Informace o předmětu

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 12:00–13:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 12:00–13:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 12:00–13:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Genetika a principy klasické a reverzní genetiky. Genetické názvosloví (mutantní organismy, genotypy, fenotypy). Genomy baktérií, archeí a eukaryontních mikroorganismů. Přenos genů mezi bakteriemi (konjugace, transdukce, transformace). Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů. Přirozená transformace a průnik DNA do buněk během transformace. Charakteristika restrikčně modifikačních systémů. Mobilní genetické elementy a transpozice. Regulace genové exprese u prokaryot (úrovně regulace, enzymová indukce a represe, katabolická represe, negativní a pozitivní regulace operonu, atenuace, klasifikace regulátorů). Nová éra v genetice – sekvencování genomů. Bioinformatika a proteomika.
Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena testem zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 10:00–11:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Osnova

• Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Literatura

• 1. Snyder L. and Champness W. (1997) Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. Washington, D.C. 2. Bruijn F.J., Lupski J.R. and Weinstock G.M. (1998) Bacterial Genomes. ITP Thomson Science.

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 13:00–14:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Osnova

• Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Literatura

• 1. Snyder L. and Champness W. (1997) Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. Washington, D.C. 2. Bruijn F.J., Lupski J.R. and Weinstock G.M. (1998) Bacterial Genomes. ITP Thomson Science.

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 8:00–9:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Osnova

• Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Literatura

• 1. Snyder L. and Champness W. (1997) Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. Washington, D.C. 2. Bruijn F.J., Lupski J.R. and Weinstock G.M. (1998) Bacterial Genomes. ITP Thomson Science.

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 15:00–16:50 Bpt,01013

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Domény Bakterie, Archea a Eukarya, jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy, univerzální fylogenetický strom. Mutace a isolace mutantů. Využití bakteriálních mutantů při testování mutagenů. Genetické názvosloví. Fenotypy nejčastěji používané v bakteriální genetice. Plasmidy a konjugace. Bakteriofágy a transdukce. Přirozená kompetence a transformace. Restrikce a modifikace DNA. Transpozony a transpozice.Sekvencování celých genomů a analýza sekvencí. Regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Zařazení mikroorganismů v živém systému - domény Bakterie, Archea a Eukarya. Universální fylogenetický strom dle Woese. Klasická genetická analýza. Reverzní genetika. Bioinformatika. Vlastnosti mikroorganismů vhodné pro genetické experimenty. Spontánní a indukované mutace. Využití bakteriálních mutantů při testování mutagenů. Genetické názvosloví. Fenotypy nejčastěji využívané v bakteriální genetice. Konjugace a konjugativní plasmidy. Mechanismus přenosu DNA během konjugace. Mobilizovatelné plasmidy. Vznik Hfr kmenů. Přenos chromosomální DNA a vznik transkonjugantů. Mapování genů na chromozomu s využitím Hfr krosů. F s čarou a R s čarou plasmidy. Bakteriofágy virulentní a temperované. Obecná transdukce. Navození lyzogenního stavu a lyze hostitelské buňky. Specializovaná transdukce. Genetická analýza fágů. Konstrukce genetické mapy. Pirozená transformace. Navození stavu kompetence. Průnik DNA do buněk během přirozené transformace. Restrikčně-modifikační systémy. Transpozice. IS elementy, složené transpozony, nesložené transpozony. Mechanismy transpozice. Sekvencování celých genomů a analýza sekvencí. Složení genomu archeona Methanococcus janaschii. Molekulární podstata adaptace na život v extrémních podmínkách. Regulace genomové exprese u prokaryot. Enzymová indukce. Enzymová represe. Katabolická represe. Laktózový operon a další operony E. coli. Další způsoby regulace genomové exprese. Atenuace. Protismyslná RNA. Regulace na úrovni translace.

Literatura

• Snyders L.S., Champness W. ed., Molecular Genetics of Bacteria, ASM Washington, 1997
• Rosypal S., Molekulární biologie, Díl čtvrtý, Brno, 2001
• Trun N., Trempy J., Fundamental Bacterial Genetics, Blackwell Publishing, UK, 2004

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Osnova

• Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Literatura

• 1. Snyder L. and Champness W. (1997) Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. Washington, D.C. 2. Bruijn F.J., Lupski J.R. and Weinstock G.M. (1998) Bacterial Genomes. ITP Thomson Science.

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Osnova

• Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Literatura

• 1. Snyder L. and Champness W. (1997) Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. Washington, D.C. 2. Bruijn F.J., Lupski J.R. and Weinstock G.M. (1998) Bacterial Genomes. ITP Thomson Science.

