logo-IBA logomuni Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Hřebíček, J. Kalina Anketa Obsah kurzu Studijní materiály Harmonogram výuky Požadavky k ukončení 0. Organizace výuky E3101 Úvod do matematického modelování logo-IBA logomuni Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Hřebíček, J. Kalina Kontakt Jiří Kalina D29 místnost 123 (Recetox) kalina@mail.muni.cz — — logo-IBA logomuni 3 1. Úvod do matematického modelování a jeho členění. 2. Definice problému, biologický model, zjednodušující předpoklady, počáteční a okrajové podmínky. 3. Návrh matematického modelu, posouzení jeho korektnosti a návrh způsobu řešení. 4. Naprogramování modelu s využitím ICT a jeho přibližné řešení na počítači. 5. Vyhodnocení přibližného řešení s využitím počítačové vizualizace a odhad chyby přibližného řešení. Původní osnova kurzu logo-IBA logomuni 4 6. Metodika postupu zpřesnění matematického modelu s využitím moderních ICT a zdrojů informací (Maplesoft, Internet, elektronické knihovny, atd.). 7. Příklady vybraných biologických problémů a metodika jejich řešení 8. Zadání projektu 9. Diskuse výsledků, vliv zjednodušujících předpokladů na výsledek, vizualizace a animace (Maple) výsledků. Původní osnova kurzu logo-IBA logomuni Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Hřebíček, J. Kalina Výukové materiály —E-learningová učebnice: http://portal.matematickabiologie.cz/index.php?pg=analyza-a-modelovani-dynamickych-biologickych-dat --uvod-do-matematickeho-modelovani starší, obsahuje navíc některé neprobírané okruhy. —Učebnice v pdf: http://is.muni.cz/do/rect/el/estud/prif/js11/maple/web/mat_model.pdf doposud základní výukový materiál kurzu. —Prezentace v pptx: hlavní zdroj, postupně budou vkládány do ISu vždy po skončení přednášky/cvičení. Společně s přednáškou by měly být dostatečným materiálem pro přípravu ke zkoušce. logo-IBA logomuni —12. 9. 2022 úvod do úvodu do matematického modelování; —19. 9. 2022 základní definice, klasifikace modelů, úvod do R; —26. 9. 2022 úvod do R; — 3. 10. 2022 odpadlo —10. 10. 2022 pokračování R; —17. 10. 2022 růst populace organizmů; modifikace modelu; implementace v R; —24. 10. 2022 modelování nejistoty, inverzní problém; —31. 11. 2022 populace pod tlakem predátora; — 7. 11. 2022 klasifikace modelů, modely více populací (Lotka-Volterra); —14. 11. 2022 modelování více populací v R (dravec × kořist); —21. 11. 2022 maticové modely, —28. 11. 2022 práce s Metacentrem, zdroje; — 5. 12. 2022 fuzzy modely, diskuze, kontrola domácích úkolů; —12. 12. 2022 rezerva, diskuze, zadání vánoční úlohy; —Termíny zkoušky: 17. 1. 2023, 24. 1. 2023, 31. 1. 2023; Harmonogram výuky logo-IBA logomuni Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Hřebíček, J. Kalina Podmínky pro splnění zkoušky —100 minut přednášky a cvičení osobně a na MS Teams jednou týdně. —Účast je nepovinná, ale zapisuje se, zadání domácích úkolů bude probíráno jen na cvičeních. —Podklady ke cvičením a studijní materiály budou postupně zveřejňovány v ISu + pracovní sešity a řešení. —Podmínkou je získat alespoň 60 % bodů za semestr, tj. 133 b. —Během semestru bude zadáno 5 domácích úkolů po 22 bodech + vánoční úloha za 44 bodů. —Na závěr písemný test na 100 minut (pokud bude možnost, lze i více) za 68 bodů. logo-IBA logomuni Vytvořil Institut biostatistiky a analýz, Masarykova univerzita J. Hřebíček, J. Kalina Podmínky pro splnění zkoušky —Klasifikace zkoušky: A 92 %–100 % 203–222 bodů B 84 %–91 % 185–202 bodů C 76 %–83 % 167–184 bodů D 68 %–75 % 149–166 bodů E 60 %–67 % 133–148 bodů F 0 %–59 % 0–132 bodů