Představení týmů, PI, učitelů ...
https://www.recetox.muni.cz/vyzkum/lide
https://www.recetox.muni.cz/vyzkum/vyzkumne-programy
1

Environmentální chemie a modelování
§měření a modelování kontaminace ŽP
§akumulace polutantů v organismech související rizika
§nové přístupy k hodnocení komplexních environmentálních expozic – studium tzv. lidského expozomu
§vývoj nových vzorkovacích a analytických technik
§atd
2
Obsah obrázku okno, osoba, interiér, oblek Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba Popis
byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba, interiér, patro, okno Popis byl vytvořen automaticky
Obsah obrázku text, okno, osoba, interiér Popis byl vytvořen automaticky

Courses
•E5040 Environmental Compartments and their Pollution
•E0610 Trends and advances in atmospheric and total environmental chemistry
•E0330 Good Laboratory Practice
BSc theses
•Influence of sampling artefacts in the determination of gas-particle partitioning of pesticides
•Method development for the determination of nitro- and oxy-derivates of polycyclic aromatic
hydrocarbons in surface water
•Effect of pH on diffusion of organic pollutants in agarose hydrogels
•Using passive samplers for extraction of organic pollutants from textiles
•Levels of polycyclic aromatic compounds and derivatives (NPAHs, OPAHs) – spatial variation
Research topics
•Long-range atmospheric transport of pesticides
•Input of atmospheric pollutants into ecosystems (rain, dry deposition)
•Air-soil exchange of polycyclic aromatic compounds
•Air-sea exchange of persistent organic pollutants, flame retardants and polycyclic aromatic
compounds
•
•Bioaccumulation and biomagnification of POPs in aquatic food chains
•Relationship between composition and effects of complex mixtures of aquatic pollutants
•Global distribution of POPs and other organic pollutants in the hydrosphere
•Effectiveness of wastewater treatment to remove organic contaminants
•
•
•
"Chemodynamika znečištění životního prostředí“
Chemodynamics of environmental pollution" research group
branislav.vrana@recetox.muni.cz; gerhard.lammel@recetox.muni.cz
Prof. Branislav Vrana: Aquatic Chemistry
Prof. Gerhard Lammel: Air pollution / atmospheric cycling of pollutants
Cruises 2017-19
DDT in air and surface waters
26
A picture containing dirty Description automatically generated

Chemical Pollutants and Human Exposure Routes
Environmental Chemistry and Modelling
Lisa Melymuk
Assistant Professor
RECETOX, Pavilion D29, Rm. 424
lisa.melymuk@recetox.muni.cz
Veronica van der Schyff, PhD.
Postdoc
Paula Marcineková, PhD student
Petra Svobodová, PhD student
Our research work:
What compounds are found in the products and materials we use?
How do the compounds move from the material to the environment?
Where are the compounds found in the environment? Indoors? Outdoors?
When, where and how are people exposed?
Building structure
Products and activities
Outdoor environment
Drivers of environmental exposure

Předměty:
•E6050 Osud toxických látek v prostředí (Martin Scheringer)
•E4220 Modelování a interpretace environmentálních dat (Martin Scheringer, Klára Komprdová)
•E4221 Modelování a interpretace environmentálních dat –cvičení (Jiří Komprda, Klára Komprdová)
•Bi7490 Pokročilé neparametrické metody (K. Komprdová)

    Výzkumná skupina „Farmakokinetické modelování"
§Modelování distribuce toxických látek v lidském těle a jejich přestup mezi jednotlivými tkáněmi
§Identifikace hlavních expozičních zdrojů
§Predikce toxického potenciálu látek, na základě jejich strukturálních a fyzikálně-chemických
vlastností
§
Obsah obrázku osoba, interiér, patro, okno Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku okno,
osoba, interiér, oblek Popis byl vytvořen automaticky

Who? Elliott J. Price; Junior PI in Human Exposome research group
What? Non-target analysis of [human] biospecimen = measure all the small molecule organic compounds
inside us
How? Gas/ Liquid Chromatography - Mass Spectrometry = separate sample mixture, analyse mass [to
charge ratio]
Why? To provide a molecular phenotype = identify chemical agents we are exposed to & our metabolic
health status
Dried blood spot cards
Urine
Obsah obrázku text, okno, osoba, interiér Popis byl vytvořen automaticky

