Modelové organismy = intenzivně zkoumaný organismus k poznání a popisování obecnějších jevů a principů např. myší modely pro výzkum rakoviny – nezajímá nás myš samotná, chceme získat poznatky a ty aplikovat v diagnostice a léčbě člověka -podle čeho se vybírají modelové organismy? - nenáročnost na pěstování/chov - krátká generační doba, dostatek potomstva - vhodnost pro studium daného jevu (vyskytuje se u organismu daný protein, dráha, …?) - znalost genomu - velikost genomu, počet chromozomů - dostupné techniky genového inženýrství Some vaccines made in the USA between 1955 and 1961 were found to be contaminated with SV40, from the growth medium and from the original seed strain. Population level studies did not show extensive evidence of increase in cancer incidence as a result of exposure,[14] though SV40 has been extensively studied. Bacillus subtilis - produkce PROTEÁZ a navíc je produkuje do exoprostoru,, např. subtilisin - serinová proteáza k výrobě Klenowova fragmentu, However, the origin of albino laboratory rats remains unclear. ... In other words, it can be presumed that hooded rats were first used in the second half of the 19th century and earlier when rats were used as laboratory animals and that an albino rat emerged as a product of the breeding of the hooded rats. Modelové organismy Lambda phage - Wikipedia PPT - Tobacco Mosaic Virus (TMV) PowerPoint Presentation, free download - ID:354271 Bakterie a E. Coli - PitnáVoda.cz Bacillus subtilis – Seznam.cz Bakteriofág lambda, virus tabákové mozaiky, virus SV40, Evoli, Bacillus subtillis, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe (3 CH, kdežto saccharomyces 16 malých), makak,… Dictyostelium discoideum – Wikipedie Saccharomyces cerevisiae - Wikipedia Maturing asci of Neurospora crassa from wild-type x histone H1 - GF P... | Download Scientific Diagram Forum / Obrázek : Huseníček rolní (Arabidopsis thaliana) | Garten.cz Tabák – proč někde zabíjí a někde léčí • Časopis ROOTS... Animals in research: C. elegans (roundworm) Nezmar hnědý – Wikipedie Dánio pruhované – Wikipedie Octomilka – Wikipedie Jak chovat slepice - poradíme přehledně a srozumitelně Myš laboratorní: Nejraději mají kolotoče! The 25 Cutest Dog Breeds - Most Adorable Dogs and Puppies Pig Z děčínské zoo utekl makak. Chytili ho v lakovně, kde ho zavřela pracovnice - iDNES.cz Arabidopsis thaliana – huseníček rolní Arabidopsis thaliana jako genetický model | Praktikum z obecné genetiky | Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Kvetení – Wikipedie A day in the life of an Arabidopsis lab - the Node Arabidopsis thaliana – huseníček rolní Arabidopsis thaliana jako genetický model | Praktikum z obecné genetiky | Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity -čeleď Brassicaceae (brukvovité) - -rozšíření: kosmopolitní, nížiny až hory, zejména slunné stráně - -poprvé popsána Johannesem Thalem v 16. století (Pilosella siliquosa) -→ C. Linné – Arabidopsis thaliana - -k pokusným účelům poprvé využita F. Laibachem začátkem 20. století - -jako model v genetice od 40. let 20. století - -význam jako genetického modelu stále roste Výhody A. thaliana jako genetického modelu -velmi krátká generační doba -lze získat několik generací do roka -kvete za 5-8 týdnů od vyklíčení, semena dozrávají 2-3 měsíce od vyklíčení -genotypy rané x pozdní Plants Use Sixth Sense for Growth Aboard the Space Station Výhody A. thaliana jako genetického modelu Astronautka Cady Coleman provádí pokusy s rostlinkami Arabidopsis v průběhu letu na STS-93 (raketoplán Columbia, 1999) Výhody A. thaliana jako genetického modelu -velmi krátká generační doba -lze získat několik generací do roka -kvete za 5-8 týdnů od vyklíčení, semena dozrávají 2-3 měsíce od vyklíčení -genotypy rané x pozdní -nenáročnost na prostor -lze pěstovat velký počet jedinců na malé ploše (až 10 rostlin/cm2) -možnost pěstování na umělých médiích -identifikace mutantů v biochemických drahách -screening rostlin na úspěšnou transgenozi Base of a lateral root emerging from the primary root body. Arabidopsis seedling expressing GFP fused to the actin bi… | Plant images, Science and nature, Seedlings Green Bandpass Barrier Filter for the SFA - NIGHTSEA Výhody A. thaliana jako genetického modelu -velký počet potomků -z jedné rostliny až několik tisíc semen! -schopnost samosprášení i cizosprášení -nejmenší genom mezi