Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Course
Term
Spring 2025

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty a anotacemi genomů.

Study now
Týden 1 - Úvod, sběr HOX sekvencí - 17/2/2025
Open
Chapter contains:
2
PDF
1
Study text
Teacher recommends to study now - from 17/2/2025 to 23/2/2025.
Týden 2 - Konstrukce dendrogramů a fylogenetických stromů - 24/2/2025
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 24/2/2025 to 2/3/2025.
Týden 3 - Vizualizace v kontextu genomu - 3/2/2025
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 3/3/2025 to 9/3/2025.
Týden 4 - Návrh PCR primerů - 10/3/2025
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 10/3/2025 to 16/3/2025.
Týden 5 - Mapování variace na strukturu proteinu - 17/3/2025
Open
Chapter contains:
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 17/3/2025 to 23/3/2025.
Týden 6 - Diskuse zadání hodnoceného úkolu a projektu, konec 1.části - 24/3/2025
Open
Chapter contains:
1
Study text
3
Web
Teacher recommends to study from 24/3/2025 to 30/3/2025.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Teacher recommends to study from 24/3/2025 to 30/3/2025.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Teacher recommends to study from 8/4/2025 to 14/4/2025.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Teacher recommends to study from 15/4/2025 to 22/4/2025.
Týden 10 - Modelování regulace genové exprese
Teacher recommends to study from 21/4/2025 to 5/5/2025.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Teacher recommends to study from 28/4/2025 to 16/5/2025.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Teacher recommends to study from 13/5/2025 to 19/5/2025.
Previous
Next
Operations
View all