Informace o předmětu

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.
Vyučováno kontaktně

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (cvičící)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Michal Vašina, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Bc. Alan Strunga (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)
PharmDr. Bc. Josef Mašek, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: St 9:00–10:50 C13/332, D. Kovář, Z. Prokop, M. Vašina
Bi7430c/02: St 14:00–15:50 C13/332, D. Kovář, Z. Prokop, M. Vašina

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci cvičení budou studenti znát řadu praktických postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních technologií při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek, vývoji rekombinantních terapeutik a vakcín. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky PřF MUNI a VÚVeL. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět slouží k posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• Pokročilé nástroje molekulární biologie
• Technologie proteinové exprese
• Mikrofluidika, laboratoř na čipu
• Systémy dodávání léků a rekombinantní vakcíny
• Vývoj rekombinantních proteinových terapeutik
• Enzymatický test pro stanovení polutantů životního prostředí
• Základy analýzy biochemických dat

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

Každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením cvičícího, zpracovává svůj vlastní vzorek nebo dataset.
Výsledky experimentů hodnotí v samostatném protokolu nebo formou eseje dle zadání jednotlivých cvičení.
Studenti ke každému tématu obdrží ELEKTRONICKÉ MATERIÁLY (např. metodiky, metodické články, video-tutoriály)

Metody hodnocení

Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů nebo esejí z jednotlivých cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Michal Vašina, Ph.D. (cvičící)
Ing. Jan Kotouček, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Bc. Alan Strunga (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: St 9:00–10:50 C13/332, D. Kovář, Z. Prokop, M. Vašina
Bi7430c/02: St 13:00–14:50 C13/332, D. Kovář, Z. Prokop, M. Vašina

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologické společnosti Enantis, NEXARS). Na konci cvičení budou studenti znát řadu praktických postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologické firmy Enantis, NEXARS). Studenti se seznámí s moderními metodami:

Design rekombinantních systémů

Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

Příprava enzymatického biosenzoru

Mikrofluidní systémy, laboratoře na čipu

Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

Příprava a transformace liposomů

Analýza liposomů

Osnova

• Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• Mikrofluidika, laboratoře na chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením cvičícího, zpracovává svůj vlastní vzorek.
Výsledky experimentů hodnotí v samostatném protokolu nebo formou eseje dle zadání jednotlivých cvičení.
Studenti ke každému tématu obdrží ELEKTRONICKÉ MATERIÁLY (např. metodiky, metodické články, video-tutoriály)

Metody hodnocení

Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů nebo esejí z jednotlivých cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Michal Vašina, Ph.D. (cvičící)
Ing. Jan Kotouček, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Bc. Alan Strunga (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Út 10:00–11:50 C13/208, D. Kovář, Z. Prokop, M. Vašina
Bi7430c/02: Út 14:00–15:50 C13/208, D. Kovář, Z. Prokop, M. Vašina

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologické společnosti Enantis, NEXARS). Na konci cvičení budou studenti znát řadu praktických postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologické firmy Enantis, NEXARS). Studenti se seznámí s moderními metodami:

Design rekombinantních systémů

Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

Příprava enzymatického biosenzoru

Mikrofluidní systémy, laboratoře na čipu

Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

Příprava a transformace liposomů

Analýza liposomů

Osnova

• Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• Mikrofluidika, laboratoře na chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením cvičícího, zpracovává svůj vlastní vzorek.
Výsledky experimentů hodnotí v samostatném protokolu nebo formou eseje dle zadání jednotlivých cvičení.
Studenti ke každému tématu obdrží ELEKTRONICKÉ MATERIÁLY (např. metodiky, metodické články, video-tutoriály)

Metody hodnocení

Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů nebo esejí z jednotlivých cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Michal Vašina, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
PharmDr. Josef Mašek, Ph.D. (cvičící)
Jana Škařupová, MSc. (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Út 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, D. Kovář, Z. Prokop
Bi7430c/02: Út 14:00–15:50 Kontaktujte učitele, D. Kovář, Z. Prokop

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologické společnosti Enantis, NEXARS). Na konci cvičení budou studenti znát řadu praktických postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologické firmy Enantis, NEXARS). Studenti se seznámí s moderními metodami:

