LF:DSAN01 Analýza dat pro Neurovědy - Informace o předmětu
DSAN01 Analýza dat pro Neurovědy
Lékařská fakultajaro 2018
- Rozsah
- 2/0. 5 kr. Ukončení: k.
- Vyučující
- prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Eva Koriťáková, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Simona Littnerová, Ph.D. (cvičící) - Garance
- prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
Institut biostatistiky a analýz – Jiná pracoviště pro vzdělávací a vědecko-výzkumnou činnost – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Institut biostatistiky a analýz – Jiná pracoviště pro vzdělávací a vědecko-výzkumnou činnost – Lékařská fakulta - Předpoklady
- PROGRAM ( D - NE4 ) || PROGRAM ( D - NR4 ) || PROGRAM ( D - PC4 ) || PROGRAM ( D - RA4 )|| PROGRAM ( D - FA4 )
Bazální znalosti principů biostatistiky a analýzy dat. Výhodou je předchozí absolvování více teoreticky zaměřeného kurzu Analýza klinických dat. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 3/20, pouze zareg.: 0/20 - Mateřské obory/plány
- Bioetika (angl.) (program LF, D-BET) (2)
- Bioetika (program LF, D-BET) (2)
- Hematologie (angl.) (program LF, D-HEM) (2)
- Hematologie (program LF, D-HEM) (2)
- Lékařská farmakologie (angl.) (program LF, D-FA4) (2)
- Lékařská farmakologie (program LF, D-FA4) (2)
- Neurologie (angl.) (program LF, D-NR4) (2)
- Neurologie (program LF, D-NR4) (2)
- Neurovědy (angl.) (program LF, D-NE4) (2)
- Neurovědy (program LF, D-NE4) (2)
- Psychiatrie (angl.) (program LF, D-PC4) (2)
- Psychiatrie (program LF, D-PC4) (2)
- Radiologie - zobrazovací metody (angl.) (program LF, D-RA4) (2)
- Radiologie - zobrazovací metody (program LF, D-RA4) (2)
- Cíle předmětu
- V průběhu kurzu budou účastníci seznámeni s principy základních metod analýzy medicínských dat s ohledem na specifika datových souborů a výpočtů z oblasti neurovědního výzkumu. Důraz bude kladen především na správnou aplikaci těchto metod v praxi a na interpretaci dosažených výsledků. Probíraná teorie bude vždy následována praktickými příklady v systému STATISTICA, případně v jiných nástrojích, které jsou na Masarykově univerzitě volně dostupné.
- Osnova
- 1.Jak medicínská data správně popsat a vizualizovat: Typy medicínských dat a jejich vizualizace. Popisná sumarizace dat – průměr, medián, kvantily, rozptyl, směrodatná odchylka, intervaly spolehlivosti. Normální rozdělení a rozdělení od něj odvozená – Chí-kvadrát rozdělení, Studentovo t rozdělení, aj. Transformace dat – normalizace, standardizace, kategorizace.
- 2.Jak medicínská data správně testovat: Formulování hypotéz nad medicínskými daty – nulová a alternativní hypotéza. Hladina významnosti a síla testu, power analýza. p-hodnota. Vhodná volba typu testu v různých situacích. Jednovýběrové testy – z-test, jednovýběrový t-test, párový t-test.
- 3.Jak a kdy použít parametrické a neparametrické testy I.: Dvouvýběrový t-test. Neparametrické testy – Wilcoxonův test, Mannův-Whitneyův test aj. F-test.
- 4.Jak a kdy použít parametrické a neparametrické testy II.: Analýza rozptylu (ANOVA) a její předpoklady. Problém násobného testování hypotéz a použití korekčních procedur – Bonferonniho korekce, FDR. Správná aplikace těchto korekcí. Kruskalův-Wallisův test.
- 5.Jak analyzovat kategoriální a binární data I.: Analýza kontingenčních tabulek – Pearsonův chí-kvadrát test, Fisherův test, McNemarův test. Relativní riziko (relative risk) a poměr šancí (odds ratio). Binomické a Poissonovo rozdělení.
- 6.Jak analyzovat kategoriální a binární data II.: Hodnocení diagnostických testů – senzitivita, specificita, pozitivní a negativní prediktivní hodnota, věrohodnostní poměr. Příklady správného a nesprávného hodnocení diagnostické síly testu. Hledání diagnostického cut-off pomocí ROC křivek.
- 7.Jak hodnotit vztah spojitých proměnných a základy regresního modelování: Základy korelační analýzy – Pearsonův a Spearmanův korelační koeficient. Základy regresní analýzy – lineární regrese, odstranění vlivu kovariát.
- 8.Jak analyzovat přežití pacientů: Analýza přežití. Coxova regrese.
- Literatura
- Zar, J.H. (1998) Biostatistical analysis. London: Prentice Hall, 4th ed.
- HAVRÁNEK, Tomáš. Statistika pro biologické a lékařské vědy. 1. vyd. Praha: Academia, 1993, 476 s. ISBN 8020000801. info
- Benedík, J., Dušek, L. (1993) Sbírka příkladů z biostatistiky. Brno: Konvoj.
- Výukové metody
- Výuka je interaktivní, přímo založená na řešení konkrétních problémů a příkladů. Řešené příklady i teoretické podklady budou účastníkům k dispozici předem. Účastníci kurzu budou během prvního dne instruováni, aby si připravili k řešení své vlastní problémy s analýzou dat (PhD práce, SVOČ, výzkumné práce). Tyto vstupy budou postupně každý výukový blok rozebírány a případně i přímo řešeny.
- Metody hodnocení
- Předmět je ukončen kolokviem sestávajícím se z analýzy praktických příkladů na počítači.
- Informace učitele
- Kurz Analýza dat pro Neurovědy proběhne každý čtvrtek od 8. 3. 2018 do 26. 4. 2018 vždy od 15:00 do 18:00 v počítačové učebně IBA LF MU na Kamenici 126/3. Studijní materiály budou před každým blokem vystaveny v IS.MUNI a v průběhu výuky budou k dispozici i v tištěné podobě.
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
Poznámka k četnosti výuky: 8 dnů po 3 hod.
- Statistika zápisu (jaro 2018, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/med/jaro2018/DSAN01