Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Course
Term
Spring 2024

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty a anotacemi genomů.

Týden 1 - Úvod - 19/2/2024
Open
Chapter contains:
4
PDF
1
Study text
Teacher recommends to study from 19/2/2024 to 25/2/2024.
Týden 2 - Sběr a příprava sekvencí ZNF, zjišťování konsenzuální sekvence - 26/2/2024
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
1
Web
Teacher recommends to study from 26/2/2024 to 3/3/2024.
Týden 3 - hledání u rostlin, mapování výskytu v genomech, anotace genomu - 4/3/2024
Open
Chapter contains:
1
Study text
Teacher recommends to study from 11/3/2024 to 17/3/2024.
Týden 4 - mapování anotace na strukturu proteinu - 11/3/2024
Open
Chapter contains:
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 18/3/2024 to 24/3/2024.
Týden 5 - diskuse zadání hodnoceného úkolu a projektu, konec 1.části - 18/3/2024
Open
Chapter contains:
1
Study text
3
Web
Teacher recommends to study from 25/3/2024 to 31/3/2024.
Týden 6 - řešení projektu 25/3/2024
Open
Teacher recommends to study from 4/3/2024 to 10/3/2024.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
7
Web
Teacher recommends to study from 25/3/2024 to 31/3/2024.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Open
Chapter contains:
1
Other files
1
Study Materials
1
Study text
4
Web
Teacher recommends to study from 9/4/2024 to 15/4/2024.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
9
Web
Teacher recommends to study from 16/4/2024 to 23/4/2024.
Týden 10 - Modelování regulace genové exprese
Open
Chapter contains:
1
Image
1
PDF
1
Study text
3
Web
Teacher recommends to study from 22/4/2024 to 6/5/2024.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Open
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
2
Web
Teacher recommends to study from 29/4/2024 to 17/5/2024.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Open
Chapter contains:
1
Homework Vault
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
4
Web
Teacher recommends to study from 14/5/2024 to 20/5/2024.
Previous
Next