Průchod studijním plánem

Závěrečná státní doktorská zkouška má za cíl ověřit studentovy obecné znalosti oboru a osvojení vědeckých výzkumných metod. Student se může k této zkoušce přihlásit, pokud splnil všechny požadavky stanovené ve studijním plánu. Zkušební komise má minimálně pět členů, z nichž jeden je školitelem disertační práce a nejméně dva nejsou zaměstnanci Masarykovy university. Měsíc před zkouškou jsou studentovi stanovena tři různá témata, která si má předem prostudovat.
Příklady zadaných témat:
Regulace genové exprese Kvantitativní proteomika
Biochemické aspekty vzniku, progrese a terapie nádorů
Modulace proteinových funkcí posttranslační modifikací
Aplikace kapilární zónové elektroforézy pro studium enzymů
Biokonjugace (značení a imobilizace biomolekul)
Mechanismy oprav DNA Metody experimentálního studia transkripce
Produkce rekombinantních proteinů a jejich mutantních forem
Analýza interakce ligand-makromolekula
Supresory nádorů
Biochemie virové replikace
Molekulární mechanismy antivirových činidel
Biocompatibilní nanočástice
Zkouška má podobu hodinového rozhovoru mezi doktorandem a členy komise. Komise tajně hlasuje a oznamuje hodnocení bezprostředně po ukončení zkoušky. Student, který úspěšně absolvuje státní zkoušku, pak může postoupit k obhajobě disertační práce, která se koná ve stejný den nebo později. Kandidát předkládá práci, která zahrnuje původní a publikovaný výzkum, odpovídá obecně uznávaným normám a je schválena školitelem. Práce hodnotí dva nezávislí externí oponenti, kteří předkládají písemné posudky. Obhajoba je vedena jako veřejné zasedání s kandidátem, dvěma oponenty, školitelem a dalšími členy komise. Student na začátku shrne své výsledky (20 min), poté oponenti přečtou posudky, ve kterých formulují své otázky a názory na vědecký význam, metodiku a výsledky, a nakonec student zodpoví otázky položené oponenty, členy komise a dalšími přítomnými. Komise pak tajně hlasuje o výsledném hodnocení, které je oznámena studentovi

- Vědecko-výzkumná příprava (cca 70% studijní zátěže)

Nejrozsáhlejší část doktorského studia tvoří samostatná práce na doktorské disertaci a spolupráce v týmovém prostředí (mi. 25 hod týdně). Student je povinen pracovat na disertaci podle rozpisu v plánu schváleném školitelem. Student pravidelně shrnuje průběh své výzkumné práce v semestrových průběžných zprávách, které hodnotí školitel každý semestr a oborová rada jednou za rok. V 1.semestru se od studenta vyžaduje zpracování výzkumného projektu v rozsahu 20-40 stran ve vztahu ke zvolenému výzkumnému tématu. Tento projekt by měl zahrnovat literární přehled, výzkumnou hypotézu, cíle, navrhovanou metodiku a časový harmonogram. Každý doktorand by se měl aktivně účastnit minimálně jedné mezinárodní vědecké konference jako řečník nebo prezentující autor posteru. Očekává se, že se bude významně podílet na přípravě publikací s vlastními výsledky. Forma a obsah disertace jsou specifikovány v oddíle "Cíle kvalifikačních prací".

- Akademická příprava (cca 15 % studijní zátěže)

Akademická příprava doplňuje vědecko-výzkumnou práci tím, že poskytuje studentům teoretické zázemí a rozvíjí širší perspektivy vědeckého myšlení. Každý student musí absolvovat alespoň čtyři kurzy. Student se souhlasem svého školitele vybírá kurzy z těch, které nabízí PřF nebo další fakulty MU. Magisterské kurzy mohou být zapsány pouze tehdy, pokud nebyly součástí magisterského studijního programu studenta. Externí kurzy, které jsou kreditově hodnoceny a ukončeny zkouškou, jsou rovněž akceptovatelné po schválení oborovou radou. Výjimečně může být zahrnuto i samostatné literární studium specifických témat vztahujících se k disertační práci, která nejsou pokryta stávajícími kurzy, zakončené zkouškou, a považováno za ekvivalentní jednomu standardnímu kurzu.
Všichni doktorandi jsou povinni navštěvovat a aktivně se účastnit výzkumného semináře, který se koná jednou týdně na Ústavu biochemie a poskytuje fórum pro prezentace a diskusi o probíhajícím výzkumu. Na konci akademického roku své výsledky prezentují také na studentské konferenci.

- Jazykové dovednosti a mezinárodní konkurenceschopnost (cca 10% studijní zátěže)

Od studentů se očekává, že si zlepší své písemné a ústní komunikační dovednosti, aby se připravili na výzvy své profese v mezinárodním prostředí. Doktorand musí mít 15-20 minutovou veřejnou prezentaci v angličtině, následovanou diskusí s publikem. Studenti musí absolvovat povinný minimálně jednoměsíční studijní pobyt na jedné z partnerských univerzit nebo výzkumných ústavů v zahraničí.

- Rozvoj pedagogické způsobilosti (cca 5% studijní zátěže)

Program nabízí možnost získat praktické vzdělávací zkušenosti, které jim umožní osvojit si a rozvíjet pedagogické dovednosti. Povinná pedagogická praxe zahrnuje výpomoc v jednom jednosemestrovém laboratorním kurzu organizovaném Ústavem biochemie.

- Rozvoj přenositelných dovedností

Studenti jsou motivováni, aby sepsali a podali grantový návrh získání finančních prostředků buď z MU, nebo z externích zdrojů. V případě přijetí projektu přebírají odpovědnost za technickou realizaci, plánování a rozpočet.

Adámik, M. (2018) Interactions of p53 family proteins with biologically significant DNA quadruplexes https://is.muni.cz/auth/th/jcgrx/

Bartheldyová, E. (2018) Preparation of adjuvant nanoliposomal carriers for construction of recombinant vaccines https://is.muni.cz/auth/th/fqlwz/

Mrázková, J. (2018) Mutageneze proteinů vázajících sacharidy - účinný nástroj pro přípravu vysokoafinitních lektinů https://is.muni.cz/auth/th/wt9fy/

Schejbal, J. (2018) Study of beta-secretase reaction by modern electromigration methods https://is.muni.cz/auth/th/e2fi6/

Zouharová, D. (2018) Antiviral effect of synthetic derivatives of nucleotides and nucleosides against DNA and RNA viruses https://is.muni.cz/auth/th/nwi20/