10 Neighbour-joining, maximálna parsimonia
Pred začatím hodiny vyplňte prosím Odpovědník. Obsahuje otázky na pochopenie pojmov z prednášok 07 až 09 za 6 bodov. Za nezodpovedanú otázku sa odrátavajú 2 body. Veľa zdaru!
Hypotéza: Rozdiely v echolokácii netopierov rodu Pipistrellus predstavujú rozdiely medzi kryptickými druhmi.
V učebných materiáloch môžete nájsť súbor NJ.xls, v ktorom sú nastavené výpočty NJ stromu z malého alignmentu z nekorigovaných p-vzdialedností. Meňte jednotlivé písmená alignmentu, aby ste videli, ako výpočet reaguje. Správne bude fungovať len vtedy, keď sa v prvej iterácii spoja sekvencie a,b.
Blahoželám Andree Janotovej, ktorá ako prvá získala plný počet bodov za prácu počas semestra!
Zadanie pre individuálny projekt do 30.11. Podrobné informácie v osnove pre prednášku 07. Vytvorenie hypotézy (4 body) a zostavenie datasetu pre Individuálne projekty (2 body) bude bodované namiesto jedného testu.