Do kategorie cystických lézí sleziny jsou řazeny:  pravé - (non)parazitární cysty, pseudocysty (posttraumatické), cystické nádory (lymfangiom, hemangiom).

Neparazitární cysty
Pravé cysty jsou v mnoha případech vrozené. Nemají maligní potenciál. Často bývají asymptomatické a bývají tak incidentálním nálezem na zobrazovacích metodách (UZ, CT). Klinicky se mohou projevit tlakem v břiše, bolestmi zad, levého ramene, nebo příznaky z útlaku okolních struktur. Vzhledem k benignímu charakteru tohoto typu cyst jsou operačně řešeny pouze symptomatické případy (splenektomie, marsupializace).

Parazitární cysty
Larvální stadium tasemnice rodu Echinococcus, která je endemitem, např. v Africe a Austrálii vyvolává  ve slezině (ale i játrech a plicích) tvorbu cyst. Tyto echinokokové cysty mají charakteristickou morfologii a CT obraz (s kalcifikací stěny). Echinokokové postižení sleziny je indikací ke splenektomii. Nezbytná je velmi opatrná peroperační manipulace pro riziko perioperační ruptury s rozvojem anafylaktického šoku a možné diseminace parazita po peritoneu (event. do mediastina). Peroperační sterilizace cysty je prováděna alkoholizací, nebo instilací 3% roztoku NaCl. Terapie bývá současně i farmakologická (antiparazitika).