Design rekombinantních systémů

Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

Příprava enzymatického biosenzoru

Mikrofluidní systémy, laboratoře na čipu

Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

Příprava a transformace liposomů

Analýza liposomů

Osnova

• Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• Mikrofluidika, laboratoře na chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením cvičícího, zpracovává svůj vlastní vzorek.
Výsledky experimentů hodnotí v samostatném protokolu nebo formou eseje dle zadání jednotlivých cvičení.
Studenti ke každému tématu obdrží ELEKTRONICKÉ MATERIÁLY (např. metodiky, metodické články, video-tutoriály)

Metody hodnocení

Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů nebo esejí z jednotlivých cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. Andrea Smith, PhD. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Michal Vašina, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Andrea Pařízková (cvičící)
PharmDr. Josef Mašek, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: St 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, D. Kovář, Z. Prokop, A. Smith
Bi7430c/02: St 14:00–15:50 Kontaktujte učitele, D. Kovář, Z. Prokop, A. Smith

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti znát řadu praktických postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje kombinaci praktických dovedností předávaných odborníky z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Studenti se seznámí s moderními metodami:

Design rekombinantních systémů

Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

Příprava enzymatického biosenzoru

Mikrofluidní systémy, laboratoře na čipu

Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

Příprava a transformace liposomů

Analýza liposomů

Osnova

• Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• Mikrofluidika, laboratoře na chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

ORGANIZACE DISTANČNÍ VÝUKY
s ohledem na pandemii Covid, pro období podzim 2020

Studenti ke každému tématu obdrží ELEKTRONICKÉ MATERIÁLY (např. metodiky, metodické články, video-tutoriály)

Po nastudování bude připraven KRÁTKÝ PÍSEMNÝ TEST prověřující orientaci v daném tématu.

Během semestru bude organizována ON-LINE DISKUSE (MS Teams) na aktualní či kontroverzní témata (např. gene editing, GMO).

Metody hodnocení

Hodnocení bude uděleno po splnění všech krátkých testů z jednotlivých temat a splnění aktivní účasti v on-line diskusi.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. Andrea Smith, PhD. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Michal Vašina, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Andrea Pařízková (cvičící)
PharmDr. Josef Mašek, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: St 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, Z. Prokop, A. Smith
Bi7430c/02: St 14:00–15:50 Kontaktujte učitele, Z. Prokop, A. Smith

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie. Absolvované kurzy Bi4020 Molekulární biologie a Bi4010 Základy molekulární biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Mikrobiologie (program PřF, N-MIK)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje studentům zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). V praktických cvičeních se student seznámí s moderními metodami:

Design rekombinantních systémů

Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

Příprava enzymatického biosenzoru

Mikrofluidní systémy, laboratoře na čipu

Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

Příprava a transformace liposomů

Analýza liposomů

Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• Mikrofluidika, laboratoře na chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením učitele. Každý student pracuje s vlastním vzorkem.

ORGANIZACE CVIČENÍ
1. Teoretický úvod (prezentace vyučujícího)
2. Úvod do vlastního cvičení a kontrola přípravy (domácí zadání)
3. Experimentální práce v laboratoři

Metody hodnocení

Výsledky experimentů jsou hodnoceny v samostatných esejích nebo protokolech připravených každým studentem samostatně a založených na vlastních výsledcích práce. Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast a vypracování protokolů a esejů z každého cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
Mgr. David Kovář, Ph.D. (cvičící)
Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA (cvičící)
doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Ing. Andrea Schenkmayerová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Martina Damborská (pomocník)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Po 17. 9. až Pá 14. 12. St 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, Z. Prokop, J. Turánek
Bi7430c/02: Po 17. 9. až Pá 14. 12. St 14:00–15:50 Kontaktujte učitele, Z. Prokop, J. Turánek

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie. Absolvované kurzy Bi4020 Molekulární biologie a Bi4010 Základy molekulární biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje studentům zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). V praktických cvičeních se student seznámí s moderními metodami:

Design rekombinantních systémů

Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

Příprava enzymatického biosenzoru

Příprava a testování mikrofluidního chipu

Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

Příprava a transformace liposomů

Analýza liposomů

Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• Příprava a testování mikrofluidního chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením učitele. Každý student pracuje s vlastním vzorkem.