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2025 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2024 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2023 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2022 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2021 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2020 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2019 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2018 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2017 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2016 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2015 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2013 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Předmět se v období jaro 2012 nevypisuje.

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB)
• Speciální biologie (program PřF, B-EXB, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět není počínaje JS 2012 vypisován; obsahovou náhradou je Bi7120 Molekulární biologie prokaryot (v PS).

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o mechanismech přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z Molekulární biologie (Bi4020) a Obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Na konci kursu bude student schopen porozumět genetickému názvosloví a genetickým mapám, vysvětlit různé způsoby přirozeného přenosu genů mezi mikroorganismy a jejich význam a pochopit mechanismy regulace genové exprese u prokaryot.

Osnova

• Definice genetiky mikroorganismů. Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Genomy domén Baktérie, Archea a Eukarya. Klasická a reverzní genetika.
• Vlastnosti baktérií, které usnadňují genetickou analýzu. Genetické názvosloví.
• Mutace a izolace mutantů. Fenotypy používané v bakteriální genetice.
• Využití bakteriálních mutantů – Amesův test a SOS chromotest.
• Replikace, transkripce a translace genomu archeí.
• Přenos genů mezi mikroorganismy. Plasmidy, F plasmidy a mechanismus konjugace. Vznik Hfr kmenů a přenos chromosomálních genů.
• Přerušovaná a nepřerušovaná konjugace a konstrukce genetických map. F‘a R‘plasmidy, mobilizovatelné plasmidy. Obecná rekombinace při konjugaci.
• Virulentní a temperované bakteriofágy. Obecná transdukce. Bakteriofág lambda, jeho životní cyklus.
• Specializovaná transdukce. Fágové mutanty a konstrukce genetické mapy fágů.
• Přirozená transformace a její význam. Různé způsoby průniku DNA do kompetentních buněk během transformace. Restrikce a modifikace DNA, charakteristika restrikčně modifikačních systémů.
• Transpozice. IS elementy a transpozony, jejich struktura a význam při přenosu genů. Konjugativní transpozony.
• Regulace genové exprese u prokaryot. Úrovně regulace. Enzymová indukce, enzymová represe, katabolická represe. Negativní a pozitivní regulace operonu.
• Atenuace. Ostatní způsoby regulace genové exprese u baktérií. Klasifikace regulátorů.
• Nová éra v genetice – sekvencování. Bioinformatika a proteomika.

Literatura

• Rosypal, S. Introduction into molecular biology (Úvod do molekulární biologie). Brno : Prof. RNDr. Stanislav Rosypal, DrSc., Brno, 2006. 290 s. ISBN 80-902562-5-2.
• Trun N., Trempy J., Fundamentals Bacterial Genetics, Blackwell Science Ltd 2003, ISBN 978-0632044481

Výukové metody

Při výuce jsou používány prezentace na blanách a v Powerpointu. Dále jsou při vysvětlování problematiky využívány reálné experimentální výsledky analýzy.

Metody hodnocení

Předmět je ukončen testem a ústní zkouškou. Test obsahuje 50 otázek, na které student stručně písemně odpovídá. K ústní zkoušce postoupí každý student, který správně odpověděl 30 otázek. U ústní zkoušky dostane student 2 otázky. Celkový výsledek zkoušky je hodnocen zkoušejícím.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

Bi8021 Genetika mikroorganismů

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.

Vyučující

doc. RNDr. Alena Španová, CSc. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Alena Španová, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Předmět je určen pro studenty, kteří chtějí získat informace o genetické analýze mikroorganismů. Předpokladem je složení zkoušky z biochemie a molekulární biologie (Bi4020)a obecné mikrobiologie (Bi4090).

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

• Ekotoxikologie (program PřF, B-BI)
• Obecná biologie (program PřF, B-BI, směr Mikrobiologie)

Cíle předmětu

Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Osnova

• Význam bakteriální genetiky pro molekulární biologii. Baktérie, archea a eukaryontní mikroorganismy; jejich vlastnosti z hlediska genetické analýzy. Mutace a fenotypy používané v bakteriální genetice. Principy izolace mutantů. Charakterizace mutantů. Inzerční a transpoziční elemnety. Transpozonová mutageneze. Přenos genů u Gram negativních baktérií. Přenos genů u Gram pozitivních baktérií. Přenos genů u archeí. Charakterizace vybraných druhů baktérií a archeí.

Literatura

• 1. Snyder L. and Champness W. (1997) Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press. Washington, D.C. 2. Bruijn F.J., Lupski J.R. and Weinstock G.M. (1998) Bacterial Genomes. ITP Thomson Science.

Metody hodnocení

Výuka předmětu je ukončena zkouškou.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (nejnovější)