS Spontánní bodová mutace v kodonu 608 genu kódujícího protein lamin A Silentní aa-mutace aktivuje kryptické místo sestřihu RNA Mutantní protein progerin postrádá 50aa na C-konci Mění se jeho post-translační modifikace Progerie u člověka i myši, scvrklá jádra, defektní reparace DNA, genomová nestabilita Wernerův syndrom – autosomální recesívní choroba, ztráta funkce DNA helikázy, onset v dospělém věku. Helikáza hraje úlohu v DNA replikaci a rekombinaci, replikační vidlička. Pacienti trpí defektní replikací DNA, problémy s reparací, restrukturalizace chromatinu. Senescence – permanentní zástava buněčného dělení, dysfunkce telomer. Kuriozní antagonismus mezi stárnutím a rakovinou: buněčná senescence – zástava dělení – je obranným mechanismem k účinnému zastavení proliferace nádorových buněk.