ORGANIZACE CVIČENÍ
1. Teoretický úvod (prezentace vyučujícího)
2. Úvod do vlastního cvičení a kontrola přípravy (domácí zadání)
3. Experimentální práce v laboratoři

Metody hodnocení

Výsledky experimentů jsou hodnoceny v samostatných esejích nebo protokolech připravených každým studentem samostatně a založených na vlastních výsledcích práce. Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast a vypracování protokolů a esejů z každého cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
Mgr. Lukáš Chrást (cvičící)
Mgr. Veronika Lišková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Buryška, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Po 18. 9. až Pá 15. 12. St 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, L. Chrást, Z. Prokop, V. Štěpánková
Bi7430c/02: Po 18. 9. až Pá 15. 12. St 14:00–15:50 Kontaktujte učitele, L. Chrást, Z. Prokop, V. Štěpánková

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie. Absolvované kurzy Bi4020 Molekulární biologie a Bi4010 Základy molekulární biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Výstupy z učení

Cvičení poskytuje studentům zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). V praktických cvičeních se student seznámí s moderními metodami:

1. Design rekombinantních systémů

2. Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů

3. Příprava enzymatického biosenzoru

4. Příprava a testování mikrofluidního chipu

5. Biodegradace environmentálního polutantu rekombinantní bakterií

6. Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru

7. Příprava a transformace liposomů

8. Analýza liposomů

Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• 1. Design rekombinantních systémů
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• 2. Příprava a testování mikrofluidního chipu
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• 3. Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• 4. Příprava enzymatického biosenzoru
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• 5. Biodegradace environmentálního polutantu rekombinantní bakterií
• Náplň: inženýrství baktérií, syntetické metabolické dráhy, biodegradace environmentálních polutantů, analýza metabolitů
• 6. Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• 7. Příprava a transformace liposomů
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• 8. Analýza liposomů
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením učitele. Každý student pracuje s vlastním vzorkem.

ORGANIZACE CVIČENÍ
1. Teoretický úvod (prezentace vyučujícího)
2. Úvod do vlastního cvičení a kontrola přípravy (domácí zadání)
3. Experimentální práce v laboratoři

Metody hodnocení

Výsledky experimentů jsou hodnoceny v samostatných esejích nebo protokolech připravených každým studentem samostatně a založených na vlastních výsledcích práce. Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast a vypracování protokolů a esejů z každého cvičení.

Informace učitele

https://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/courses/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
Mgr. Lukáš Chrást (cvičící)
Mgr. Táňa Koudeláková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Buryška, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Po 19. 9. až Ne 18. 12. St 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, L. Chrást, Z. Prokop, J. Turánek
Bi7430c/02: Po 19. 9. až Ne 18. 12. St 14:00–15:50 Kontaktujte učitele, L. Chrást, Z. Prokop, J. Turánek

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie. Absolvované kurzy Bi4020 Molekulární biologie a Bi4010 Základy molekulární biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• 1. Design rekombinantních systémů
• Cvičící: Mgr. Táňa Koudeláková, Ph.D.
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• 2. Příprava a testování mikrofluidního chipu
• Cvičící: Mgr. Tomáš Buryška
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• 3. Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Cvičící: Mgr. Lukáš Chrást
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• 4. Příprava enzymatického biosenzoru
• Cvičící: Mgr. Šárka Bidmanová, Ph.D.
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• 5. Biodegradace environmnetálního polutantu rekombinantní bakterií
• Cvičící: Mgr. Lukáš Chrást
• Náplň: inženýrství baktérií, syntetické metabolické dráhy, biodegradace environmentálních polutantů, analýza metabolitů
• 6. Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Cvičící: Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D.
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• 7. Příprava a transformace liposomů
• Cvičící: RNDr. Jaroslav Turánek, CSc.
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• 8. Analýza liposomů
• Cvičící: RNDr. Jaroslav Turánek, CSc.
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením učitele. Každý student pracuje s vlastním vzorkem.