Environmentální toxikologie
§účinky polutantů ŽP na zdraví a ekosystémy
§mechanismy účinků kontaminantů, „Adverse Outcome Pathways“
§zaměření na látky s rostoucím významem (endokrinní disruptory, léčiva, pesticidy, látky
zpomalující hoření ...) a toxiny sinic
§rizika komplexních směsí polutantů
§pokročilé in vitro postupy (molekulární a biochemická toxikologie) i in vivo metody (vodní a
půdní); vývoj nových metod
§atd
7
Obsah obrázku zeď, osoba, interiér, oblečení Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku text,
interiér, osoba, mikroskop Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku exteriér Popis byl vytvořen
automaticky

Define footer – presentation title / department
8
Biantox – bioanalytická toxikologie
Klára Hilscherová

9
Využití biologického systému pro analýzu účinku látek/směsí z prostředí (Endokrinní disrupce)
doc. Mgr. Klára Hilscherová, Ph.D.
(klara.hilscherova@recetox.muni.cz)
T:\JN\Klarka\P1140920.JPG
Oblast zájmu:
•Studium biol. účinků látek s endokrinně disruptivním potenciálem a jejich environmentálních směsí
s vlivem na lidské zdraví
•
•
Studované matrice:
•Čisté látky
•Vnější prostředí (voda, vzduch, sedimenty, vodní květ,…)
•Vnitřní prostředí (vzduch, prach,…)
Využívané metody:
•Buněčné kultury
•Molekulární biologie (qPCR, proteomika, …)
•Analytická chemie
•Testy na rybách
•Modelování účinků směsí
Studované endpointy:
Anti/estrogenita
Estrogenový receptor (ER)
•vývoj pohlaví, řízení reprodukce, karcinogeneze, …
Anti/androgenita
Androgenový receptor (AR)
•vývoj pohlaví, samčích pohlavních charakteristik, …
Anti/retinoidní aktivita
Receptor kyseliny retinové (RAR)
•reguluje růst, morfogenezi, apoptozu a diferenciaci, …
Narušení systému thyroidních hormonů (TH)
Syntéza hormonů, transport hormonů, metabolizmus TH, interakce s receptorem
•klíčový pro vývoj nervové soustavy, kognitivní/ behaviorální změny v organizmu,…
(Neuro)development
•kognitivní/ behaviorální změny v organizmu, neurodevelopment in vitro
•
•
•

•Buněčná a tkáňová toxikologie
(Cell and Tissue Toxicology): SECANTOX

?
• Automatizace experimentů a jejich hodnocení
Bioreaktory
High-throughput
In vitro modely savčích buněk
• Studium tkáňově a orgánově specifických škodlivých účinků a jejich mechanismů
Organoidy
Epitely
• Kmenové a progenitorové buňky
• Mezibuněčná komunikace
• 3D kultivační techniky
•Nádorová promoce
•Hepatotoxicita a metabolické poruchy
•Mužská infertilita
•Poškození a onemocnění dýchací a trávicí soustavy…
•Dr. Pavel Babica
babica@recetox.muni.cz
•Dr. Iva Sovadinová
sovadinova@recetox.muni.cz
secantox.weebly.com (přehled obhájených a řešených témat)
E0230 Aplikovaná a mechanistická in vitro toxikologie
TOXIC!
Buněčné sféroidy

Obsah obrázku osoba, muž, zeď, pózování Popis byl vytvořen automaticky
atd ....
Skupina půdní env. chemie a ekotoxikologie

Jak působí látky z prostředí na lidské zdraví ?
Ondřej Adamovský, Barbora Rudzanová
13.9.2021, Bc seminar
Obsah obrázku exteriér Popis byl vytvořen automaticky

