Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Výpočetní metody v bioinformatice a systémové biologii
Info
Předmět
Období
jaro 2023

Předmět PB051 se přestavbou studia na FI rokem 2021 mění. Stává se na bakalářské úrovni praktickým doplněním k předmětu IV107 Bioinformatika I (1. polovina semestru) a PA052 Úvod do systémové biologie (2. polovina semestru).

Pokročilejší problémy řešené v bioinformatické části v minulých letech (např. profilové HMM) přechází do nového předmětu PV269, kde se rovněž probírá pokročilá práce s NGS daty, anotacemi genomů a proteinovými strukturami.

Týden 1 - Úvod - 13. 2. 2023
Přejít
Kapitola obsahuje:
4
PDF
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 13. 2. 2023 do 19. 2. 2023.
Týden 2 - Sběr a příprava sekvencí ZNF, hledání u rostlin, zjišťování konsenzuální sekvence - 20. 2. 2023
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
1
Web
Učitel doporučuje studovat od 20. 2. 2023 do 26. 2. 2023.
Týden 3 - mapování výskytu v genomech, anotace - 27. 2. 2023
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 6. 3. 2023 do 12. 3. 2023.
Týden 4 - mapování anotace na strukturu proteinu - 6. 3. 2023
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
1
Web
Učitel doporučuje studovat od 13. 3. 2023 do 19. 3. 2023.
Týden 5 - diskuse zadání hodnoceného úkolu, konec 1.části - 13. 3. 2023
Přejít
Kapitola obsahuje:
2
PDF
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 20. 3. 2023 do 26. 3. 2023.
Týden 6 - řešení projektu 20. 3. 2023
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
1
Web
Učitel doporučuje studovat od 27. 2. 2023 do 5. 3. 2023.
Týden 7 - Biologické sítě a genová ontologie
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Video
1
Studijní text
7
Web
Učitel doporučuje studovat od 20. 3. 2023 do 26. 3. 2023.
Týden 8 - Integrace dat prostřednictvím biologických sítí
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Další soubory
1
Studijní materiály
1
Studijní text
5
Web
Učitel doporučuje studovat od 27. 3. 2023 do 2. 4. 2023.
Týden 9 - Analýza genové exprese a integrace dat
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 17. 4. 2023 do 24. 4. 2023.
Týden 10 - Modelování regulace genové exprese
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Obrázek
1
PDF
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 17. 4. 2023 do 1. 5. 2023.
Týden 11 - Booleovské sítě - metody analýzy
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 24. 4. 2023 do 12. 5. 2023.
Týden 12 - Booleovské sítě s částečnou informací, motivy v sítích
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Odevzdávárna
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 9. 5. 2023 do 15. 5. 2023.
Předchozí
Následující