Postup Bayesovské analýzy:
1. Určete všechny hypotézy
2. Pro každou hypotézu určete apriorní pravděpodobnost
3. Získejte data
4. Zjistěte věrohodnost dat pro každou hypotézu
5. Použijte Bayesův teorém k vypočítání aposteriorní pravděpodobnosti

BEAST
(Bayesian Evolutionary Analysis by Sampling Trees)
BEAUti
BEAST
Tracer
LogCombiner
TreeAnnotator
DensiTree




























Tracer output:












ESS = Effective Sample Size






DensiTree
LogCombiner
TreeAnnotator

DensiTree: Making Sense of Sets of Trees