Dospělá populace
Zhoršená imunita
•Vyšší riziko
•Infekcí
•Astmatu
•Autoim. nemocí
•Méně protilátek po očkování
Přítomnost chemické látky v krvi/moči
Krevní vzorky
Bílé krvinky
Sekvenace RNA
Analýza transcriptomických dat
Identifikace dopadu chemické látky na buňky imunitního systému
Vliv chemických látek na lidské zdraví
Pregnant Woman Logo Images, Stock Photos & Vectors | Shutterstock
Placenta designs, themes, templates and downloadable graphic elements on Dribbble Baby, infant,
newborn, swaddle icon - Download on Iconfinder
File:Icon-round-Question mark.svg - Wikimedia Commons File:Icon-round-Question mark.svg - Wikimedia
Commons
Dotazníková data
File:Icon-round-Question mark.svg - Wikimedia Commons
•Reakce na očkování (titr protilátek)
•Četnost nachlazení v prvních 3 letech života
Přítomnost onemocnění z dotazníků účastníků
Alergie, astma, atopický ekzém, lupénka, lupus (SLE), revmatoidní artritida, Crohnova choroba,
ulcerózní kolitida, chronické onemocnění ledvin či dýchacích cest
Ftaláty,
Zhášeče
hoření

Environmentální zdraví
§propojování dlouhodobě sledovaných dat o environmentálních expozicích s daty o zdraví vybraných
populací
§faktory exposomu – faktory negativně ovlivňující kvalitu života
§interpretace epidemiologických a expozičních dat
§experimentální -omics metody pro studium lidského organismu
§nové biomarkery identifikace citlivých jedinců a populací
§partnerství s University College London a BBMRI ERIC
§atd
14
Obsah obrázku muž, osoba Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba Popis byl vytvořen
automaticky Obsah obrázku osoba, muž Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba, interiér
Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba, muž, okno Popis byl vytvořen automaticky Obsah
obrázku oblečení, osoba Popis byl vytvořen automaticky

doc. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA, petra.linhartova@recetox.muni.cz,
Web: Environmental Genomics
Environmentální genomika
Komplexní onemocnění
§Lidský a mikrobiální genom, jejich exprese
Asociační studie
§Kohorty pacientů a kontrol, kohorta ELSPAC
Projekty
§2020-2023 TAČR Využití nanovláken k aplikaci bioaktivních látek pomocí zubní nitě
§2020-2023 AZV ČR Molekulární etiopatogeneze apikální periodontitidy a odontogenních cyst
§2020-2023 AZV ČR Hostitelský mikrobiom ve vztahu k rozvoji Barrettova jícnu a adenokarcinomu jícnu
§2020- FN Brno Maligní transformace sliznice dutiny ústní a orální mikrobiota
§2020- FN Brno Molekulární markery pro stratifikaci rizika a precizní sekundární prevenci
komplikací u pacientů s inhalačním traumatem
Genom
Mikrobiom
Expozom
GxE (gene-environment interaction)
Fenom
RECETOX - Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí Obsah obrázku oblečení, osoba Popis byl
vytvořen automaticky

Dobrý den, děkuji za slovo, jmenuji se Petra Bořilová Linhartová, a chtěla bych Vám představit mou
výzkumnou skupinu, kterou na RECETOXu vedu od červena tohoto roku.
Výzkumná skupina nese název Enviromentální genomika, což je obor zabývající se vztahem genů a
prostředí.
Charakteristikou každého jedince je jeho genetický makeup, který je v čase ovlivňován prostředím.
Výsledkem složitých interakcí mezi geny navzájem a mezi geny a prostředím může být vznik a rozvoj
komplexního onemocnění.
Komplexní onemocnění, jakým je např. adenokarcinom jícnu, má tedy multifaktoriální etiopatogenezi
se zapojením genetických složek a negenetických faktorů, neboli vnitřního a vnějšího expozomu.
My se věnujeme studiu lidského i mikrobiálního genomu a jejich expresí v kontextu komplexních
onemocnění orofaciální oblasti, gastrointestinálního traktu a imunitního systému, což koreluje s
aktuálně řešenými projekty uvedenými na slidu.
Při experimentech využíváme metod molekulární biologie, jako je realtimePCR a sekvenování.
Design našich populačních asociačních studií je založen na srovnání určitých parametrů mezi různými
skupinami, nejčastěji mezi pacienty a zdravými jedinci. Srovnávanými parametry jsou např. frekvence
genových variant a nebo diverzita mikrobiomu spolu s faktory vnitřního a vnějšího prostředí.
Současně se snažíme také o transfer výsledků výzkumu do klinické praxe, především v rámci
personalizované medicíny se fokusujeme na individualizovanou farmakoterapii, která vychází z
genetické predispozice pacienta.
Pokud budete mít zájem o více informací, můžete se podívat na webový odkaz skupiny uvedený v
zápatí, nebo mne přímo kontaktovat. Děkuji za pozornost a možnost prezentovat.