vyššími rostlinami -2005 – projekt sekvenování genomu Arabidopsis (125 MB, 26 500 genů) Genome size - Wikipedia Rostliny: cca 100 mil bp – 150 mld bp vs člověk 3,2 mld bp -malý počet chromozomů (n = 5) -2n = 10 Výhody A. thaliana jako genetického modelu -malý počet chromozomů (n = 5) -2n = 10 Mitotic chromosomes in Ophioglossum nudicaule 2n720. Bar10 mm. | Download Scientific Diagram Red Clover (Trifolium pratense) and Zigzag Clover (T. medium) – A Picture of Genomic Similarities and Differences | Semantic Scholar Výhody A. thaliana jako genetického modelu -velký počet potomků -z jedné rostliny až několik tisíc semen! -schopnost samosprášení i cizosprášení -nejmenší genom mezi vyššími rostlinami -2005 – projekt sekvenování genomu Arabidopsis (125 MB, 26 500 genů) -malý počet chromozomů (n = 5) -2n = 10 -rozsáhlá kolekce mutantních linií a přírodních ekotypů -vysoce účinná transformační metoda přípravy transgenních rostlin a T-DNA mutantů Arabidopsis: rostlina dlouhého dne – roste v podmínkách dlouhého dne - dlouhý den – 16 hodin fotoperioda – v době indukce kvetení má 9 listů v přízemní růžici - k indukci kvetení dochází za 23 dní po výsevu (raně kvetoucí, existují i pozdně, u těch jiné, i jiná gen.výbava) - krátký den – v podmínkách krátkého dne – prodlužuje se vegetativní stádium, tvoří více – 29 listů v růžici - k indukci kvetení dochází až 47 dní po výsevu ethyl-methan-sulfonát, metyl nitrosomočovina, methylmethan sulfonát, alkylační činidla) Mutace u A. thaliana -1945 Erna Reinholz – 1. kolekce indukovaných mutantů -1. použitý mutagen – paprsky X (RTG) A day in the life of an Arabidopsis lab - the Node Possible sites of alkylation of DNA bases. Grey arrows indicate sites... | Download Scientific Diagram -inzerční mutageneze – pomocí metod genového inženýrství - mutagenem je DNA Pozorování vybraných mutantních linií Col (Columbia) – standardní rostlina Změny zbarvení chm3 (chlorominuta) – dělohy a listy světle zelené, starší listy tmavší lc (lucida) – dělohy a listy žlutozelené Změny tvaru listů a v době kvetení iv (involuta) – listy drobné, složené podél hlavního žebra, velmi rané kvetení Změna celkového vzhledu rostliny cn (convoluta) - dělohy, řapíky a stonky stočené kolem své osy proti směru hodinových ručiček, listy v růžici taktéž stočené cp2 (compacta) – polozakrslé rostliny ** (Pozměněná stavba trichomů gl2 (glabra) – rudimentované a chybějící trichomy sti (stichel) – nevětvené (jednočetné) trichomy) Pozorování vybraných mutantních linií Col (Columbia) – standardní rostlina 1. chm (chlorominuta) 2. iv (involuta) 3. lc (lucida) 4. cn (convoluta) 5. cp2 (compacta) Arabidopsis: rostlina dlouhého dne – roste v podmínkách dlouhého dne - dlouhý den – 16 hodin fotoperioda – v době indukce kvetení má 9 listů v přízemní růžici - k indukci kvetení dochází za 23 dní po výsevu (raně kvetoucí, existují i pozdně, u těch jiné, i jiná gen.výbava) - krátký den – v podmínkách krátkého dne – prodlužuje se vegetativní stádium, tvoří více – 29 listů v růžici - k indukci kvetení dochází až 47 dní po výsevu Zdroje pro nadšence https://www.arabidopsis.org/ Arabidopsis: rostlina dlouhého dne – roste v podmínkách dlouhého dne - dlouhý den – 16 hodin fotoperioda – v době indukce kvetení má 9 listů v přízemní růžici - k indukci kvetení dochází za 23 dní po výsevu (raně kvetoucí, existují i pozdně, u těch jiné, i jiná gen.výbava) - krátký den – v podmínkách krátkého dne – prodlužuje se vegetativní stádium, tvoří více – 29 listů v růžici - k indukci kvetení dochází až 47 dní po výsevu Zdroje pro nadšence http://arabidopsis.info/ S96 je ekotyp, který se mutoval M2 - M jako mutagen, mutované, mutagen působí na semena a nechat vyrůst - to je M1 generace, nechat M1 sebeoplodnit a to je M2 Protokol 1 – Pozorování štěpení recesivně letálního znaku albina u monohybrida Mutace albina patří mezi chlorofylově defektní mutace Chlorofylově defektní mutace: chlorina xantha albina Charakteristika použité mutace albina: Pořadové číslo: 78 Název mutace: albina Pozadí: S96 Použitý mutagen: X 12kr Generace: M2 Fenotyp: klíční rostlinky bílé, bez chlorofylu, homozygotně letální S96 je ekotyp, který se mutoval M2 - M jako mutagen, mutované, mutagen působí na semena a nechat vyrůst - to je M1 generace, nechat M1 sebeoplodnit a to je M2 Protokol 1 – Pozorování štěpení recesivně letálního znaku albina u monohybrida