1) Spočtěte molárni koncetrace kyseliny a báze potřebné pro namýchaní 1L, 100
mM fosfátového pufru o pH=7.3. (pKa (H3PO4<->H2PO4
)
= 2.16; pKa (H2PO4
<->
HPO4
2)
= 7.21; pKa (HPO4
2<->
PO4
3-
)=12.6).
2) PDB formát se ve strukturní biologii používá pro
A) zápis struktury molekul ve formátu XYZ (kartézské souřadnice)
B) zápis struktury molekul ve formátu interních souřadnic
C) zápis sekvenačních dat proteinů a nukleových kyselin ve formátu primární
struktury (sekvence)
3) Která z uvedených látek bude slabší kyselinou (zakroužkujte)
4) Které z uvedených párů sloučenin budou mít stejný bod tání?
5) Dominantním kationtem v cytosolu je:
A) K+
B) Na+
C) Mg2+
D) Ca2+
E) Cl-
6) Kyselá hydrolýza proteinů nastává při
A) pH < 4
B) pH > 7
C) pH > 10
D) proteiny nehydrolyzuji
7) Cytosol je svoji povahou
A) oxidující
B) redukující
C) nemá oxidačně redukční vlastnosti
8) pI odpovídá takovému pH při němž protein bude mít
A) nulový náboj
B) Záporný náboj
C) Kladný náboj
D) bude tzv. zwiter-iontem = bude mít stejný počet záporných a kladných nábojů
9) Když bude pH roztoku rovno pI proteinu
A) protein bude nejvíce rozpustný v danem pufru
B) protein bude mít největši možný náboj
C) protein bude nejméně rozpustný
D) protein nebude vykazovat žádnou elektroforetickou mobilitu
E) protein bude vykazovat maximalní elektroforetickou mobilitu
10) Ve srovnanim s roztokem o pH =8 má roztok o pH = 7
A) 1x nižší koncetraci H+
B) 10x vyšší koncetraci H+
C) 10x nižší koncetraci H+
D) 1000x vyšší koncetraci H+
11) merkaptoethanol a dithiothreitol (DTT) jsou
A) redukující činidla a přidávají se k roztokům nukleových kyselin pro eliminaci
vodíkových vazeb
B) jsou oxidující činidla a přidávají se k roztokům proteinů pro stabilizaci
disulfidických můstků
C) jsou oxidující činidla a přidávají se k roztokům proteinů pro destabilizaci
disulfidických můstků
D) jsou používány jako oxidující činidla štepící glykosidickou vazbu v roztocích
nukleových kyselin
12) Zvýšením koncetrace soli ve vodném roztoku
A) oslabím interakce náboj-náboj
B) zeslím interakce náboj-náboj
C) iontová síla nemá na nábojové interakce žádný vliv
13) Oligonukleotid v roztoku o pH = 7.0 bude ve stejnosměrném elektrickém poli
migrovat směrem k
A) katodě
B) anodě
C) nebude vykazovat žádnou mobillitu
14) Protein mající pI = 10 a jsoucí v vodném roztoku o pH=7 bude bude ve
stejnosměrném elektrickém poli migrovat směrem k
A) katodě
B) anodě
C) nebude vykazovat žádnou mobillitu
15) Urea a guanidine jsou
A) denaturační činidla použitelné jak pro nukleove kyseliny tak i proteiny
B) jsou to oxidačně-redukční činidla použitelné jak pro nukleove kyseliny tak i
proteiny
C) denaturační činidla použitelné pouze pro proteiny
16) SDS do roztoku proteinu
A) dodame proteinu kladny naboj
B) SDS s protein neinteraguje
C) dodame proteinu zaporny naboj
D) nedodame proteinu zadny naboj, ale rozvolnime jeho 3D strukturu – SDS je
detergent
E) nedodame proteinu zaporny naboj a zaroven rozvolnime jeho 3D strukturu – SDS
je detergent
17) ve foldovaném stavu jsou hydrofóbní aminokyseliny převážně
A) na povrchu (na rozhraní protein-vodný roztok) proteinu
B) uvnitř proteinu
18) tzv. “intrinsically disordered proteins/natively unfolded proteins” mají
nadbytek
A) polárních a nabytých aminokyselin
B) nepolarních a hydrofobních aminokyselin
C) malých a flexibilních aminokyselin
19) Objem savci buňky je řádově
A) pL
B) nL
C) větší než bakteriální buňky
20) Buněčné jádro zaujímá
A) 50% buněčného objemu
B) 70% buněčného objemu
C) 10% buněčného objemu
21) Doba potřebná pro rozdělení bakteriální buňky je
A) ~ 30 minut
B) ~ 1hodiny
C) ~ 15 hodin
D) > 3 dny
22) Priradte jednotlive fyzikalni procesy odpovidajicim casovym skalam v [s]
1) rotacni difuze protein ~ 70 kDa
2) atomove vibrace
3) vazba ligandu
4) enzymaticka katalyza
5) proteinovy folding
6) allostericka regulace
A) 1
B) 10-14
-10-12
C)1-103
D) 10-8
-10-9
E) 10-6
-10-3
F) 10-3
-1