Hlavní cíl:
Výzkum možných vlivů parametrů EXPOSOMU na lidské zdraví
Pavel Čupr
https://westeurope1-mediap.svc.ms/transform/thumbnail?provider=spo&inputFormat=jpeg&cs=fFNQTw&docid
=https%3A%2F%2Fucnmuni-my.sharepoint.com%3A443%2F_api%2Fv2.0%2Fdrives%2Fb!ZP1hO9-htkGU_7FgFZsfM0xf3
uGPyaRInWL0w8tEyqHed9bUrpjtRIEY4dGekln7%2Fitems%2F01RJHPRGJ2NMONGU2QYRELFPXRGBPAADLU%3Fversion%3DPu
blished&access_token=eyJ0eXAiOiJKV1QiLCJhbGciOiJub25lIn0.eyJhdWQiOiIwMDAwMDAwMy0wMDAwLTBmZjEtY2UwMC
0wMDAwMDAwMDAwMDAvdWNubXVuaS1teS5zaGFyZXBvaW50LmNvbUAxMTkwNGYyMy1mMGRiLTRjZGMtOTZmNy0zOTBiZDU1ZmNlZ
TgiLCJpc3MiOiIwMDAwMDAwMy0wMDAwLTBmZjEtY2UwMC0wMDAwMDAwMDAwMDAiLCJuYmYiOiIxNjA3MDcyNDAwIiwiZXhwIjoi
MTYwNzA5NDAwMCIsImVuZHBvaW50dXJsIjoiamhEUmlHQ0NmdnU5SkV3QzgvR2VlRTNseG1pRy9pZlQwNi9TV2R2d0dJcz0iLCJ
lbmRwb2ludHVybExlbmd0aCI6IjExNyIsImlzbG9vcGJhY2siOiJUcnVlIiwidmVyIjoiaGFzaGVkcHJvb2Z0b2tlbiIsInNpdG
VpZCI6Ik0ySTJNV1prTmpRdFlURmtaaTAwTVdJMkxUazBabVl0WWpFMk1ERTFPV0l4WmpNeiIsInNpZ25pbl9zdGF0ZSI6IltcI
mttc2lcIl0iLCJuYW1laWQiOiIwIy5mfG1lbWJlcnNoaXB8MTYxNDRAbXVuaS5jeiIsIm5paSI6Im1pY3Jvc29mdC5zaGFyZXBv
aW50IiwiaXN1c2VyIjoidHJ1ZSIsImNhY2hla2V5IjoiMGguZnxtZW1iZXJzaGlwfDEwMDMzZmZmOWVhYWRmMTZAbGl2ZS5jb20
iLCJ0dCI6IjAiLCJ1c2VQZXJzaXN0ZW50Q29va2llIjoiMyJ9.cUxPQnVQNUNzbEZma3FHWWpTa2pVR21RZEJXeDhHQUdqa2NGZ
lNlbURLVT0&encodeFailures=1&srcWidth=&srcHeight=&width=1617&height=1213&action=Access
Research group – Pavel Čupr: Exposure and Health Risk Assessment
https://www.tno.nl/media/13622/18-9590-figuur1.jpg?rnd=1
EXPOSOM přístup
HEAR_1
Dílčí směry výzkumu:
•Exposom v kohortových a populačních studiích
například na kohortě hasičů,
či kohortě rodin s dětmi, žijící v blízkosti zemědělských ploch s aplikací pesticidů, atd.
•Hodnocení míry expozice chemickým látkám (výzkum koncentrací – krev, moč, mléko..)
•Výzkum souvislostí s měřenými biomarkery efektu (opět měřené ve stejných matricích):
thyroidní markery, markery lipidického zdraví, genotoxicita,
DNA poškození in vivo, DNA methylace, oxidativní stres, epigenetické biomarkery,..
•Toxikokinetické modely pro hodnocení osudu těchto nebezpečných látek v lidské těle
•Tyto znalosti a nové výsledky pak používáme přímo ve výuce, BP, DP, DiP (Bc. Mgr. Ph.D.)
https://www.recetox.muni.cz/hear
Výzkumná skupina: Hodnocení expozice a zdravotních rizik
„EXPOSOME“: zahrnuje nejen expozici chemickým látkám, ale také další faktory spojené se životním
stylem, faktory psychosociálního stresu, dietárních zvyklostech, fyzické aktivity, atd., již od
prenatálního období po celou délku života.
https://www.recetox.muni.cz/hear
Doc. RNDr. Pavel Čupr, Ph.D.