ORGANIZACE CVIČENÍ
1. Teoretický úvod (prezentace vyučujícího)
2. Úvod do vlastního cvičení a kontrola přípravy (domácí zadání)
3. Experimentální práce v laboratoři

Metody hodnocení

Výsledky experimentů jsou hodnoceny v samostatných esejích nebo protokolech připravených každým studentem samostatně a založených na vlastních výsledcích práce. Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast a vypracování protokolů a esejů z každého cvičení.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
Mgr. Lukáš Chrást (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Buryška, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Veronika Lišková, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: St 10:00–11:50 Kontaktujte učitele, P. Dvořák, Z. Prokop
Bi7430c/02: St 13:00–14:50 Kontaktujte učitele, P. Dvořák, Z. Prokop

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie. Absolvované kurzy Bi4020 Molekulární biologie a Bi4010 Základy molekulární biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• 1. Design rekombinantních systémů
• Cvičící: Koen Beerens, Ph.D.
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• 2. Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Cvičící: Mgr. Lukáš Chrást
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• 3. Příprava enzymatického biosenzoru
• Cvičící: Mgr. Šárka Bidmanová, Ph.D.
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• 4. Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Cvičící: Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D.
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• 5. Biodegradace environmnetálního polutantu rekombinantní bakterií
• Cvičící: Mgr. Pavel Dvořák
• Náplň: inženýrství baktérií, syntetické metabolické dráhy, biodegradace environmentálních polutantů, analýza metabolitů
• 6. Příprava a testování mikrofluidního chipu
• Cvičící: Mgr. Tomáš Buryška
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• 7. Příprava a transformace liposomů
• Cvičící: RNDr. Jaroslav Turánek, CSc.
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• 8. Analýza liposomů
• Cvičící: RNDr. Jaroslav Turánek, CSc.
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením učitele. Každý student pracuje s vlastním vzorkem.

ORGANIZACE CVIČENÍ
1. Teoretický úvod (prezentace vyučujícího)
2. Úvod do vlastního cvičení a kontrola přípravy (domácí zadání)
3. Experimentální práce v laboratoři

Metody hodnocení

Výsledky experimentů jsou hodnoceny v samostatných esejích nebo protokolech připravených každým studentem samostatně a založených na vlastních výsledcích práce. Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast a vypracování protokolů a esejů z každého cvičení.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
Koen Beerens, PhD. (cvičící)
Mgr. Lukáš Chrást (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Tomáš Buryška, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

St 15:00–16:50 C13/208

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie. Absolvované kurzy Bi4020 Molekulární biologie a Bi4010 Základy molekulární biologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Cvičení poskytuje zajímavou kombinaci praktických úloh řešených pod vedením odborníků z akademického (PřF MU a VÚVeL) i firemního prostředí (biotechnologická firma). Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, využití rekombinantních mikroorganismů a izolovaných enzymů při biosensingu a odstraňování nebezpečných látek nebo syntéze farmaceuticky čistých chemikálií. Kurz umožní studentům prohloubení jejich teoretických znalostí získaných na přednáškách Molekulární biotechnologie. Studenti se seznámí s aktuálně používanými metodami i s principem a obsluhou moderních laboratorních přístrojů. Předmět si klade rovněž za cíl posilování komunikační dovednosti studentů diskusí s odborníky daného oboru, napomůže i rozvoji stylistických dovedností studentů při samostatném vypracování esejí a protokolů z absolvovaného cvičení. Využití studijních materiálů v angličtině podpoří schopnost práce s odborným textem, včetně upevnění znalostí anglické terminologie užívané v tomto oboru.

Osnova

• 1. Design rekombinantních systémů
• Cvičící: Koen Beerens, Ph.D.
• Náplň: softwarový nástroj Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace
• 2. Fermentační kultivace rekombinantních mikroorganismů
• Cvičící: Mgr. Lukáš Chrást
• Náplň: fermentační kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, technologie EnBase
• 3. Příprava enzymatického biosenzoru
• Cvičící: Mgr. Šárka Bidmanová, Ph.D.
• Náplň: imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu
• 4. Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• Cvičící: Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D.
• Náplň: syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu
• 5. Biodegradace environmnetálního polutantu rekombinantní bakterií
• Cvičící: Mgr. Pavel Dvořák
• Náplň: inženýrství baktérií, syntetické metabolické dráhy, biodegradace environmentálních polutantů, analýza metabolitů
• 6. Příprava a testování mikrofluidního chipu
• Cvičící: Mgr. Tomáš Buryška
• Náplň: fabrikace PDMS chipu, příprava a mikroskopie mikrokapének, mikroskopie kapének s buňkami
• 7. Příprava a transformace liposomů
• Cvičící: RNDr. Jaroslav Turánek, CSc.
• Náplň: příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer
• 8. Analýza liposomů
• Cvičící: RNDr. Jaroslav Turánek, CSc.
• Náplň: analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením učitele. Každý student pracuje s vlastním vzorkem.

