Bi6589 Laboratorní a bioinformatické metody rostlinné biosystematiky Náplň předmětu •Aplikace různých taxonomických metod na řešení vybraného problému. •Analýza a interpretace získaných dat •Souborná zpráva • Literatura • Bureš P., Šmerda J., Michálková E., Šmarda P., Knoll A. & Vavrinec M. (2018): Cirsium greimleri: a new species of thistle endemic to the Eastern Alps and Dinarides. – Preslia 90: 105–134. •DOI: 10.23855/preslia.2018.105 • •Michálková E., Šmerda J., Knoll A. & Bureš P. (2018): Cirsium ×sudae: a new interspecific hybrid between rare Alpine thistles. – Preslia 90: 347–365. •DOI: 10.23855/preslia.2018.347 • •Bureš P., Del Guacchio E., Šmerda J., Özcan M., Blizňáková P., Vavrinec M., Michálková E., Veselý P., Veselá K. & Zedek F. (2024): Intergeneric hybrid origin of the invasive tetraploid Cirsium vulgare. Plant Biology 26: 749-763. •https://doi.org/10.1111/plb.13653 • BOZP a PO •BOZP = Bezpečnost a Ochrana Zdraví při Práci •PO = Požární Ochrana • •Seznámení se zásadami práce v laboratoři Sběr vzorků aneb co je nutné vzít v úvahu •PROČ sbírat •JAK sbírat (design experimentu) •JAK popisovat •CO sbírat •DO ČEHO sbírat •JAK skladovat • Sběr vzorků – PROČ sbírat •Jaký je účel sběru (jakou otázku si kladu) •Stanovit si i náhradní cíl experimentu • •Vytvořit robustní design experimentu (možnost opakování) •Jednotné, jednoduché a intuitivní kódování • • Sběr vzorků – JAK sbírat Sběr vzorků – JAK sbírat •POPULACE •Kontinuální přenos genetického materiálu (± kam doletí opylovači, pyl, části rostlin, apod.) •Bariéry = pohoří, lesy, řeky; ale i velké vzdálenosti apod. •Výjimečné populace vodních toků •Reprezentativní velikost populace • • • • Sběr vzorků – JAK sbírat •LOKALITA •Relativně homogenní zájmové území (z pohledu biotických a abiotických faktorů) • • • Sběr vzorků – JAK popisovat •Centropen (PERMANENT) vs. tužka •Popis vzorků •Pečlivá evidence vzorků (zápisník) •GPS souřadnice + slovní popis Sběr vzorků – DO ČEHO sbírat •Živý materiál (ZIP pytlík) •Fixovaný materiál (fixáž) •Suchý materiál (silikagel, noviny – herbář) • • • Sběr vzorků – JAK skladovat •Krátkodobé skladování •Chladnička (6°C); cca dny - •Dlouhodobé skladování •Silikagel (RT); cca měsíce •Mraznička (-20°C); cca měsíce •Herbář (RT); cca týdny – měsíce •Fixáž (RT, 6°C); měsíc – roky •Hlubokomrazící box (-80°C); roky