Bioinformatika I
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Bioinformatika I
Info
Období
podzim 2020

Přednášející: Dr. Matej Lexa, FI C506.
Konzultační hodiny: Čt 10:00 - 10:50, nebo dle domluvy
Podzim 2020. Bude se scházet 2 (někdy 3) h týdne (Pá 12:00-13:50 (někdy 14:50), MS Teams).

Kurz je vstupním kurzem do oblasti bioinformatiky pro studenty nebiologických oborů a nemá zvláštní předpoklady.

Klade si za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. V současnosti dochází k prudkému rozvoji bioinformatiky a aplikovaných přístupů převážně v biologii, chemii a medicíně, které vyžadují bioinformatické myšlení a schopnosti (práce s velkým množstvím biologických dat s využitím moderních metod informatiky). Předmět poskytne studentům informatiky a jiných nebiologických oborů nezbytné minimum znalostí pro pochopení základních biologických problémů, které se (nejlépe) řeší na počítači. Seznámí studenty s vybranými přístupy k řešení těchto problémů a upozorní na ty oblasti, kde náš pokrok nejvíce závisí na vhodných aplikacích informatiky. Pokročilejší studium vybraných algoritmů, práce s daty a navrhování vlastních výpočtů je náplní navazujících kurzů IV108 Bioinformatika II, IV110 a IV114 Projekt z bioinformatiky (a systémové biologie) a PB051 Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii. Kurz se bude konat jednou týdně po 2 hodinách s občasným delším cvičením, součástí je kontrolní test uprostřed semestru, ukončen bude písemnou zkouškou (v případě nutnosti zkoušet na dálku můžou být zkoušky i ústní nebo kombinované).

 

Kapitola obsahuje:
1
Odpovědník
4
PDF
1
Studijní text
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 7. 10. 2020 do 13. 10. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
Odpovědník
1
PDF
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 14. 10. 2020 do 20. 10. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
Odpovědník
2
PDF
1
Studijní text
9
Web
Učitel doporučuje studovat od 21. 10. 2020 do 27. 10. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
Kapitola obsahuje:
1
Odpovědník
2
PDF
1
Studijní text
1
Web
Učitel doporučuje studovat od 28. 10. 2020 do 3. 11. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
23
Web
Učitel doporučuje studovat od 4. 11. 2020 do 10. 11. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
1
Web
Kapitola obsahuje:
1
Odpovědník
2
PDF
1
Studijní text
5
Web
Učitel doporučuje studovat od 18. 11. 2020 do 24. 11. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 2. 11. 2020 do 9. 11. 2020.
Práce s expresními daty
Učitel doporučuje studovat od 2. 12. 2020 do 8. 12. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
Odpovědník
1
PDF
1
Studijní text
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 25. 11. 2020 do 1. 12. 2020.
Kapitola obsahuje:
1
Další soubory
1
PDF
2
Video
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 9. 12. 2020 do 15. 12. 2020.
Statistické metody v bioinformatice, systémová biologie
Učitel doporučuje studovat od 16. 12. 2020 do 22. 12. 2020.
Kapitola obsahuje:
3
Video
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 30. 12. 2020 do 5. 1. 2021.
Kapitola obsahuje:
5
Složka
3
Web
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
3
Web
Předchozí