Chí-test (Chí-kvadrát, χ2, Test dobré shody) Picture 18 Picture 19 Picture 20 Picture 21 Chí-test (Chí-kvadrát, χ2, Test dobré shody) - slouží ke statistickému testování shody mezi očekávanými a pozorovanými hodnotami - - pro naše genetické účely – testování shody mezi očekávanými a pozorovanými počty jedinců v jednotlivých fenotypových nebo genotypových třídách = testujeme, zda se pozorovaný fenotypový/genotypový poměr shoduje s teoretickým (očekávaným) χN2 = ∑ (xi – ei)2 ei xi = naměřené (zjištěné) hodnoty ei = očekávané hodnoty N = počet stupňů volnosti, N = n – 1 n = počet sčítanců (počet fenotypových/genotypových tříd) Chí-testem vypočítaná hodnota se pak srovnává s kritickou hodnotou odpovídající zvolené hladině významnosti (nejčastěji 5 %) při daném počtu stupňů volnosti (viz příklad) Příklad: V populaci F2 bylo 404 jedinců A- a 129 aa. Vypočítejte pomocí testu χ2, zda se tento číselný poměr shoduje s ideálním poměrem 3:1. Vsuvka: zápis křížení P: AA x aa F1: Aa x Aa F2: AA : Aa : aa genotypový štěpný poměr: 1 : 2 : 1 fenotypový štěpný poměr: 3 : 1 F2: A_ : aa Zápočtové příklady Segregace vloh P: A_ x A_ F: A_ : aa P: Aa x Aa Příklad: V populaci F2 bylo 404 jedinců A- a 129 aa. Vypočítejte pomocí testu χ2, zda se tento číselný poměr shoduje s ideálním poměrem 3:1. Celkem je 533 jedinců a testujeme poměr 3:1 533/4 = aa x 3 = A- χN2 = (404 – 399,75)2 399,75 + (129 – 133,25)2 133,25 = 0,045 + 0,136 = 0,181 = 0,18 Kritická hodnota na 5% hladině významnosti pro 1 stupeň volnosti je 3,84 viz tabulka N = n-1 = 2 – 1 = 1 χN2 = ∑ (xi – ei)2 ei xi: 404 : 129 ei: 399,75 : 133,25 Picture 4 Picture 8 Hodnotou 3,84 si můžeme představit jako hladinu: 3,84 hodnota chí-testu shoda pozorovaných a očekávaných počtů zamítáme shodu potvrzujeme shodu Naše hodnota vypočítaného testu byla 0,18 Potvrdili jsme tedy shodu v počtu pozorovaných a očekávaných fenotypů v poměru 3:1. Příklad: V populaci F2 bylo 404 jedinců A- a 129 aa. Vypočítejte pomocí testu χ2, zda se tento číselný poměr shoduje s ideálním poměrem 3:1. Celkem je 533 jedinců a testujeme poměr 3:1 533/4 = aa x 3 = A- N = n-1 = 2 – 1 = 1 χN2 = (404 – 399,75)2 399,75 + (129 – 133,25)2 133,25 = 0,045 + 0,136 = 0,181 = 0,18 Kritická hodnota na 5% hladině významnosti pro 1 stupeň volnosti je 3,84 N = n-1 = 2 – 1 = 1 χN2 = ∑ (xi – ei)2 ei xi: 404 : 129 ei: 399,75 : 133,25 zjištěná hodnota 0,18 < 3,84, tedy na 5% hladině významnosti nebyl nalezen rozdíl mezi zjištěnými a předpokládanými hodnotami a tedy byl potvrzen štěpný poměr 3 : 1 Picture 4 Picture 8 0,18 Příklad 2 zápočtových příkladů na Chí-test Pokus: Ověřte, že při tvorbě gamet dochází k nezávislému rozchodu alel do gamet (princip segregace), tedy že u monohybrida vznikají dva druhy gamet se stejnou četností. Pokus č. 1: Ověření štěpného poměru 1:1 Pokus: Ověřte, že při tvorbě gamet dochází k nezávislému rozchodu alel do gamet (princip segregace), tedy že u monohybrida vznikají dva druhy gamet se stejnou četností. Použijte minci, jejíž líc představuje dominantní alelu a rub recesivní alelu monohybrida Aa. Picture 7 Picture 8 Picture 9 Pokus č. 1: Ověření štěpného poměru 1:1 Pokus: Ověřte, že při tvorbě gamet dochází k nezávislému rozchodu alel do gamet (princip segregace), tedy že u monohybrida vznikají dva druhy gamet se stejnou četností. Použijte minci, jejíž líc představuje dominantní alelu a rub recesivní alelu monohybrida Aa. Hoďte mincí 100x a poznamenejte si kolikrát padne líc a kolikrát rub. Pokus č. 1: Ověření štěpného poměru 1:1 IMG_5086.jpeg IMG_5089.jpeg RPReplay_Final1602500323.mov Pomocí χ2-testu ověřte podíl 1:1. Pokus: Ověřte, že při tvorbě gamet dochází k nezávislému rozchodu alel do gamet (princip segregace), tedy že u monohybrida vznikají dva druhy gamet se stejnou četností. Použijte minci, jejíž líc představuje dominantní alelu a rub recesivní alelu monohybrida Aa. Hoďte mincí 100x a poznamenejte si kolikrát padne líc a kolikrát rub. Pomocí χ2-testu ověřte podíl 1:1. Picture 7 Picture 8 Picture 9 Pokus č. 1: Ověření štěpného poměru 1:1