Úvod do molekulového modelování
Týden 3
6. Statistická termodynamika
- Termodynamika a modelování
- Časový vs souborový průměr
- Kanonický soubor
- Partiční funkce a termodynamické vlastnosti
7. Kvantová mechanika I
- Duální charakter částic
- časově závislá a časově nezávislá Schrödingerova rovnice
- Hamiltonův operátor a vlnová funkce
- Princip neurčitosti
- Interpretace QM
8. Kvantová mechanika II
- Bornova-Oppenheimerova aproximace
9. Model
- Volba modelu, velikost, typ prostředí
- Experimentální struktury jako předloha modelu (kvalita, B-faktor)
- In silico modely, 2D a 3D struktury, virtuální screening