Tříbodové mapování Picture 6 Picture 10 1)Odstranění rodičů v pokusu s octomilkou 2)Tříbodové mapování - postup 3)Zápočtové příklady na Tříbodové mapování Picture 5 Picture 6 Pozorování dědičnosti znaku white v pokusu s octomilkou Picture 3 Picture 4 Picture 5 Picture 6 Odstranění rodičů Vyhodnocení generace F1 Vyhodnocení generace F2 Odstranění rodičů 1. týden 2. týden 3. týden 4. týden 1)Odstranění rodičů v pokusu s octomilkou 2)Tříbodové mapování - postup 3)Zápočtové příklady na Tříbodové mapování Picture 5 Picture 6 - vazbové mapování – vazbová skupina, geny ve vazbě Tříbodové mapování Obrázek 1 Obrázek 2 geny A a B jsou volně kombinovatelné geny A a B jsou ve vazbě Zakreslení genů může být v písemce!! Vazba cis trans!! - vazbové mapování - při vazbě dvou genů neplatí volná kombinovatelnost = odchylky od fenotypového štěpného poměru 9:3:3:1 v F2 a 1:1:1:1 v B1 generaci = pokles v četnosti crossing overu Tříbodové mapování Picture 8 Picture 11 B1: zpětné analytické křížení!! - vazbové mapování - při vazbě dvou genů neplatí volná kombinovatelnost = odchylky od fenotypového štěpného poměru 9:3:3:1 v F2 a 1:1:1:1 v B1 generaci = pokles v četnosti crossing overu Tříbodové mapování Picture 8 Picture 11 Picture 12 498C25C - vazbové mapování - při vazbě dvou genů neplatí volná kombinovatelnost = odchylky od fenotypového štěpného poměru 9:3:3:1 v F2 a 1:1:1:1 v B1 generaci = pokles v četnosti crossing overu - čím jsou si geny blíže, tím menší je síla vazby, tedy vzniká méně crossing-overů - síla vazby = vzdálenost mezi geny: 1 % crossing-overu = 1 cM (centimorgan) Tříbodové mapování Picture 11 Picture 11 Tříbodové mapování Tříbodové mapování Tříbodové mapování Tříbodové mapování Tříbodové mapování Tříbodové mapování Tříbodové mapování Podmínky pro tříbodové mapování: 1) jeden z rodičů je heterozygot ve všech třech mapovaných genech 2) druhý rodič je recesivní homozygot ve všech třech mapovaných genech 3) k dispozici máme dostatečně velké potomstvo těchto rodičů tak, abychom zachytili i potomky s dvojnásobným crossing-overem Picture 4 Picture 5 Zpetné křížení – troj heterozygot X troj homozygot Postup: 1) Rozdělení jedinců do tříd podle četnosti crossing-overu - DCO (double c.-o.), SCO (single c.-o.) a NCO (non c.-o. – rodičovská kombinace). NCO + br f 339 an + + 355 78,95 % SCO + + + 88 an br f 55 16,27 % SCO + + f 21 an br + 17 4,32 % Picture 92 DCO + br + 2 an + f 2 tedy 4 jedinci z 879, tj. 0,46 % % cros overu = mapovací jednotka DCO + br + 2 an + f 2 0,46 % NCO + br f 339 an + + 355 78,95 % SCO + + + 88 an br f 55 16,27 % SCO + + f 21 an br + 17 4,32 % 2) Stanovení pořadí genů na chromozomu - u rodičovského uspořádání provedeme dvojitý crossing-over a porovnáváme, zda-li se takto vzniklé kombinace skutečně vyskytly v DCO potomstvu testujeme: prohodíme pozice genů an a br a testujeme: zaměníme tedy pozice genů an a f a testujeme: Picture 29 Picture 31 Picture 32 Postup: B f 1 – nová rodičovská NCO!!! 3) Výpočet vzdálenosti genů mezi sebou. - vzdálenost mezi dvěma geny určíme jako součet četností SCO mezi těmito dvěma geny a DCO. br - f - nejdříve si určíme správnou třídu SCO, testujeme tedy jednoduchý c.-o. na rodičovském uspořádání: - vzdálenost určíme jako: SCO (br + an) + DCO = 4,32 + 0,46 = 4,78 cM f – an SCO (br f an) + DCO = 16,27 + 0,46 = 16,73 cM Picture 11 4) Obrázek genetické mapy: DCO + br + 2 an + f 2 0,46 % NCO + br f 339 an + + 355 78,95 % SCO + + + 88 an br f 55 16,27 % SCO + + f 21 an br + 17 4,32 % Pořadí NCO br f + + + an Picture 22 Postup: B –f celková četnost sco a dco Picture 11 4) Obrázek genetické mapy: 1)Odstranění rodičů v pokusu s octomilkou 2)Tříbodové mapování - postup 3)Zápočtové příklady na Tříbodové mapování Picture 5 Picture 6 Zápočtové příklady - Příklad 2a) - počítání Poznámky k příkladům IMG_0849.jpeg IMG_0850.jpeg Zkontrlovat B1 křížení!!! Dostatečné počet jedinců = 8 tříd! Zápočtové příklady - Příklad 3 - upozornění Picture 4 c = pozorovaná četnost DCO / očekávaná četnost DCO (SCO x SCO) Poznámky k příkladům Zápočtové příklady - Příklad 4 - upozornění Picture 4 četnost c.o. vzdálenost 0,227 22,7 cM Poznámky k příkladům Picture 4 Picture 5 Poznámky k příkladům Zápočtové příklady - Příklad 4 - upozornění