Chemické nástroje pro diagnostiku a terapii
Loschmidtovy laboratoře proteinového inženýrství
17

̶Synthesis and characterization of small molecule fluorophores and their structure-properties
relationships to allow tailoring for applications
̶Near-infrared emitting fluorophores (e.g., polymethines) as a visualization modality for
non-invasive and mini-invasive diagnostics and personalized medicine
̶Conjugation of fluorophores with antibodies to allow recognition of biomarkers (e.g., of tumors),
especially in complex environments (such as tissues); applications in immunohistochemistry
̶NIR fluorescence microscopy
̶Fluorophores with additional functionalities
RECETOX, SCI MUNI, sebej@recetox.muni.cz
18
Peter Šebej (Fluorescence tools)
NIR Fluorophores as Diagnostic Tools
Diagram Description automatically generated
The team:
  Peter Šebej
  Zdeněk Farka
  Rebecca Strada
  Dorota Sklenárová
  Michal Vorba

Výzkumné infrastruktury
§Centrální laboratoře
§Populační studie CELSPAC
§Datové služby
19
Obsah obrázku osoba, zeď, oblečení, žena Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba, muž,
exteriér, stojící Popis byl vytvořen automaticky Obsah obrázku osoba, žena Popis byl vytvořen
automaticky

navazující Mgr. studium – povinné předměty
podzimní semestr
                           E1230 Základy studia environmentálních procesů, lab. cvičení, 4 kr.
                           E1250 Environmentální případové studie, přednáška + cvičení, 4 kr.
jarní semestr
                           E2221 Environmentální analytická chemie – lab. cvičení, 3 kr.

Infrastruktura populačních studií
– platforma pro biomedicínský výzkum a lidský biomonitoring


1991-2
www.elspac.cz
2021
2012
C:\Users\piler\Desktop\man-icon-black-hi.png C:\Users\piler\Desktop\man-icon-black-hi.png
C:\Users\piler\Desktop\woman.png
Populační studie CELSPAC
– výzkum exposomu – souvislostí mezi zdravím a faktory
ØSledovat různé faktory
ØPrůběh těhotenství a porodu
ØŽivotní styl, pohyb
ØStravování
ØAlkohol a kouření
ØVzdělání rodičů
ØVztahy v rodině
ØTyp bydlení
ØŽivotní prostředí atd.
ØBiologické vzorky
–
ØSledovat zdravotní stav
ØDotazníková šetření
ØAnamnestická data
ØKlinická vyšetření
ØNeklinická vyšetření
C:\Users\piler\Pictures\Saved Pictures\img_prace\tablet-computer-health-records-May15.jpg
C:\andryskova-ntb-26-07-16\A\Osobni\Fotky-iph\2017-RCX-PR-pro-TNG\upravene-zmensene-vyber\DSC_0076.
jpg

Biobanka CELSPAC
– dlouhodobá archivace biologického materiálu
ØUchování za standardizovaných podmínek
ØZachování vysoké kvality vzorku
ØDohledatelnost jednotlivých alikvotů
ØDoložitelná historie od původu, odběru, zpracování až po uložení
ØMetadata
ØPropojení s ostatními sbíranými daty

Kontakt:
Lenka Andrýsková, Ph.D.
lenka.andryskova@recetox.muni.cz
+420 549 49 3079
Pavel Piler, Ph.D.
pavel.piler@recetox.muni.cz
+420 549 49 4594
recetox.muni.cz
elspac.cz
celspac.cz