Interactive Syllabus

• https://www.npr.org/2024/09/25/nx-s1-5123633/23andme-is-in-trouble-what-happens-to-all-the-dna-data
  
• Denník N - rozhovor s dr.Cechovou https://dennikn.sk/3552798/prispela-k-precitaniu-ludskej-dna-buducnostou-liecby-je-personalizovana-medicina-vravi-bioinformaticka-cechova/?cst=bf810b0d123caeaafd425e723bb8428d6fc125203602fa7117f865d980122719
• HN o výzkumu Moniky Čechové: https://archiv.hn.cz/c7-67238760-16gkjs-46c1910f4f1858b
• https://www.the-scientist.com/news/lasker-award-for-revolutionizing-protein-structure-predictions-71386
• Po kompletne sekvenci lidskeho genomu CHM13 z konzorcia T2T, kteremu ale chybela sekvence chromozomu Y, se povedlo ziskat i tuto posledni chybejici referencni sekvenci. Vyznamny podil na tom mela i nase absolventka Monika Cechova: https://news.ucsc.edu/2023/08/t2t-y-chromosome.html ktera nekdy v roze 2010 absolvovala tento kurz :-)
• Debata o všetkých veciach "DNA"
  
• Prednáška kolegyne z Bratislavy: Bronislava Brejová
  
• Nova revolucni technika sekvenovani Light-seq umoznuje pod mikroskopem svetlem oznacit, co se ma sekvenovat
  
• Z historie nanoporoveho sekvenovani - popularni verze
  
• Z historie nanoporoveho sekvenovani - oficialni verze
  
• Ewan Birney  interview
• Designer babies paper
  
• Structural bioinformatics workshop (Nov 2022) ML and AI in structural biology
  
• EBI Online Bioinformatics Introductory courses
  
• Karel Berka: přednáška o AlphaFold2
  
• Dobré místo pro start s AlphaFold2
  
• The de-extinction of the woolly mammoth project
  
• Researchers uncover new families of gene-editing enzymes - The Scientist
• T2T consortium fills in the missing pieces of our genome. An interview with Karen Miga.
  
• Reflections on the 20th anniversary of sequencing the human genome by Craig Venter
  
• Milestones in Genomic sequencing  by Nature Milestones
  
• Dalsi pribeh mRNA vakcin
  
• Jak se vyvijela mRNA vakcina proti koronaviru
  
• Rozhovor s prof.Zhangem, autorem prvni sekvence SARS-CoV-2
  
• V lednu 2020 byla poprve zverejnena sekvence SARS-CoV-2
  
• News on DNA data storage
  
• New podcast from Cold Spring Harbor Laboratory
  
• Podívejte se na záznamy přednášek z brněnské akce Mendelovy dny
  
• 4.diskuzní online panel ke koronaviruna PřF UK v Praze (3.11.2020)
• Manolis Kellis o metodě CRISPR
  
• Vision Restored in Mice via Genetic Editing; Mozart's Music Stored in DNA; CRISPR Proteins Get Mini-fied & Bacteria Feed on Air
  
• Nobelova cena za chemii v roce 2020 za metodu editace genomů metodou Cas9/CRISPR
• CRISPR to the rescue: future treatment for thalassemia disorder? news
  
• Synthetic biology: autotrophic E.coli and original paper
  
• Quiz time: DNA
  
• Carl Zimmer: CRISPR
• Výborný doplněk k 2. a 3. týdnu přednášek: XBio
• 2018 Nobel Prize in Medicine (immunology and cancer)
• Nová technika sekvenování na cestě ke komerčnímu nasazení: Nanostring Hyb & Seq 
  
• Kuriozita: Central Dogma deals with the inability of genetic information to escape proteins
  
• Milníky molekulární biologie jako originální publikace https://twitter.com/Alexis_Verger/status/1044142656618745857
• Personal Genomics on TV http://www.cnbc.com/2015/12/10/unlocking-my-genome-was-it-worth-it.html
• Na přednášce jsem mluvil o prionech, jako "infekčních proteinech", další "infekční molekulou" jsou viroidy.
• Z historie sekvenování: http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/47153/title/DNA-Sequencing--From-Tedious-to-Automatic/
• "Kurz" bunkovej biologie v debate Slovenskej televizie so Setfanom Hribom "Pod Lampou". Hostom je kolega z Bratislavy Lubo Tomaska, ktory studuje hlavne kvasinky
• DNA Origami je tady! http://www.sciencedaily.com/releases/2011/04/110427131929.htm
• Human genome in print! http://www.bio-itworld.com/2012/12/28/encyclopedia-genomica-UK-scientists-print-book-of-life-in-130-volumes.html
• Odkaz na bioinformatickou literaturu v site.ebrary.com: https://ebookcentral.proquest.com/lib/masaryk-ebooks/search.action?query=bioinformatics
  
• New York Times píše o původu různých "-omik": http://www.nytimes.com/2012/05/04/science/it-started-with-genome-omes-proliferate-in-science.html?_r=1&ref=science
• Zajímavé přednášky o sekvenování DNA v medicíně a osobní genomice v podání Michaela Snydera: http://www.youtube.com/watch?v=pgHAXCMMcro a otázkách populační genomiky a syntetických organismů v podání Craiga Ventera: http://www.youtube.com/watch?v=AiZyHn_7SUI
• http://www.genomeweb.com/blog/what-energy-genomics Podivejte se na informacni video Joint Genome Institute, ktery patri pod Ministerstvo energetiky USA jestli Vas zajima co je to Energy Genomics. Jedna se o vyuziti sekvence DNA organizmu v energetickych programech pro nova biopaliva.
•  Odkaz z roku 2009: http://edition.cnn.com/2009/HEALTH/04/23/genome.ebay/index.html . Nejnovější zpráva z této oblasti aneb jak se liší genom celebrity od genomu obyčejného smrtelníka: http://investor.illumina.com/phoenix.zhtml?c=121127&p=irol-newsArticle&ID=1401402
• Nový směr v biologii/medicíně založen na zjišťování sekvence DNA a RNA celých populací mikrobů přináší zajímavé výsledky. Viz Human Microbiome Project (HMP, http://en.wikipedia.org/wiki/Human_Microbiome_Project), nebo  např. informaci z poslední konference HMP http://www.nature.com/news/2011/110420/full/news.2011.249.html, či zajímavý příspěvek na blogu New York Times http://opinionator.blogs.nytimes.com/2009/07/21/microbes-r-us/
• Video "Who are you?": http://www.youtube.com/watch?v=bI8KcyQ7NtI

 

Researchers Uncover New Families of Gene-Editing Enzymes