ORGANIZACE CVIČENÍ
1. Teoretický úvod (prezentace vyučujícího)
2. Úvod do vlastního cvičení a kontrola přípravy (domácí zadání)
3. Experimentální práce v laboratoři

Metody hodnocení

Výsledky experimentů jsou hodnoceny v samostatných esejích nebo protokolech připravených každým studentem samostatně a založených na vlastních výsledcích práce. Studenti získají kladné hodnocení za aktivní účast a vypracování protokolů a esejů z každého cvičení.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět již není vypisován.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Jaroslav Turánek, DSc. (cvičící)
Koen Beerens, PhD. (cvičící)
Mgr. Lukáš Chrást (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Veronika Štěpánková, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Hana Moskalíková (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 14:00–15:50 C03/208

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Souběžné navštěvování přednášek Bi7430c Molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci cvičení budou studenti prakticky ovládat řadu postupů molekulární biotechnologie, např. design primerů, štěpení DNA restrikčními enzymy, transformace bakteriálních buněk, metody fermentační kultivace E. coli, purifikace rekombinantních enzymů a jejich využití v biokatalýze a biosensingu.

Osnova

• BLOK A
• 1. Příprava a transformace liposomů
• (příprava liposomů, transformace liposomů, vysokotlaká extruze, příprava SUV (small unilamellar vesicels), měření s DLS (dynamic light scattering) a ZetaSizer)
• 2. Analýza liposomů
• (Single particle tracking analýza liposomů na přístroji Nanosight 500 a transmisní elektronovou mikroskopií)
• BLOK B
• 3. Příprava rekombinantní E. coli
• (Clone Manager, design primerů, restrikční štěpení, klonování, transformace)
• 4. Kultivace rekombinantní E. coli
• (kultivace E. coli a exprese rekombinantního proteinu, fermentace, UltraYield Flask, EnBase Technology)
• 5. Purifikace rekombinantního proteinu
• (desintegrace biomasy, purifikace rekombinantního enzymu, gelová elektroforéza)
• 6. Příprava biosenzoru
• (imobilizace rekombinantního enzymu a fluorescenční sondy na optický převodník, detekce vybraného analytu)
• 7. Biokatalytická příprava farmaceutického prekurzoru
• (syntéza farmaceutického prekurzoru s využitím rekombinantního enzymu)

Literatura

• An introduction to molecular biotechnology : fundamentals, methods, and applications. Edited by Michael Wink. 2nd, update ed. Weinheim: Wiley-Blackwell, 2011, xxxiii, 60. ISBN 9783527326372. info
• GLICK, Bernard R., Jack J. PASTERNAK a Cheryl L. PATTEN. Molecular biotechnology : principles and applications of recombinant DNA. 4th ed. Washington, D.C.: ASM Press, 2010, xvi, 1000. ISBN 9781555814984. info

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně nebo ve dvojicích pod vedením cvičícího, zpracovává svůj vlastní vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v samostatném protokolu (dle osnovy: úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Studenti získají kladné hodnocení praktika za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů z jednotlivých cvičení.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět již není vypisován.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Šárka Nevolová, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Lukáš Chrást (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v protokolu. Protokoly jsou vypracovávány ve formě posteru dle závazné osnovy (úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů (4 protokoly).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět již není vypisován.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Po 8:00–11:50 Bpb,02012, B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková
Bi7430c/02: Po 12:00–15:50 Bpb,02012, B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, N-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v protokolu. Protokoly jsou vypracovávány ve formě posteru dle závazné osnovy (úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů (4 protokoly).

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Po 8:00–11:50 Bpb,02012, B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková
Bi7430c/02: Po 12:00–15:50 Bpb,02012, B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v protokolu. Protokoly jsou vypracovávány ve formě posteru dle závazné osnovy (úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů (4 protokoly).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh seminárních/paralelních skupin

Bi7430c/01: Po 8:00–11:50 Bpb,02012, B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková
Bi7430c/02: Po 12:00–15:50 Bpb,02012, B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v protokolu. Protokoly jsou vypracovávány ve formě posteru dle závazné osnovy (úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů (4 protokoly).

