Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-1
Experimentální metody biofyziky laboratorní
přístupy a exkurze v oblasti přírodních věd
Ctirad Hofr
LifeB - Laboratoř interakce a funkce essenciálních biomolekul
FGP Funkční genomika a proteomika NCBR - Národní centrum výzkumu
biomolekul
labLifeB.org
labLifeB.org
Calorimetry of biomolecules / NCBR / lablifeB.org2-2
Přehled
• Přednášky jsou vedeny odborníky na prezentované metodologie
• Sami rozhodnete, které metody by měly být zařazeny do přednášek
• Využití multimediálních učebních pomůcek během přednášek
• Řešení praktických případových studií
• Exkurze do soukromých společností, které se zabývají výzkumem a vývojem.
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-3
Koncepce : laboratorní přístupy a exkurze
v oblasti přírodních věd.
̶ Přednášky vedou odborníci na prezentovanou metodologii.
̶ Vy rozhodnete, které metody by měly být zahrnuty do přednášek.
̶ Využití multimediálních výukových nástrojů během přednášek.
̶ Řešení praktických případových úloh.
̶ Exkurze do komerčních společností, které se zabývají výzkumem
a vývojem.
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-4
Proč biofyzikální metody?
̶ Biofyzikální metody nám poskytují kvantitativní data
̶ Používání čísel usnadňuje vysvětlení různých jevů
̶ Srovnání různých biologických systémů
What is biophysics? https://youtu.be/T5EWTFEbrlc
61st Biophysical meeting, New Orleans, Louisiana, US - South East
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-5
Sylabus přednášek a exkurzí
̶ 1.10. Uvod - přehled metod - zjištění konkrétního zájmu
̶ 8.10. Chromatografie + Biokalorimetrie polymerů
̶ 15.10.Elektroforéza + Western blot
̶ 22.10. Fluorescence - FLIM - FRET
̶ 29.10 Exkurze 2 BIOVENDOR
̶ 5.11. Elektronová mikroskopie Pavel Plevka
̶ 12.11. Exkurze 1 TESCAN Cirkulární dichroismus DNA a proteinů - Radka Chaloupkova E
̶ 19.11. Krystalografie a SAXS Tom Brom
̶ 26.11. Průtoková cytometrie Karel Souček
̶ 3.12. Cirkulární dichroismus DNA a proteinů - Radka Chaloupkova
̶ 10.12. Exkurze 2 ThermoFisher
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-6
Obsah přednášky I
̶ Chromatografie
̶ Elektroforéza + Kalorimetrie biopolymerů
̶ Fluorescenční spektroskopie - FLIM , FRET, FCCS
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-7
Exkurze I – BioVendor 29.10.
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-8
Obsah přednášky II
̶ UV/Vis, infračervená a Ramanova spektroskopie
̶ Cirkulární dichroismus DNA a proteinů
̶ Kapalinová chromatografie biomolekul
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-9
Exkurze II – TESCAN 12.11.
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-10
Obsah přednášky III
̶ Elektronová mikroskopie
̶ RTG krystalografie a SAXS biomolekul
̶ Průtoková cytometrie a třídění buněk
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-11
Exkurze III ThermoFisher 10.12.
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-12
Socrative Student app
https://b.socrative.com/login/studentRoom Name HOFR
https://b.socrative.com/login/student
Room Name HOFR socrative.com/apps
socrative.com/apps
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-13
Jak bych mohl-a přispět?
A. Položit otázku
B. Navrhnout zajímavá videa
C.Připravit případové studie nebo úkoly
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-14
Biofyzika na ISS
Na ISS lze krystalizovat proteiny, aby bylo možné zjistit, jak jsou molekuly
strukturované, a získat tak nové informace o tom, jak fungují v těle a jak lze vyvíjet
léky na léčbu lidských onemocnění. Tento výzkum se provádí díky
mikrogravitačnímu prostředí Mezinárodní vesmírné stanice, kde gravitace, konvekce
a vztlak nebrání krystalizaci v takové míře, jako na Zemi.
https://www.nasa.gov/mission_pages/station/research/experiments/explorer/Investig
ation.html?#id=7729
Flying through ISS
https://youtu.be/Mv-9fOAPAiU
Introduction - Biophysics / NCBR / lablifeB.org1-15
Hlasovani Slido
Jakou přednášku, co není v sylabu, by bylo dobré zařadit?
̶ NMR
̶ přednáška s firmami + AFM
̶ SPR, DLS
̶ chromatografické metody
̶ +firmy
̶ Přednášky s firmami
̶ Elektroforetické metody
̶ SAXS/SANS
̶ elektroforéza
̶ elfo