C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -1C2110 Operační systém UNIX a základy programování Petr Kulhánek kulhanek@chemi.muni.cz Národní centrum pro výzkum biomolekul, Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita, Kamenice 5, CZ-62500 Brno 2. lekce / modul 4 PS/2021 Prezenční forma výuky: Rev2 C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -2Vzdálený přenos souborů ➢ scp (rsync) ➢ wget (curl) ➢ transfer dat mezi OS Unix/macOS a MS Windows (WinSCP) C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -3Vzdálené kopírování $ scp [-r] zdroj cil Příklady použití: Syntaxe: [] - možno vynechat Zdroj a cíl může být soubor nebo adresář. V případě kopírovaní adresářů je nutno použít volbu -r (recursive). Vzdálený cíl nebo host se identifikuje názvem stroje odděleného od jména souboru či adresáře dvojtečkou. [user@]hostname:[/cesta/]soubor $ scp pokus.txt wolf01.ncbr.muni.cz:/scratch/kulhanek $ scp wolf01.ncbr.muni.cz:/scratch/kulhanek/pokus.txt . Ke vzdálenému kopírovaní slouží příkaz scp. Pro kopírování většího množství dat (synchronizaci adresářů) je výhodnější příkaz rsync (C2115). C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -4Cvičení 1 1. Vytvořte kopii adresáře ~/Documents/C2110 do adresáře /scratch/username (ujistěte se, že v adresáři ~/Documents/C2110 máte nějaké soubory, např. prezentace k cvičení). 2. Překopírujte obsah adresáře /scratch/username/Documents na vzdálený stroj dle vašeho výběru do adresáře /scratch/username/wolfXX, kde wolfXX je číslo zdrojového stroje. Ke kopírování použijte příkaz scp. 3. Smažte adresáře /scratch/username/Documents a /scratch/username/wolfXX použijte dva terminály username – vaše uživatelské jméno C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -5Stahovaní souborů z webu Ke stahovaní souborů z webu lze využít příkaz wget. Vzdálené stroje musí soubory poskytovat pomocí protokolu ftp, http nebo https. $ wget [-O output_name] url url (uniform resource locator) www identifikátor souboru Příklady použití: $ wget http://www.rcsb.org/pdb/files/1SS9.pdb PDB kód struktury velké O Podobným příkazem je curl, který však umožňuje oboustrannou komunikaci se vzdáleným stroje. C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -6Cvičení 2 1. Pomocí příkazu wget stáhněte PDB strukturu 1SS9 do souboru s názvem struktura.pdb a uložte ji do adresáře ~/Documents/C2110 2. Do adresáře /scratch/username stáhněte pomocí příkazu wget instalační obraz (iso soubor) pro Ubuntu Server 18.04. Příkazem md5sum nebo sha256sum ověřte jeho kontrolní součet. 3. Instalační obraz smažte. username – vaše uživatelské jméno C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -7Transfer dat MS Windows <> UNIX Textové soubory vytvořené pod MS Windows a Linuxem (macOS) nejsou zcela kompatibilní, protože každý operační systém používá jiné kódování konce řádku. Linux (macOS): \n (line feed 0x0A) MS Windows: \r+\n (carriage return 0x0D, line feed 0x0A) Konverze kódování, viz C2110-CZ-MSWindows-M01.pdf C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -8Domácí úkoly C2110 Operační systém UNIX a základy programování 2. lekce / modul 4 -9Domácí úkol 1. Stáhněte si na svůj počítač prezentace z adresáře /home/kulhanek/Documents/C2110/Presentations pomocí WinSCP či příkazu scp. Dostupné jsou prezentace ve formátu pdf.