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh

Čt 8:00–11:50 Bpb,02012

• Rozvrh seminárních/paralelních skupin:

Bi7430c/01: Rozvrh nebyl do ISu vložen. B. Rittich, A. Španová, M. Vojtíšková

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli nesoucích rekombinantní a nerekombinantní plasmidovou DNA pUC19. Mikroizolace nerekombinantní a rekombinantní plazmidové DNA, stanovení jejich velikostí a velikosti insertu. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou transformace. Výsev a selekce transformantů. Příprava digoxigeninem značené plazmidové DNA sondy, provedení DNA/DNA hybridizace (dot blot a Southern blot hybridizace) a imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení výsledků hybridizace. K praktiku patří přednášku Bi7430.
Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Metody hodnocení

Výuka ukončena zápočtem a testem.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh

Čt 8:00–11:50 Bpb,02012

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). Mikroizolace plazmidové DNA pU19. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. Výsev a selekce elektrotransformantů. Vyhodnocení elektrotransformace. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. Tečkové hybridizace. Southernův přenos. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).Imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení hybridizace.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19. 4. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). 5. Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. 6. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. 7. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. 8. Výsev a selekce elektrotransformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA. Vyhodnocení elektrotransformace. 9. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. 10. Tečková hybridizace. 11. Southernův přenos. 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci). 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů. 14. Vyhodnocení hybridizace.Zápočtový test. 15. Závěrečné vyhodnocení protokolů a testu.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.
• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh

Čt 8:00–11:50 Bpb,02012

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). Mikroizolace plazmidové DNA pU19. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. Výsev a selekce elektrotransformantů. Vyhodnocení elektrotransformace. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. Tečkové hybridizace. Southernův přenos. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).Imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení hybridizace.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19. 4. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). 5. Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. 6. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. 7. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. 8. Výsev a selekce elektrotransformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA. Vyhodnocení elektrotransformace. 9. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. 10. Tečková hybridizace. 11. Southernův přenos. 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci). 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů. 14. Vyhodnocení hybridizace.Zápočtový test. 15. Závěrečné vyhodnocení protokolů a testu.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.
• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh

Čt 8:00–11:50 Bpb,02012

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). Mikroizolace plazmidové DNA pU19. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. Výsev a selekce elektrotransformantů. Vyhodnocení elektrotransformace. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. Tečkové hybridizace. Southernův přenos. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).Imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení hybridizace.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19. 4. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). 5. Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. 6. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. 7. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. 8. Výsev a selekce elektrotransformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA. Vyhodnocení elektrotransformace. 9. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. 10. Tečková hybridizace. 11. Southernův přenos. 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci). 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů. 14. Vyhodnocení hybridizace.Zápočtový test. 15. Závěrečné vyhodnocení protokolů a testu.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.
• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Rozvrh

Čt 8:00–11:50 Bpb,02012

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). Mikroizolace plazmidové DNA pU19. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. Výsev a selekce elektrotransformantů. Vyhodnocení elektrotransformace. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. Tečkové hybridizace. Southernův přenos. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).Imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení hybridizace.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19. 4. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). 5. Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. 6. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. 7. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. 8. Výsev a selekce elektrotransformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA. Vyhodnocení elektrotransformace. 9. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. 10. Tečková hybridizace. 11. Southernův přenos. 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci). 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů. 14. Vyhodnocení hybridizace.Zápočtový test. 15. Závěrečné vyhodnocení protokolů a testu.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.
• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). Mikroizolace plazmidové DNA pU19. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. Výsev a selekce elektrotransformantů. Vyhodnocení elektrotransformace. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. Tečkové hybridizace. Southernův přenos. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).Imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení hybridizace.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19. 4. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). 5. Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. 6. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. 7. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. 8. Výsev a selekce elektrotransformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA. Vyhodnocení elektrotransformace. 9. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. 10. Tečková hybridizace. 11. Southernův přenos. 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci). 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů. 14. Vyhodnocení hybridizace.Zápočtový test. 15. Závěrečné vyhodnocení protokolů a testu.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.
• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v protokolu. Protokoly jsou vypracovávány ve formě posteru dle závazné osnovy (úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů (4 protokoly).

