C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2008
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2007
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2006
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2005
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2004
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2003
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2002
Extent and Intensity
2/0/0. 3 credit(s). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2001
Extent and Intensity
2/0/0. 3 credit(s). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites
The preliminar knowledges of fundamentals of quantum mechanics and quantum chemistry given in fundamental lecture Quantum chemistry I, C4060 are supposed.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2000
Extent and Intensity
2/0/0. 3 credit(s). Type of Completion: zk (examination).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Chemistry Section – Faculty of Science
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
Syllabus
  • This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Language of instruction
Czech
Further comments (probably available only in Czech)
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
General note: v a.r.2000/01.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2025

The course is not taught in Spring 2025

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
In-person direct teaching
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2024

The course is not taught in Spring 2024

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2023

The course is not taught in Spring 2023

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2022

The course is not taught in Spring 2022

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2021

The course is not taught in Spring 2021

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2020

The course is not taught in Spring 2020

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2019

The course is not taught in Spring 2019

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
spring 2018

The course is not taught in spring 2018

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2017

The course is not taught in Spring 2017

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2016

The course is not taught in Spring 2016

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2015

The course is not taught in Spring 2015

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2014

The course is not taught in Spring 2014

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2013

The course is not taught in Spring 2013

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2012

The course is not taught in Spring 2012

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2011

The course is not taught in Spring 2011

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2010

The course is not taught in Spring 2010

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2009

The course is not taught in Spring 2009

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2008 - for the purpose of the accreditation
Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
spring 2012 - acreditation

The course is not taught in spring 2012 - acreditation

The information about the term spring 2012 - acreditation is not made public

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Supplier department: Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.

C6720 Quantum Organic Chemistry

Faculty of Science
Spring 2011 - only for the accreditation

The course is not taught in Spring 2011 - only for the accreditation

Extent and Intensity
2/0/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Recommended Type of Completion: zk (examination). Other types of completion: k (colloquium).
Teacher(s)
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc. (lecturer)
Guaranteed by
doc. RNDr. Pavel Janderka, CSc.
Department of Chemistry – Chemistry Section – Faculty of Science
Prerequisites (in Czech)
Pro úspěšné absolvování předmětu jsou předpokládány znalosti v rozsahu základní přednášky C4060 Kvantová chemie II.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
there are 11 fields of study the course is directly associated with, display
Course objectives
This lecture is an advanced lecture for students of organic chemistry. It extends the concepts developed in the elementary course of quantum chemistry particularly the theory of molecular orbitals and its application to organic chemistry. The key words of the lecture are following: MO theory of polyatomic molecules, HMO, Hartree-Fock approach, configuration interaction, advanced methods of MO on the semiempirical level, ab initio calculation, molecular modelling and the FF level. The practical calculations are included.
Syllabus
  • 1. Empirical method of MO, HMO method, molecules containing heteroatoms, use of HMO, molecular diagramms, population analysis, reactivity indexex.

    2. Perturbation theory, energy of localization energie.

    3. Extended Hueckel theory - EHT, Mulliken population analysis.

    4. Many-electron wave function - Slater's determinant. Overview of advanced methods of MO.

    5. Method of self-consistent field, SCF orbitals and equations. Hartree equations. Hartree-Fock equations, Roothan equations.

    6. Repulsion integrals, neglet of differtial overlap. PPP method of MO.

    7. Configuration interaction, LCI and SCFLCI methods.

    8. CNDO methods.

    9. INDO, MINDO, MNDO, AM1, PM3 methods and its approximations.

    10. Use of QM methods for investigation of molecular properties and reactivity and intermolecular interactions.

    11. Non-empirical methods (ab initio). Correlation energy.

    12. Density functional theory, Khon-Shamm principles.

    13. Computer aided molecular modelling. Molecular mechanics - MM.

Literature
  • ATKINS, Peter William and R. S. FRIEDMAN. Molecular quantum mechanics [Atkins, 1997]. 3rd ed. Oxford: Oxford University Press, 1997, xvii, 545. ISBN 0-19-855947-X. info
  • ATKINS, P. W. Quanta : a handbook of concepts. 2nd ed. Oxford: Oxford University Press, 1991, 434 s. ISBN 0198555725. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 1st pub. Essex: Longman, 1996, xvi, 595. ISBN 0582239338. info
  • LEACH, Andrew R. Molecular modelling : principles and applications. 2nd ed. Harlow: Prentice Hall, 2001, xxiii, 744. ISBN 0582382106. info
  • ČÁRSKY, Petr, Jiří PANCÍŘ and Rudolf ZAHRADNÍK. Molekulové orbitaly v chemii. 1. vyd. Praha: Academia, 1974, 140 s. info
Assessment methods (in Czech)
Výuka je organizována ve čtrnácti douhodinových blocích. Jejich obsah odpovídá členění sylabu. Dvouhodinové bloky jsou volně rozděleny na přednáškovou a praktickou část. V praktické části studenti provádějí s použitím výpočetní techniky pod operačními systémy MS DOS, MS Windows 98/2000 a UNIX(SGI) praktické příklady z oblasti modelování molekul, MM a QM. Je využíván software především graficky orientovaný, zejména Hyperchem, Winmopac a Spartan. Výsledky výpočtů jsou zpracovávány formou protokolů, jejichž zpracování a odevzdání je součástí kontrolní procedury.

Kolokvium je provedeno formou rozpravy. První část rozpravy je věnována kontrole požadovaných vědomostí v rozsahu sylabu a druhé části jsou diskutovány výsledky praktických cvičení deklarované v protokolech.

Přednáška navazuje na předmět C4060 Kvantová chemie I a je její nadstavbou. Její absolvování poskytuje především praktické vědomosti o možnostech využití aparátu teoretické strukturní chemie. Není však nutné pro zvládnutí požadavků ke státním závěrečným zkouškám z fyzikální chemie v této oblasti .
Language of instruction
Czech
Further Comments
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Spring 2008 - for the purpose of the accreditation, Spring 2000, Spring 2001, Spring 2002, Spring 2003, Spring 2004, Spring 2005, Spring 2006, Spring 2007, Spring 2008.
  • Enrolment Statistics (recent)