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )
Výuka je určena zájemcům o praktické zvládnutí vybraných postupů molekulární biotechnologie.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Každý student si v průběhu cvičení prakticky osvojí řadu postupů molekulární biotechnologie. Jedná se o metodu mikroizolace plasmidové DNA, stanovení velikosti insertu, metod transformace plasmidové DNA do bakteriálních buněk a selekce transformantů. V další části práce se prakticky seznámí s postupem přípravy DNA sondy a provedením DNA/DNA hybridizace a imunologické detekce hybridizačního produktu.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO.
• 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109, E. coli JM 109 (pUC19) a E. coli JM109 (pUC19::dim1) na selektivních a neselektivních mediích.
• 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19 a rekombinantní plastidové DNA pUC19::dim1.
• 4. Ověření izolace plasmidové DNA pomocí agarosové gelové elektroforézy.
• 5. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do kompetentních bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou chemické transformace.
• 6. Výsev a selekce transformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA.
• 7. Vyhodnocení výsledků transformace.
• 8. Štěpení plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI (linearizace) a BamHI.
• 9. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů pomocí agarózové gelové elektroforézy s využitím standardů lambda/HindIII.
• 10. Provedení Southernova přenosu. Příprava DNA pro tečková hybridizace.
• 11. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem.
• 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).
• 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů.
• 14. Vyhodnocení výsledků DNA/DNA hybridizace. Zápočtový test.

Literatura

• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.
• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.

Výukové metody

V laboratoři každý student pracuje samostatně a zpracovává svůj vzorek. Výsledky experimentů hodnotí v protokolu. Protokoly jsou vypracovávány ve formě posteru dle závazné osnovy (úvod, cíl práce, materiál a metody, výsledky, diskuse, závěr). V protokolu každý student popisuje, analyzuje, vyhodnocuje a diskutuje svoje výsledky.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen zápočtem, který studenti obdrží za aktivní účast ve cvičeních a za vypracování protokolů (4 protokoly).

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi7430c Molekulární biotechnologie - cvičení

Rozsah

0/4/0. 4 kr. Ukončení: z.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (cvičící)
doc. Ing. Bohuslav Rittich, CSc. (cvičící)
RNDr. Marie Vojtíšková, CSc. (cvičící), doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (zástupce)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Alena Španová, CSc.

Předpoklady

NOW( Bi7430 Molekulární biotechnologie )

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 12 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/12, pouze zareg.: 0/12, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/12
Jiné omezení: Přednost mají studenti specializace mikrobiologie.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, M-BI, směr Mikrobiologie)
• Obecná biologie (program PřF, N-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). Mikroizolace plazmidové DNA pU19. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. Výsev a selekce elektrotransformantů. Vyhodnocení elektrotransformace. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. Tečkové hybridizace. Southernův přenos. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci).Imunologická detekce hybridizačních produktů. Vyhodnocení hybridizace.

Osnova

• 1. Bezpečnost práce v molekulárně biotechnologické laboratoři. Práce s GMO. 2. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM 109 (pUC19). 3. Mikroizolace plazmidové DNA pU19. 4. Kultivace bakteriálních buněk E. coli JM109 (pUC19::dim1). 5. Izolace rekombinantní DNA pUC19::dim1. 6. Linearizace plazmidových DNA restrikční endonukleázou EcoRI. Gelová elektroforéza DNA a stanovení velikosti restrikčních fragmentů. 7. Přenos rekombinantní a nerekombinantní plazmidové DNA do bakteriálních buněk E. coli JM109 metodou elektrotransformace. 8. Výsev a selekce elektrotransformantů nesoucích rekombinantní a nerekombinantní DNA. Vyhodnocení elektrotransformace. 9. Příprava plazmidové DNA sondy - neradioaktivní značení digoxigeninem. 10. Tečková hybridizace. 11. Southernův přenos. 12. Provedení DNA/DNA hybridizace při vysoké přísnosti (stringenci). 13. Imunologická detekce hybridizačních produktů. 14. Vyhodnocení hybridizace.Zápočtový test. 15. Závěrečné vyhodnocení protokolů a testu.

Literatura

• G. C. Saunders, H. C. Parkers. Analytical Molecular Biology. RSC. Cambridge 1999.
• F. Sambrook, R.W. Russell Molecular Cloning. A Laboratory Manual. 3rd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2001.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (nejnovější)